首页 期刊 中国老年学 miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤中的表达与靶基因验证 【正文】

miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤中的表达与靶基因验证

作者:杨晋生; 方军超; 张峰 河南科技大学临床医学院河南科技大学第一附属医院神经外科; 河南洛阳471003
多形性胶质母细胞瘤   靶基因   生物信息学  

摘要:目的探索miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤(GBM)患者中的表达水平,预测和验证miR-139-5p的靶基因。方法利用实时定量PCR检测GBM患者和对照组脑组织中miR-139-5p的相对表达水平。选择star Base在线工具预测miR-139-5p的靶基因,通过Target Scan数据库分析miR-139-5p与靶基因的结合位点,并采用萤光素酶报告实验验证。检索miRPathDB数据库分析miR-139-5p靶基因显著富集的pathways,运用miRTarget Link工具构建miR-139-5p与其靶基因之间的交互网络。结果相对于对照组,miR-139-5p在GBM患者脑组织中的表达水平显著下调。star Base预测工具取交集后得到8个靶基因,其中真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)为miR-139-5p靶基因之一。萤光素酶报告实验表明EIF4G2基因3’UTR区中含有明确的miR-139-5p结合位点。pathway富集分析发现靶基因显著富集于胰岛素样生长因子(IGF)-1信号通路、神经营养因子通路、趋化因子通路、T细胞受体通路、Ras信号通路和转化生长因子(TGF)-β信号通路等。结论 miR-139-5p在GBM患者中低表达,可能通过抑制靶基因EIF4G2表达参与肿瘤发生相关的过程。

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