首页 期刊 中国老年学 一株临床耐药菌高通量测序数据的深度挖掘 【正文】

一株临床耐药菌高通量测序数据的深度挖掘

作者:傅行礼; 郑学明; 解冰; 刘永平; 高玉华; 吴晓蓉; 孔德华 江苏大学医学部; 江苏镇江212001; 镇江市丹徒区中医院; 南京市高淳人民医院
临床致病菌   高通量测序   致病机制   耐药机制   深度挖掘  

摘要:目的通过分析一株临床耐药菌高通量测序的数据,探讨从二代测序原始数据中挖掘提取有用信息的流程。方法综合利用主流生物信息学软件,筛选可能和耐药有关的突变位点。结果通过对基因组测序数据的处理和从头组装,得到该菌株基因组的基本特征、进化关系及可能和抗药性有关的突变位点。结论随着高通量测序技术的发展,临床分离出的致病菌的测序已经成了常规的研究技术。通过对测序数据的深度挖掘,将为临床研究致病菌的致病和耐药机制提供更有价值的线索。

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