SRA数据库架构及二代测序数据共享

作者：李瑞华; 田国祥; 郭晓娟; 李豹; 张军; 吕军西安交通大学第一附属医院肿瘤外科; 西安710061; 西安交通大学医学部公共卫生学院; 西安710061; 解放军总医院第七医学中心干四科; 北京100700; 西安交通大学第一附属医院神经内科; 西安710061; 西安交通大学第一附属医院临床研究中心; 西安710061

sra数据库二代测序数据提取

摘要：近年来,随着二代测序技术的迅猛发展,高通量测序数据也呈指数级增长,SRA(Sequence Read Archive)数据库是用于存储这些二代测序原始数据和比对信息的代表性数据库。SRA数据库建立至今,各项测序数据迅速累积,已囊括多个物种、多种应用,成为大规模二代测序数据库及高效率的测序数据存储、提取及共享的平台。该数据库目前持续更新并面向公众开放。本文将介绍SRA数据库的网站架构及测序原始数据提取方法。