首页 期刊 中国畜牧兽医 京海黄鸡中HOXC10基因表达规律及其生物信息学分析 【正文】

京海黄鸡中HOXC10基因表达规律及其生物信息学分析

作者:张向前; 董新龙; 凌姣姣; 韩昆鹏; 张涛; 王金玉; 王永娟 扬州大学动物科学与技术学院; 扬州225009; 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室; 扬州225009; 江苏京海集团; 南通226103
hoxc10基因   京海黄鸡   组织表达分析   生物信息学  

摘要:同源异型盒基因(homeobox genes,HOX)是在酵母乃至人类等几乎所有的真核细胞中均表达的一类基因。为了探究HOXC10基因表达规律及其生物信息学,采用qRT-PCR方法研究HOXC10基因在8周龄京海黄鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、腿肌、下丘脑和卵巢组织中的表达规律,检测其在300日龄高、低产组卵巢组织的表达差异,并通过多种在线软件对原鸡HOXC10基因进行生物信息学分析。结果显示,HOXC10基因在京海黄鸡腿肌中表达丰度极显著高于其他组织(P〈0.01),且300日龄高产组中HOXC10基因表达丰度显著低于低产组(P〈0.05)。原鸡HOXC10基因序列与火鸡、野鸽、绿头鸭、人、小鼠、牛、猪、山羊及非洲爪蟾的同源性分别为77.4%、94.8%、98.6%、68.3%、67.9%、66.0%、59.0%、68.1%和79.4%;HOXC10基因共编码354个氨基酸,其中丝氨酸的含量最高,潜在的磷酸化位点有24个,在280~342的氨基酸序列内存在一个同源结构域,蛋白质亚细胞主要定位在细胞核中,且不包含跨膜结构。HOXC10基因在京海黄鸡生长和繁殖的基因调控网络中发挥了重要作用。

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