首页 期刊 家畜生态学报 鹿科与牛科动物IGF-1基因序列比较及分子进化分析 【正文】

鹿科与牛科动物IGF-1基因序列比较及分子进化分析

作者:宋兴超; 徐超; 王雷; 巴恒星; 王桂武; 杨福合 中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室; 吉林长春130112
鹿科   牛科   序列比较   密码子  

摘要:以GenBank中已登录的梅花鹿(Cervusnippon)、马鹿(Cervuselaphus)、普通牛(Bostaurus)、水牛(BubaluSbubalis)、山羊(Caprahircus)和绵羊(Ovisaries)胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因mRNA序列为研究材料,通过DNAStar7.0等生物信息学软件对6个物种的IGF-1基因进行序列比较及分子进化分析。结果表明:鹿科与牛科动物IGF-1基因编码区均为465bp,并且碱基组成表现为G〉C〉A〉T,且G+C含量高于A+T;6个物种IGF-1基因密码子第1位富含A,密码子第2位4种碱基的分布相对均匀,密码子的第3位碱基c含量较高;编码区碱基序列中共检测到20个变异位点,包括10个单一变异和10个简约变异,鹿科和牛科动物IGF-1基因核苷酸和氨基酸序列的相似性均较高;(4)NJ和UPGMA两种方法构建的分子进化树均把6个物种聚为2个大类:鹿科和牛科,其中牛科又分支出牛亚科和羊亚科两类。

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