首页 期刊 中国卫生统计 贝叶斯统计分析的新工具- Stan 【正文】

贝叶斯统计分析的新工具- Stan

作者:刘晋; 汪秀琴; 李天萍; 徐文华; 陈峰 南京医科大学第一附属医院临床研究院; 210029; 南京医科大学第一附属医院国家药物临床试验机构办公室; 南京医科大学公共卫生学院生物统计学系
贝叶斯统计   bugs   stan  

摘要:目的鉴于国内研究者熟悉的贝叶斯统计软件WinBUGS已停止更新,OpenBUGS已见介绍,本文介绍国外新近出现的贝叶斯统计软件Stan的基本原理与实际使用。方法由于Stan安装具有其自身特点且较为复杂,本文首先介绍Windows平台下Stan安装与使用方法,接着介绍Stan语言及运行步骤,最后以线性-正态层次模型为例介绍Stan的应用。结果 Stan作为一种新型贝叶斯统计软件,使用了全新的汉密尔顿蒙托卡罗(Hamiltonian Monte Carlo,HMC)抽样方法,可以处理GIBBS抽样难以收敛的复杂多元层次模型。Stan使用的概率模型定义语言,相比较BUGS,逻辑清晰,程序更易理解。结论 Stan功能强大,应用方便,是贝叶斯分析的有力工具。

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