首页 期刊 渔业科学进展 WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析 【正文】

WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析

作者:刘庆慧; 黄倢; 韩文君 中国水产科学研究院; 黄海水产研究所; 青岛; 266071
wssv   密码子   偏爱性  

摘要:运用EMBOSS(The European Molecular Biology Open Software Suite) 的CHIPS(Condon Heterozygosity in a Protein Coding Sequence)和CUSP( Create a condon usage table)程序对WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析,分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,WSSV-vp37、WSSV-vp39及WSSV-vp19的Nc(Effective number of condons)值为49.897、48.640、46.868.3种蛋白的编码密码子使用频率有较大的差异,其在大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,分析结果表明,WSSV-vp37和WSSV-vp39的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而WSSV-vp19的密码子与原核和真核生物酵母相差较大.

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

学术咨询 免费咨询 杂志订阅