摘要：目的探讨慢性乙型肝炎（chronic heptitis B,CHB）患者干扰素-α（IFN-α）治疗早期乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）的适应性进化。方法对16例进入免疫清除期的慢性乙型肝炎患者进行IFN-α抗病毒治疗,治疗12周有6例取得完全病毒学应答,3例部分病毒学应答,7例无应答。分别采集治疗前和治疗12周的患者血清,提取HBV DNA后扩增HBV全基因组,进行分子克隆后测序,对病毒基因组4个开放读码框进行适应性进化分析,并研究适应性进化与IFN-α抗病毒效果的关系。结果用最大似然法分别检测治疗前后3组患者HBV基因组的正选择位点,一共检测到28个密码子位点。治疗前无应答组检测到的正选择位点（16个）多于完全应答组（9个）和部分应答组（8个）,治疗12周部分应答组和无应答组的正选择位点数量减少。对检测到的正选择位点进行抗原表位定位,发现28个正选择位点中有18个位于已知的抗原表位区。治疗后新出现的正选择位点S-ORF188位密码子位点、P-ORF 213位密码子位点以及部分应答组和无应答组治疗12周都未消失的正选择位点X-ORF144位密码子位点突变可能与干扰素应答不良相关。结论慢性乙型肝炎免疫清除期各个基因都存在适应性进化,且检测到的正选择位点大部分位于免疫表位区。HBV基因组的正选择作用可能与氨基酸突变病毒逃逸宿主免疫应答有关,SORF188位密码子位点、P-ORF213位密码子位点以及X-ORF 144位密码子突变可能与干扰素-α治疗早期应答不佳相关。

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