首页 期刊 泰山医学院学报 室间隔缺损患者循环 miRNA 表达差异研究 【正文】

室间隔缺损患者循环 miRNA 表达差异研究

作者:许美玲; 吴雪嵩; 朱凯; 李金栋; 王倩; 纪龙 泰安市泰山区疾病预防控制中心; 山东泰安271000; 泰山医学院公共卫生学院; 山东泰安271016
室间隔缺损   微小   rna   notch1   hand1  

摘要:目的:先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损(VSD)是 CHD 中最常见的一种。研究表明,microRNAs(miRNAs)与 CHD 的发生发展关系密切,但目前缺乏有关 miRNAs 与 VSD 的研究报道。本研究旨在通过血清差异 miRNA 的表达研究阐明 miRNA 与 VSD 发生发展的关系。方法采用 miRNA表达谱芯片技术进行 VSD 患者血清 miRNA 表达差异分析,并对结果进行实时定量 PCR(Real-time PCR)验证,进而对 miRNA 调控的靶基因进行生物信息学分析。结果通过 miRNA 芯片在 VSD 患者和对照血清样本中检测 miR-NA 差异表达,筛选出36个表达差异的 miRNA(P <0.05),其中21个 miRNA 在 VSD 患者表达显著下调,15个表达显著上调。经过 Real-time PCR 验证,证实8个 miRNAs 差异表达有意义。通过生物信息学预测出447个靶基因,经 GO 分析富集度分值(enrichment score value)最大的生物过程(biological process)为心脏右心室形态发生(cardiac right ventricle morphogenesis),对应的差异表达基因为 NOTCH1、HAND1、ZFPM2和 GATA3,调控这些基因的 miRNA可能包括 hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p 和 hsa-miR-433。结论通过微阵列技术分析和 RT-PCR 验证,筛选出8个差异表达 miRNA,为后续实验提供了可供分析的 miRNA。利用3个数据库及 GO 分析,发现 hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p 和 hsa-miR-433的靶基因分别为 NOTCH1、HAND1、ZFPM2和 GATA3,为进一步在基因水平研究 VSD 的发病机制提供了新的突破口,为将来可能实现的基因诊断、基因干预治疗以及疾病的预防奠定了一定的实验基础。

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