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微生物组学研究的“淘金时代”

作者：胡永飞 刊期：2019年第09期

人体及动物肠道中生存着数量庞大的共生微生物;这些微生物无时无刻不参与着宿主的生命活动。揭示这些共生微生物在宿主体内的变化规律、与宿主之间的依存和博弈关系等,将使人类更加全面的认知高等生物体的生命本质。本专刊从肠道微生物与疾病、肠道微生物群落结构、肠道微生物与宿主互作、肠道微生物资源和肠道微生物研究方法5个层面展示了我国...

糖尿病及糖尿病心血管并发症患者肠道菌群的特征

作者：陈茜; 薛勇; 宋晓峰; 朱宝利 刊期：2019年第09期

健康藏族与汉族大学生肠道细菌多样性研究

作者：刘怡萱; 曹鹏熙; 马红梅; 刘星 刊期：2019年第09期

【目的】探究生活在相同环境下,同年龄段健康藏族人群和汉族人群肠道细菌组成的多样性特征及其可能的成因。【方法】入选同专业的20–24 岁男性健康藏族学生和汉族学生各20 名,同一时间段收集新鲜粪便,提取新鲜粪便细菌总DNA,通过高通量测序和生物信息学分析,结合对饮食习惯的问卷调查,研究健康藏族学生与汉族学生肠道细菌多样性与饮食习惯之间...

基于16S rRNA 基因高通量测序研究狞猫肠道微生物多样性

作者：陈磊; 刘咪; 沙未来; 高迎; 陈佳欣; 朱静 刊期：2019年第09期

【目的】研究狞猫肠道微生物多样性特征。【方法】对7只健康成年野生狞猫(2只雄性,5只雌性;2只来自济南野生动物园,5只来自威海野生动物园)粪便微生物16S rRNA基因V3–V4区进行高通量测序,对狞猫肠道微生物多样性进行研究。【结果】7只狞猫共获得肠道微生物16S rRNA基因V3–V4区有效序列1458741条,平均208392条,序列平均长度433 bp。通过以97%的...

低蛋白质日粮对断奶仔猪生长相关激素和肠道微生物区系的影响

作者：虞德夫; 朱晓峰; 冯江银; 康翠翠; 张明钰; 朱伟云; 杭苏琴 刊期：2019年第09期

基于高通量测序的不同虫态洋虫内共生微生物群落分析

作者：王长文; 房柳; 梁运江; 黄世臣; 董微巍 刊期：2019年第09期

【目的】为分析不同虫态下洋虫内共生微生物菌群组成情况,以成虫和幼虫两种虫态为研究对象。【方法】通过对洋虫内共生微生物提取及高通量测序分析,获得不同样品中微生物组成结构及变化情况。【结果】不同虫态下,随着生长发育的进行,洋虫体内细菌在丰度和多样性两个方面都有很大变化,成虫中的菌群数量相对较少,多样性较幼虫也明显降低。在几种特...

强化玉米饮食对小鼠肠道菌群结构和功能的影响

作者：郑帅; 朴春梅; 张芝; 刘婷婷; 王吉静; 王绿娅; 杜杰; * 刊期：2019年第09期

【目的】采用高通量测序方法研究强化玉米饮食对小鼠肠道菌群结构的影响以及可提高宿主糖代谢相关菌群功能基因的分析。【方法】分别给予两组小鼠(各10只)常规饮食和强化玉米饮食(1/4的玉米粉加3/4的常规饮食成分),喂养10周,之后采集小鼠粪便样本,提取DNA,使用高通量测序仪进行宏基因组测序分析,比较两组小鼠肠道菌群和功能基因的差异。【结果】...

猎豹(Acinonyx jubatus)肠道微生物多样性及其性别差异研究

作者：陈磊; 刘咪; 朱静; 高迎; 陈佳欣; 沙未来 刊期：2019年第09期

【目的】探讨猎豹(Acinonyx jubatus)肠道微生物多样性特征。【方法】通过采集新鲜粪便样品,对9只健康成年野生猎豹(4只雄性,5只雌性)的肠道微生物16S rRNA基因V3–V4区进行高通量测序,对猎豹肠道微生物多样性进行研究。【结果】测序共获得肠道微生物16S rRNA基因V3–V4区有效序列599349条,序列平均长度405 bp。通过以97%的序列相似性进行分类,...

微生物-肠-脑轴的研究进展

作者：高侃; 慕春龙; 朱伟云 刊期：2019年第09期

肠道微生物群能够调节宿主肠道稳态,同时参与调节宿主神经系统功能和行为。肠道菌群失调可能导致宿主神经系统功能障碍,从而引发神经退行性疾病。因此,研究微生物在肠-脑轴中发挥的作用及其机制,靶向调控肠道微生物菌群结构和功能,将为神经系统疾病的诊断与治疗提供新的手段。近年来,有关肠道微生物与机体神经系统间的互作研究受到了广泛关注,然...

中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的microRNA应答分析

作者：杜宇; 童新宇; 周丁丁; 陈大福; 熊翠玲; 郑燕珍; 徐国钧; 王海朋; 陈华枝; 郭意龙; 隆琦; 郭睿 刊期：2019年第09期

【目的】蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)是一种能够侵染中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)幼虫的致死性真菌病原。微小RNA(microRNA,miRNA)可通过在转录后水平靶向抑制或降解mRNA而参与宿主与病原互作过程。本研究旨在对球囊菌胁迫的中蜂6日龄幼虫肠道的差异表达miRNA(DEmiRNA)及其靶基因进行深入分析,进而揭示DEmiRNA在中蜂响应...

一株猪肠道Lactobacillus animalis LGM对结肠炎小鼠Th细胞分化转录因子基因表达的影响

作者：程颍州; 慕春龙; 朱伟云 刊期：2019年第09期

人体肠道分节丝状菌SFB 研究进展

作者：陈华海; 吴柳; 唐成; 王欣; 尹业师 刊期：2019年第09期

动物实验研究表明,肠道分节丝状菌(segmented filamentous bacteria,SFB)是一种革兰氏染色阳性梭菌;具有物种选择性定殖特性,主要定殖在回肠末端上皮细胞表面;具有调节宿主免疫系统成熟,刺激Th17细胞特异性分化和促进肠道表面免疫球蛋白A(sIgA)分泌等功能;在防御病原微生物感染和诱发自身免疫性疾病发生发展等方面发挥重要作用。虽然在众多脊椎...

罗伊氏乳杆菌肠道分离株的遗传多样性研究

作者：余中节; 赵洁; 宋宇琴; 孙志宏 刊期：2019年第09期

动物体内定殖着丰富且多样的细菌,其对宿主的健康发挥着举足轻重的作用。罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)是存在于动物肠道中的益生菌,是研究肠道菌群与宿主进化关系的模式菌种。【目的】以下载自NCBI的分离自猪、家禽类、人类、啮齿类动物的116株L.reuteri和分离自内蒙古锡林郭勒牛、羊和马肠道中的16株L. reuteri为研究对象,解析L. reute...

蠼螋肠道中碱性内切葡聚糖酶基因的克隆表达及功能分析

作者：陈俊梅; 李文鹏; 赵素雅; 黄冰纷; 王博文; 惠丰立; 尹晓燕; 牛秋红 刊期：2019年第09期

【目的】从蠼螋肠道细菌菌株Q5中获得一个新型耐碱纤维素酶基因,通过异源表达、酶学性质及功能分析,旨在为以后进一步研究开发高温碱性纤维素酶提供一些理论参考。【方法】采用刚果红平板初筛法,从河南南阳宝天曼部级自然保护区落叶堆下的昆虫蠼螋肠道中,获得具有分泌较高活性碱性纤维素酶的细菌菌株。基于该菌株的形态学、生理学及16S rRNA序...

肠道微生物功能宏基因组学与代谢组学关联分析方法研究进展

作者：侯璐文; 吴长新; 秦雪梅; 李建国 刊期：2019年第09期

近年来基于高通量基因测序的微生物组学研究极大加深了人们对微生物与健康和疾病关系的认识。然而基因测序方法不能直接测定微生物的功能活性,难以鉴定微生物中的关键功能分子,单独使用无法回答肠道微生物何种成员通过何种方式影响宿主等关键科学问题。单一组学研究弊端尽显,多组学联用势在必行。肠道微生物代谢组学以微生物群落所有小分子代谢...