首页 期刊 生物信息学 FOXD3的空间结构和理化性质分析 【正文】

FOXD3的空间结构和理化性质分析

作者:刘畅; 刘安 长治医学院中心实验室; 山西长治046000; 山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室; 太原030001; 长治医学院附属和济医院骨科; 山西长治046000
foxd3   预后标志物   结构   相互作用蛋白   功能  

摘要:FOXD3(Forkhead box D3)作为一个有价值的肿瘤预后标志物,其抑癌机制和预后价值仍未被完全阐明。为了全面认识FOXD3,本研究利用生物信息学手段,对FOXD3蛋白的氨基酸序列同源性、理化性质、组织表达、亚细胞定位、空间结构及蛋白质相互作用网络进行了预测和分析。结果表明:人FOXD3蛋白是酸性不稳定的亲水蛋白,在进化过程中高度保守,无信号肽和跨膜区域,属于FH超家族。该蛋白定位于细胞核的可能性最大,主要二级结构为无规卷曲。经GO分析和KEGG通路分析可知,与FOXD3相互作用的蛋白主要是转录因子,参与调控细胞干性的蛋白质和调控肿瘤细胞特性的蛋白质。本文结果为进一步研究FOXD3的功能及抑癌机制提供一定的参考。

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