摘要：目的了解淮安市啮齿动物携带正汉城病毒(Seoul orthohantavirus,SEOV)的分布特点及SEOV的种群遗传多样性特征,为肾综合征出血热防治提供科学依据。方法用夹夜法采集啮齿动物,提取肺组织RNA,采用PCR法扩增SEOV的S基因,对S基因序列进行系统进化及遗传多样性分析。结果在淮安市捕获鼠类4种125只,褐家鼠(Rattus norvegicus)为优势鼠种,构成比为62.4%。褐家鼠携带的SEOV(XuyiRn43、XuyiRn68)S基因片段的核苷酸序列同源性为98.1%,推导的氨基酸序列同源性为97.5%,与江苏省赣榆株(GanyuRn20、GanyuRn66及GanyuRn137)的核苷酸序列同源性为98.4%~98.7%,推导的氨基酸序列同源性为96.7%~99.2%。系统进化分析显示淮安市褐家鼠携带的SEOV的基因亚型为S1型,有2个单倍型。结论褐家鼠为淮安市优势鼠种,携带的SEOV为S1基因亚型。

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