首页 期刊 贵州大学学报·艺术版 DEV核衣壳蛋白二级结构与B细胞表位预测 【正文】

DEV核衣壳蛋白二级结构与B细胞表位预测

作者:代淑燕 程振涛 汪德生 文明 饲碧君 贵州大学动物科学学院 贵州贵阳550025 贵州大学动物疫病研究所 贵州贵阳550025
鸭肠炎病毒   核衣壳蛋白   二级结构   b细胞抗原表位  

摘要:为预测和分析鸭肠炎病毒NP蛋白的二级结构和B细胞表位,以DEV-NP基因推导的氨基酸序列为基础。采用Chou-Fasman法、Ganmier-Robson法和Karplus-Schulz法预测该蛋白二级结构;按Kyte—Doolittle方案、Emini方案和Jameson-Wolf方案预测其B细胞抗原表位。结果表明,DEV-NP蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的转角、无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋与β-折叠区段,且在蛋白肽链中有多个区段可形成B细胞抗原表位,其中第10—15和182—186区段及其附近可能是DEV-NP蛋白的B细胞表位优势区。

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