首页 期刊 中华实验和临床病毒学 辽宁地区汉坦病毒分离株的基因分型 【正文】

辽宁地区汉坦病毒分离株的基因分型

作者:董雪; 张永振; 李欣; 赵常智; 王冰 110031; 沈阳市疾病预防控制中心微生物检验科; 中国疾病预防控制中心传染病控制所出血热室
汉坦病毒   基因分型   m片段   亚型   分离株  

摘要:目的分离辽宁地区汉坦病毒并对分离株(SY 13)进行基因分型,以查清辽宁地区汉坦病毒流行株的基因型和基因亚型.方法采用组织细胞培养法分离汉坦病毒;用RT-PCR法分别扩增SY 13的M片段G1、G2区和S片段;采用邻位相连法,通过DNA Star、Clustalx、Phylip等序列分析软件分别对3个基因片段的序列与从GenBank下载的序列进行同源性分析,并构建种系发生树.结果通过对3个基因片段进行比较分析,SY 13与HTN型同源性较高,为79.3%~97.0%;通过M片段G2区的比较分析,SY 13与BAO 10、BAO 14、JIANG 13、BAO 9、Q 33处于同一分支,同源性为95.0%~97.0%.结论辽宁地区汉坦病毒SY 13株与黑龙江地区分离株属同一亚型,为HTN型病毒中的H4亚型.

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