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应用下一代测序技术进行HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可结果情况分析

董丽娜; 赵烁贤; 王芳; 章伟; 何吉; 朱发明 浙江省血液中心; 浙江杭州310052; 浙江省血液安全研究重点实验室; 浙江杭州310052
  • 下一代测序法  
  • 模棱两可  
  • 测序分析  

目的统计分析NGS法进行HLA-A、HM-B基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例。方法对369例浙江省脐带血库标本采用NGS法检测HLA-A、HLA-B位点,并同步对其中94例标本采用PCR-SBT测序法测定HLA-A、HL4-B位点,余下275例标本采用PCR-SS0流式磁珠法检测。使用专业软件指定NGS法的HLA-A、HL4-B分型结果,直接计算法分析模棱两可组合比例。结果所有标本NGS法检测结果与PCR-SBT法或PCR-SSO法相符合,未发现NGS法遗漏等位基因情况。NGS法以HLA-A.HLA-B命名*后第四区域的数字作为高分辨水平统计,369例有34例标本出现模棱两可结果,占9.21%(34/369),其中只有2例标本HLA-A、HLA-B位点同时存在模棱两可结果。HLA-4位点有9例标本存在模棱两可结果,表现出8种类型;HLA-B位点有27例,25种类型,分别占标本总数的2.44%(9/369)、7.32%(27/369)。结论应用NGS技术仍有少量HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可组合结果。

  • CLSI EP12-A2和EP15-A2在磁微粒化学发光法肺炎支原体IgM抗体检测试剂性能评估中的应用

    作者:崔宁华; 杨俊梅; 刘倩倩 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

  • 检测血清同型半胱氨酸、B型脑钠肽及甲状腺激素水平在急性心肌梗死患者中的临床价值

    作者:王伟; 李静; 王亚丽; 杨晶 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

  • 气相色谱-质谱测定黄酒中的敌敌畏

    作者:李进义; 闵国平; 方云波; 胡玮; 董阳 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

    目的建立气相色谱-质谱(GC-MS)测定黄酒中敌敌畏的检测方法。方法同时优化了液液萃取和固相萃取2种前处理方法,液液萃取法称取40 g样品加4 ml甲苯萃取,振摇后加5 g NaCl,5 000 r/min离心5 min,有机相进GC-MS选择离子模式检测分析。固相萃取选用C18柱,经5 ml甲醇、5 ml水活化,称取10 g黄酒上样,过柱后用5 ml水淋洗,2 ml乙酸乙酯洗脱,45℃氮气吹至...

  • 北京市丰台区2016年-2017年肠道病毒A71型基因特征分析

    作者:郑金梅; 尉秀霞; 王兆娥; 余红; 武晶; 封会茹 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

    目的分析北京市丰台区2016年-2017年肠道病毒A组71型(EVA71)分离株VP1区的基因特征,为手足口病的防治提供参考。方法用荧光定量RT-PCR法对2016年-2017年丰台区手足口病患者咽拭子标本进行EVA71核酸检测和病毒分离,分离到的毒株进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定和分析。结果2016年-2017年共分离到26株EVA71。核昔酸序列分析发现,26株E...

  • 双扩增法和real-time RT-PCR法检测手足口病的比较

    作者:马静; 马蓓蓓; 李清元; 周攀; 黄英 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

    目的开展双扩增法和real-time RT-PCR法检测手足口病的比较性研究,为基层实验室建立手足口病科学快速检测方法提供依据。方法对2016年-2017年宜昌市9县市区采集的205份手足口病患者的咽拭子样本,同时采用双扩增法和real-time RT-PCR法检测手足口病通用病毒、CoxA16、EV71,比较2种方法检测结果的差异,对2种方法检测结果相异的标本进行测序。结果...

  • 阴沟肠杆菌头抱菌素酶耐药基因分析

    作者:宋银丹 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

    目的通过检测本院阴沟肠杆菌临床抗生素耐药率,了解产头抱菌素酶(AmpC酶)的阴沟肠杆菌分子流行病情况。方法纸片扩散法检测本院分离的189株阴沟肠杆菌细菌耐药,选取头抱西丁耐药的菌株行经典Hodge法鉴定产Ampc酶菌株,PCR扩增阳性菌株Ampc酶基因。结果189株阴沟肠杆菌主要来源于呼吸内科、神经内科和重症医学科等科室,药敏结果显示对头抱类抗生素...

  • BRAF V600E突变检测在甲状腺乳头状癌中的临床价值

    作者:毛达峰; 高国生; 刘芳 期刊:《中国卫生检验》 2019年第16期

  • 单侧和双侧卵巢子宫内膜异位症抗苗勒管激素水平及与年龄变化的关系

    作者:王桂业; 陈琼; 陈新宇; 谢奇朋 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

  • 浦东新区市售海产品中副溶血性弧菌的半定量风险评估

    作者:邵祥龙; 胡卉; 邬天凤; 王筱; 沈惠平; 柏品清 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

    目的了解浦东新区市售海产品中副溶血性弧菌的污染水平,并预测居民因食用海产品由副溶血性弧菌导致的发病概率。方法按照CAC推荐的风险评估步骤,利用Risk Ranger软件对海产品中副溶血性弧菌进行半定量风险评估和风险分级。结果浦东新区市售海产品中副溶血性弧菌的检出率为28. 8%(195/678)。居民每人每天因摄入鱼类、虾类和贝类由副溶血性弧菌导...

  • 气相色谱-质谱联用法测定香水类化妆品中的甲醇

    作者:翟宇; 尚博扬; 黄青 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

    目的建立测定香水类化妆品中甲醇的气相色谱-质谱联用法。方法采用Agilent DB-WAX毛细管色谱柱(30 m×0. 25 mm,0. 25μm),程序升温法,即初始温度为50℃,保持5 min,以15℃/min的速率升温至200℃,保持3 min,选择离子监测模式,用甲醇的保留时间和特征离子定性,外标法峰面积定量,定量离子m/z 31,参考离子m/z 32和29。样品加无水乙醇溶解、定容,涡旋混...

  • 4-氨基安替吡啉分光光度法测定饮用水中挥发酚的改进

    作者:刘志明 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

    目的改进饮用水中挥发酚的4-氨基安替吡啉(4-AAP)分光光度测定方法。方法以无色过硫酸铵溶液代替铁氰化钾溶液作氧化剂,在p H值为10. 0±0. 2的缓冲溶液中,用经乙醇和乙醚(1+9)混合溶液提纯的4-AAP作显色剂,三氯甲烷萃取测定饮用水中挥发酚。结果使用乙醇和乙醚(1+9)混合溶液提纯4-AAP,4-AAP损失较少,纯度较高,提纯后的4-AAP置干燥器内保存,可有...

  • 儿童喘息性疾病院内获得性感染的病原菌特点及危险因素分析

    作者:黄丽娜; 姜毅; 张宇; 叶龙; 管敏昌 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

  • 显色法检测非发酵菌对阿米卡星、哌拉西林他唑巴坦、多黏菌素B的敏感性

    作者:冯煦; 方娟; 马冰 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

    目的评估显色法检测非发酵菌对几种抗生素的药敏结果的可行性。方法采用刃天青显色法检测非发酵菌对抗菌药物阿米卡星、哌拉西林他唑巴坦、多黏菌素B的MIC值,同时选择微量肉汤法作为金标准进行评价,探讨了应用该方法的可行性。结果刃天青的适宜试验浓度为10μg/ml~20μg/ml。所测124株临床菌株,阿米卡星:EA结果为100%,CA结果为100%。哌拉西林他唑...

  • 摩根摩根菌的临床分布及碳青霉烯类药物敏感性分析

    作者:夏冰; 郭远瑜 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

    目的探讨摩根摩根菌临床分布及其对抗菌药物的体外敏感性,为临床预防和合理治疗感染提供参考。方法回顾性分析2007年1月-2017年12月分离的摩根摩根菌及其耐药性。结果从痰液、尿液、血液等标本共分离出143株;占前3位的是尿液32株(22. 4%)、痰液28株(19. 6%)、分泌物/脓液24株(16. 8%);科室前3位的是内科38株(26. 6%)、外科32株(22. 4%)、泌尿科2...

  • 围产期孕妇B族链球菌感染状况及耐药性分析

    作者:金海萍; 陈正雯; 王凯 期刊:《中国卫生检验》 2019年第14期

中国卫生检验

统计源期刊 审稿

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