首页 期刊 竹子学报 梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析 【正文】

梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析

作者:王丽丽; 唐一; 黄艳; 曹颖; 胡尚连 西南科技大学植物细胞工程实验室; 四川绵阳621010; 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心; 四川绵阳6210
梁山慈竹   bbm基因   克隆   生物信息学   表达模式  

摘要:以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为Df BBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基。蛋白功能域预测分析表明,Df BBM基因含有AP2结构域,证明该基因确实属于AP2/ERF转录因子家族基因之一;进化树分析发现,Df BBM基因与玉米的BBM2以及山羊草和旱麦草的BBM基因在一个分支上,序列高度相似;保守结构域分析发现,Df BBM和Zm BBM2,Ae BBM1,Et BBM之间含有8个保守基序,这可能有助于研究Df BBM和其他物种BBM基因的相似功能。Df BBM的三级结构预测和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。组织表达分析表明,Df BBM基因在梁山慈竹展开叶和笋尖表达较高,Df BBM基因对ABA、IAA、NAA和Me JA激素处理均有响应,其中ABA、IAA和Me JA激素处理2 h后其表达量上升达到最高值,随后开始下降;而在NAA激素处理后其表达则明显下降。

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