摘要：目的：分析基层卫生综合改革重点联系区县基层医疗卫生机构的运营效率和全要素生产效率变动趋势。方法：利用2013-2015年重点联系区县卫生计生统计年报数据，分析基层医师日均担负门急诊人次数和住院床日数的年增长率，以及每个职工管理慢性病患者（高血压和糖尿病患者）和65岁及以上老年人口的年增长率；运用DEA—BCC模型分析总技术效率。运用Malmquist指数分析其全要素生产率及其分解因素的变化。结果：2013—2015年重点联系区县基层医师日均担负门急诊人次数和住院床日数分别以4．3％和0．5％速度递增，职工年平均管理慢性病患者人数、65岁及以上老年人数分别以0．8％和-4.3％速度递增；2015年，48．3％区县的社区卫生服务机构和63．0％区县的乡镇卫生院处于相对有效的运行状态。与2014年相比。机制体制改革力度大的区县，其基层医疗卫生机构运营有效、全要素生产效率呈增长趋势。整体上，2013—2015年社区卫生服务机构和乡镇卫生院全要素生产率平均下降了5．2％和1．0％。结论：部分重点联系区县基层医疗卫生机构的全要素生产效率有待提高，需要补足技术短板和继续完善基层卫生综合改革，提高整体运营效率。

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