首页 期刊 西北农业学报 小麦RPD3/HDA1基因家族的全基因组鉴定及其对热胁迫的响应 【正文】

小麦RPD3/HDA1基因家族的全基因组鉴定及其对热胁迫的响应

作者:郑文杰; 党仁美; 丁宁; 刘媛媛; 闻珊珊 西北农林科技大学农学院; 陕西杨凌712100
小麦   全基因组鉴定   热胁迫   实时荧光定量pcr  

摘要:RPD3/HDA1是组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDACs)家族中最大的亚族,已知的HDAC家族基因在拟南芥、水稻等植物的生长发育和非生物胁迫方面都发挥着重要作用,但小麦中对HDACs的研究却较少。为探究小麦中RPD3/HDA1家族基因对热胁迫的响应,本试验利用生物信息学方法,从小麦全基因组中鉴定出36个小麦RPD3/HDA1基因,并对其基因结构、进化关系、顺式作用元件和热胁迫下的表达模式进行分析。结果表明:除3A和4A外,其余小麦染色体均含有该家族基因,其基因结构中外显子和内含子的数目差异明显。该小麦家族基因在不同组织和不同逆境胁迫中存在差异表达,TaHDAC-Ⅱ-3a、TaHDAC-Ⅱ-3b和TaHDAC-Ⅱ-3d在叶片中的表达量明显高于其他组织,TaHDAC-Ⅰ-2d、TaHDAC-Ⅰ-2a和TaHDAC-Ⅰ-2b在热胁迫后表达量有明显上调。进一步研究发现,不同基因在同一生育时期的热胁迫下响应不同,同一基因在不同生育时期对热胁迫的响应也不同,并且相对于35℃而言,多数基因对42℃胁迫响应更显著。这些结果对寻找小麦RPD3/HDA1家族候选耐热基因具有重要的参考价值。

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