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组学时代下机器学习方法在临床决策支持中的应用

作者：赵学彤; 杨亚东; 渠鸿竹; 方向东 刊期：2018年第09期

随着组学技术的不断发展,对于不同层次和类型的生物数据的获取方法日益成熟。在疾病诊治过程中会产生大量数据,通过机器学习等人工智能方法解析复杂、多维、多尺度的疾病大数据,构建临床决策支持工具,辅助医生寻找快速且有效的疾病诊疗方案是非常必要的。在此过程中,机器学习等人工智能方法的选择显得尤为重要。基于此,本文首先从类型和算法角度...

第二届全国高校基因组学课程研讨会隆重召开

刊期：2018年第09期

2018年8月7日至8日,由中国遗传学会和西安交通大学医学部联合举办的“第二届全国高校基因组学课程研讨会”在陕西省西安市隆重召开。会议由中国科学院院士杨焕明担任主席,来自中国科学院北京基因组研究所、南开大学、华中科技大学、厦门大学、东南大学、西南大学、西安交通大学、西北大学、南京医科大学、华南理工大学、内蒙古大学、重庆邮电大...

机器学习方法在CRISPR/Cas9系统中的应用

作者：张桂珊; 杨勇; 张灵敏; 戴宪华 刊期：2018年第09期

基于CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组定点编辑技术,已被广泛应用于基因编辑和基因表达调控等研究领域。如何提高该技术对基因组编辑的效率与特异性、最大限度降低脱靶风险一直是该领域的难点。近年来,机器学习为解决CRISPR/Cas9系统所面临的问题提供了新思路,基于机器学习的CRISPR/Cas9系统已逐渐成为研究热点。本文阐述了CRISPR/Cas9的作用...

MicroRNA参与调控睾丸支持细胞的增殖与粘附功能

作者：夏蒙蒙; 申雪沂; 牛长敏; 夏静; 孙红亚; 郑英 刊期：2018年第09期

精子发生过程需要生精细胞及睾丸体细胞的共同参与,这两种细胞也决定着睾丸的发育及雄性生育力。支持细胞是生精小管中唯一的体细胞,在正常精子发生过程中发挥重要的作用。支持细胞增殖与粘附功能的异常将导致精子发生异常,进而引发雄性不育。近年来研究发现,microRNA(miRNA)可调控支持细胞的增殖与粘附功能,其表达水平在激素、内分泌干扰素和营...

Krüppel样因子在肌肉组织中的功能研究进展

作者：庄兆辉; 仲永; 陈月婵; 张志威 刊期：2018年第09期

Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是一类C-末端含有3个C2H2锌指结构的转录因子,N-末端为转录调控结构域,能够结合多种特异蛋白质,介导转录调控。目前在人体基因组中共发现18种KLFs,它们在多种类型人类细胞的分化、表型维持和生理功能调控中发挥重要作用。多个KLFs参与了对人和动物的心肌、平滑肌和骨骼肌的发育和功能的调控。在心肌中,...

RNA干扰猪NHEJ通路修复因子对HR效率的影响

作者：全绒; 李国玲; 莫健新; 钟翠丽; 李紫聪; 顾婷; 郑恩琴; 刘德武; 蔡更元; 吴珍芳; 张献伟 刊期：2018年第09期

Lnc-RAP3对小鼠3T3-L1前脂肪细胞分化的影响

作者：李欢; 冯晋川; 李贵林; 王讯; 李明洲; 刘海峰 刊期：2018年第09期

玉米逆境响应相关转录因子ZmC2H2-1基因克隆及功能验证

作者：汪德州; 莫晓婷; 张霞; 徐妙云; 赵军; 王磊 刊期：2018年第09期

玉米是我国第一大作物,提高玉米的抗逆性是玉米育种的重要目标性状之一。植物C2H2型锌指蛋白广泛参与植物各个时期的生长发育及逆境应答过程。本研究从玉米中分离了转录因子ZmC2H2-1基因并对其功能进行了初步研究。结果表明,ZmC2H2-1属于C2H2锌指蛋白转录因子家族,编码蛋白主要位于细胞核中,酵母自激活实验表明ZmC2H2-1不具有自激活活性;干旱、...

第全国植物基因组学大会成功召开

刊期：2018年第09期

第全国植物基因组学大会于2018年8月19-22日在四川成都成功召开。大会由中国遗传学会植物遗传与基因组学专业委员会主办,四川农业大学和中国科学院遗传与发育生物学研究所承办。大会主席为张启发院士、执行主席为杨维才研究员、秘书长为李平教授。来自国内外162所高校和科研院所以及19个企业的1100余名代表参会。在为期三天的会议中,与会代表就...

染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用

作者：彭继苹; 袁海明 刊期：2018年第09期

染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)是一种通过对染色体进行全基因组扫描来筛查染色体数目和结构异常的检测技术,是儿科和产前遗传诊断的常规工具,已被应用于流产病因分析。本研究应用CMA技术在全基因组水平分析引起流产的染色体异常情况,并评估该技术在临床流产中的应用价值。对收集的2600例流产样本进行CMA技术检测,成功...

bZIP73:影响粳稻耐低温的关键基因

作者：刘次桃; 区树俊; 储成才 刊期：2018年第09期

水稻(Oryza sativa L.)是最主要的粮食作物之一,全球种植面积约1.6亿公顷,养活了世界约35亿人口。缘于水稻起源于亚热带地区,因此对低温非常敏感。世界上约1500万公顷的稻区(包括24个国家,如中国、日本和朝鲜等)遭遇过严重的冷害问题。冷害是高纬度高海拔稻区水稻生长发育的主要限制因素之一,我国稻区南北分布相差约34度(最北端漠河53°27′N,最...