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深圳口岸首例入境人员HIV-1毒株近似全基因序列的测定与分析

作者:刘胜牙 朱玉兰 甄胜西 古莉冰 刘春芳 李微 董瑞玲 刁慕言 张树平 陈琳 深圳国际旅行卫生保健中心 广东深圳518033 深圳市疾病预防控制中心
艾滋病病毒   全基因   出入境人员   基因序列   分析  

摘要:目的获得深圳口岸首例入境人员HIV-1亚型毒株全长基因组序列并分析其特征。方法以深圳出入境检验检疫局HIV确证实验室确证的1例HIV感染者为研究对象,提取病毒RNA,利用逆转录巢式RT-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,应用生物信息学软件对全基因序列进行系统进化分析。结果获得了8 831 bp长度的近全长基因组序列,系统进化树分析结果显示该毒株与HIV-1 CRF01_AE亚型参考株成簇,Bootstrap值为100%,通过与世界上不同国家和地区流行的HIV-1 CRF01_AE亚型毒株比较,该毒株与泰国流行毒株的关系最近。结论该毒株是由境外传入的,应对入境人员HIV感染毒株的来源和变异进行密切监测。

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