基因组蛋白质组与生物信息学报期刊影响因子为：0.66。
基因组蛋白质组与生物信息学报杂志国内刊号为：11-4926/Q，目前被CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)、知网收录(中)、维普收录(中)、万方收录(中)、CA 化学文摘(美)、SCI 科学引文索引(美)、JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)、Pж(AJ) 文摘杂志(俄)、哥白尼索引(波兰)、国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏等收录，获得过中国优秀期刊遴选数据库、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊等荣誉。
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