首页 期刊 作物学报 甘蓝自交不亲和信号传导中SRK底物ARC1蛋白编码序列的克隆与分析 【正文】

甘蓝自交不亲和信号传导中SRK底物ARC1蛋白编码序列的克隆与分析

作者:刘东; 朱利泉; 王小佳 西南农业大学农学与生命科学学院生物化学实验室,重庆400716; 西南农业大学重庆市蔬菜重点实验室,重庆400716
甘蓝   自交不亲和性   信号传导   arc1蛋白   基因克隆  

摘要:以甘蓝自交不亲和系20010197的植株为材料,提取幼苗中的gDNA及花蕾期的柱头、子房、花瓣、叶片、根的mRNA,并对mRNA进行反转录合成cDNA,然后以gDNA与cDNA为模板扩增ARCl蛋白编码序列。结果表明只在gDNA与花期柱头mRNA的反转录cDNA中扩增出产物,而在其他组织中无任何产物。这可能说明甘蓝ARCl蛋白编码序列是在柱头特异性表达的。在甘蓝中克隆的ARCl Boler基因与GenBank中公布的油菜的ARCl基因序列的同源性为94%。其ARCl蛋白编码序列只有一个单一的开放阅读框,无内含子存在。甘蓝的/IRCl Boler基因编码的氨基酸序列与油菜和拟南芥的同源性分别为85%和52%。这说明ARCl基因的属间差异明显大于种间差异。此外,在ARCl Boler、ARCl和/ARCl At基因编码的蛋白质中均存在,Ubox结构和臂重复结构。Ubox结构均位于氨基酸序列的中间区域,这个区域有可能是蛋白质发生二聚化的区域。在ARCl Boler和ARCl基因编码的蛋白质C端存在5个臂重复区段,而在ARCl At基因编码的蛋白质中只有1个。这种差异的存在,也可能是ARC At与ARCl Boler和ARCl功能不同的根本原因。而在甘蓝和油菜中ARCl蛋白的C端区域有可能是ARCl蛋白的保守结构域。

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