根据最新信息《Journal Of Molecular Modeling》期刊在JCR分区中的排名如下：
按JCI指标学科分区在学科为BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：，位于Q3区，排名207 / 328，百分位37BIOPHYSICS，收录子集：，位于Q2区，排名35 / 81，百分位57.4CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY，收录子集：，位于Q3区，排名127 / 250，百分位49.4COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：，位于Q3区，排名107 / 185，百分位42.4BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：，位于Q3区，排名178 / 328，百分位45.88BIOPHYSICS，收录子集：，位于Q3区，排名43 / 81，百分位47.53CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY，收录子集：，位于Q2区，排名104 / 251，百分位58.76COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：，位于Q3区，排名110 / 185，百分位40.81按JCI指标学科分区在学科为BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：，位于Q3区，排名214 / 320，百分位33.3BIOPHYSICS，收录子集：，位于Q3区，排名42 / 79，百分位47.5CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY，收录子集：，位于Q3区，排名123 / 239，百分位48.7COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：，位于Q3区，排名98 / 177，百分位44.9BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：，位于Q3区，排名212 / 321，百分位34.11BIOPHYSICS，收录子集：，位于Q3区，排名53 / 80，百分位34.38CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY，收录子集：，位于Q2区，排名108 / 241，百分位55.39COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：，位于Q3区，排名110 / 177，百分位38.14。
投稿咨询| 按JCI指标学科分区 | 收录子集 | 分区 | 排名 | 百分位 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q3 | 207 / 328 |
37 |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q2 | 35 / 81 |
57.4 |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q3 | 127 / 250 |
49.4 |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 107 / 185 |
42.4 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q3 | 178 / 328 |
45.88 |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 43 / 81 |
47.53 |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q2 | 104 / 251 |
58.76 |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 110 / 185 |
40.81 |
| 按JCI指标学科分区 | 收录子集 | 分区 | 排名 | 百分位 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q3 | 214 / 320 |
33.3 |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 42 / 79 |
47.5 |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q3 | 123 / 239 |
48.7 |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 98 / 177 |
44.9 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q3 | 212 / 321 |
34.11 |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 53 / 80 |
34.38 |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q2 | 108 / 241 |
55.39 |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 110 / 177 |
38.14 |
| 按JCI指标学科分区 | 收录子集 | 分区 | 排名 | 百分位 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q4 | 243 / 313 |
22.5 |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 52 / 77 |
33.1 |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q3 | 129 / 230 |
44.1 |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 101 / 169 |
40.5 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q4 | 246 / 313 |
21.57 |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 55 / 77 |
29.22 |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q2 | 115 / 231 |
50.43 |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 116 / 169 |
31.66 |
这表明该刊在生化与分子生物学领域具有较高的学术影响力和认可度。此外，该刊创刊时间：1995年，影响因子：2.9，出版周期：Irregular、出版商：Springer Berlin Heidelberg以及收录情况等信息也为其学术影响力提供了有力支持。
影响因子：是汤森路透(Thomson Reuters)出品的期刊引证报告(Journal Citation Reports,JCR)中的一项数据，现已成为国际上通用的期刊评价指标，不仅是一种测度期刊有用性和显示度的指标，而且也是测度期刊的学术水平，乃至论文质量的重要指标。
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