摘要:后基因组时代如何识别蛋白质复合物并预测其功能是蛋白组学的一项基本任务,然而传统实验方法获取的蛋白质复合物不仅数量有限而且成本代价高昂,采用新技术和方法提高蛋白质复合物的识别效率是现阶段与蛋白质相关的药物设计唯一现实可行的手段。本文基于蛋白质相互作用网络的小世界原理和蛋白质复合物内蛋白质之间的最短距离一般不超过2的事实提出了一种新的基于极大团扩展的蛋白质复合物识别算法NCIA。该算法针对蛋白质网络中的极大团利用聚类系数进行扩展以提高蛋白质复合物识别的准确率。将该方法应用于酵母蛋白质相互作用网络,相关数据表明与其他典型的蛋白质复合物识别算法相比较,该方法具有很好的识别能力。
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