首页 期刊 山东农业科学 洋葱AcPME基因的克隆及序列分析 【正文】

洋葱AcPME基因的克隆及序列分析

作者:孙亚玲; 陈立; 孙雨晴; 杨妍妍; 吴雄; 曹辰兴; 霍雨猛 山东农业大学园艺科学与工程学院; 山东泰安271018; 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所、山东省设施蔬菜生物学重点实验室、国家蔬菜改良中心山东分中心; 山东济南250100; 吉林农业大学园艺学院; 吉林长春130118
洋葱   克隆   序列分析  

摘要:以洋葱花蕾为试材,通过RACE试验获得了Ac PME基因的全长c DNA序列,Gen Bank登录号为JF913196.1。该基因DNA序列包含2 786个碱基,4个外显子,3个内含子,c DNA序列长度为2 228 bp,编码序列长度为2 001 bp,编码666个氨基酸。生物信息学分析显示Ac PME蛋白存在明显的信号肽和跨膜区域(SP/TM)、PMEI结构域和PME结构域,在PME家族分类中属于第Ⅰ类,即含有一个长的N末端前区域(PRO-region)。氨基酸同源比对与系统进化分析表明,Ac PME蛋白与水稻、玉米、高粱等单子叶植物的同源蛋白具有较高的一致性。三维结构模式图显示该蛋白具有一个明显的凹沟,4个果胶结合位点氨基酸残基(T423、Q453、R565和W567),2个活性位点氨基酸残基(D476和D497)。本研究为洋葱Ac PME基因的结构域蛋白互作及功能研究奠定了基础。

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