首页 期刊 浙江农业学报 青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析 【正文】

青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析

作者:程亮 青海省农林科学院植物保护研究所; 青海省农业有害生物综合治理重点实验室; 青海西宁810016; 青海大学; 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室; 青海西宁810016
马铃薯y病毒   cp基因   序列分析   最大似然法   青海  

摘要:马铃薯Y病毒(PVY)是危害我国马铃薯的主要病毒之一,其在自然条件下极易发生基因变异而产生株系分化现象。为揭示青海马铃薯Y病毒分离物cp基因的分子变异,利用RT-PCR方法扩增获得了16个马铃薯Y病毒分离物的cp基因序列,采用SDT、DANMAN、RDP和MEGA软件对其进行分子变异分析。序列一致率结果表明,16个分离物的核苷酸序列均为801个碱基,一致率为98.0%~100%,编码267个氨基酸,一致率为94.8%~100%。重组分析表明,16个分离物未发生基因重组。系统发育分析发现,11个分离物与PVY^N-Wi株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVY^N-Wi株系的亲缘关系最近,占被检出病毒分离物的68.7%;另外5个分离物与PVY^O株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVY^O株系亲缘关系最近;未发现PVY^C株系、PVY^N株系、PVY^E株系和PVY^NTN株系存在。

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