首页 期刊 热带作物学报杂志 2019年第10期
热带作物学报

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Chinese Journal of Tropical Crops

杂志简介：《热带作物学报》杂志经新闻出版总署批准，自1980年创刊，国内刊号为46-1019/S，是一本综合性较强的农业期刊。该刊是一份月刊，致力于发表农业领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：组学与生物技术、种质资源与遗传育种、作物栽培与生理生化、植物保护与生物安全、采后处理与质量安全、农业生态与环境保护、图书推介广告

主管单位：中国科学技术协会
主办单位：中国热带作物学会;中国热带农业科学院;中国科技出版传媒股份有限公司
国际刊号：1000-2561
国内刊号：46-1019/S
全年订价：¥ 408.00
创刊时间：1980
所属类别：农业类
发行周期：月刊
发行地区：海南
出版语言：中文
预计审稿时间：1-3个月
综合影响因子：1.42
复合影响因子：0.97
总发文量：4802
总被引量：28798
H指数：36
引用半衰期：6.0757
立即指数：0.007
期刊他引率：0.8094
平均引文率：20.8033
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分期目录

  • “热带植物基因组学与基因编辑”专题序言

    作者：赖钟雄; 徐涵 刊期：2019年第10期

    动植物全基因组测序在过去20年快速发展。1990年人类基因组计划开启了基因组DNA测序的大门,2000年基本完成人类基因组草图绘制,标志着大规模DNA测序成为一种切实可行的研究手段。植物基因组通常是多倍体,基因组大,杂合度高,具有高度重复序列和全部(或部分)的基因组重复片段,因此,对植物基因组的研究远比动物困难。一些复杂的植物基因组测序在传...

  • 热带植物基因组研究进展

    作者：李丹; 陈晓慧; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    基于全基因组测序结果,探讨了包括热带水果香蕉(Musa spp.)、龙眼(Dimocarpus longan)、番木瓜(Carica papaya)、菠萝(Ananas comosus)、椰子(Cocos nucifera)、榴莲(Durio zibethinus),经济作物橡胶(Hevea brasiliensis)、木薯(Manihot esculenta)、枣椰(Phoenix dactylifera)、可可(Theobroma cacao)、油棕(Elaeis guineensis)、咖啡(Coffea c...

  • 龙眼体细胞胚胎发生早期SDG基因家族的全基因组鉴定与表达分析

    作者：申序; 陈晓慧; 徐小萍; 霍雯; 李晓斐; 蒋梦琦; 张婧; 林玉玲; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    SET domain group(SDG)基因家族控制的组蛋白赖氨酸甲基化,是参与染色质功能调控和表观遗传调控基因表达的重要部分。为了解龙眼(DlSDG)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼全基因组SDG家族成员的鉴定,并对蛋白质结构域、保守基序、基因结构、启动子顺势作用元件、进化树、相关基因的蛋白互作和体胚发生早期的基因表达情况进行预测...

  • 龙眼体胚发生过程中RNA甲基化相关基因全基因组鉴定及表达分析

    作者：王静宇; 陈晓慧; 申序; 徐小萍; 张梓浩; 林玉玲; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    为了解龙眼RNA甲基化相关基因的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析方法,进行龙眼基因组RNA甲基化相关基因成员鉴定,蛋白结构域及特性分析,分子进化树分析,体胚发生过程和组织器官基因表达水平分析以及ABA处理下的定量表达分析。结果显示:龙眼中有7个参与RNA甲基化过程中的关键基因,包括5个RNA甲基转移酶基因和2个去RN...

  • 龙眼HD-Zip基因家族生物信息及表达分析

    作者：张春渝; 徐小萍; 陈晓慧; 申序; 林玉玲; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    为了解龙眼HD-Zip基因家族的功能,本研究基于龙眼基因组与转录组数据库,对提取的19个龙眼HD-Zip家族成员的启动子、可变剪接以及受到调控的miRNA种类进行分析;并采用实时荧光定量PCR技术,分析了在ABA处理下龙眼胚性愈伤组织(embryonic callus,EC)中HD-Zip部分成员的表达模式,以及HD-Zip部分成员在不同体胚阶段的表达模式。结果表明:龙眼HD-Zip家...

  • 龙眼类受体蛋白激酶CRK家族全基因组鉴定及表达调控分析

    作者：孙莹; 林艺灵; 赵鹏程; 徐小萍; 陈晓慧; 申序; 林玉玲; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    为了解龙眼富含半胱氨酸的类受体蛋白激酶(cysteine-rich receptor-like kinase,CRK)家族的基本特征与功能,本研究采用生物信息学分析方法对筛选出的98个龙眼CRK基因家族的成员进行分析鉴定,包括分子进化树的构建和对蛋白结构域及其特性、启动子及其顺式作用元件、体胚发生的过程以及组织器官特异性表达的分析。结果显示:通过对龙眼和拟南芥CRK...

  • 龙眼MSIL全基因组鉴定及表达分析

    作者：许小琼; 陈晓慧; 申序; 徐小萍; 林玉玲; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    MSIL(Muliticopy suppressor of IRA homolog1-Like)基因是WD重复蛋白的一个亚家族,在植物生长发育过程中发挥重要的作用。为了解龙眼MSIL(DlMSIL)基因家族的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析法对DlMSIL基因成员进行鉴定,并进行蛋白质结构及理化性质分析、系统发育进化树构建、启动子顺式作用元件分析、龙眼体胚阶段...

  • 香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析

    作者：杨会晓; 孙媛媛; 贾彩红; 金志强; 徐碧玉; 王卓 刊期：2019年第10期

    苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)是催化苯丙烷代谢途径第1步反应的限速酶,广泛地参与植物生长发育过程中的各种生理活动。本研究通过生物信息学分析,从香蕉A基因组数据库中利用BLASTp筛选出53个可能的MaPAL编码蛋白序列。在NCBI分析蛋白保守结构域,发现仅有8个基因具有典型的PAL家族基因的特性。聚类分析结果表明香蕉MaPAL家族...

  • 菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析

    作者：陈哲; 胡福初; 阮城城; 范鸿雁; 郭利军; 张治礼 刊期：2019年第10期

    R2R3-MYB转录因子参与植物众多生命活动的调控,在植物生长发育中至关重要。本研究采用生物信息学分析方法,从菠萝基因组中筛选鉴定R2R3-AcMYB转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;基于转录组数据和荧光定量PCR分析,研究了乙烯利处理后菠萝顶端分生组织MYB基因的表达模式。研究结果显示,菠萝基因组含有103个R2R3-AcMYB转录因...

  • 基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析

    作者：鹿志伟; 侯晓婉; 杨子平; 张燕梅; 李俊峰; 周文钊 刊期：2019年第10期

    生长素反应因子(AuxinResponseFactors,ARFs)是植物特有的多基因转录因子家族,参与植物生长发育过程的调节。本研究基于转录组数据,通过生物信息学方法鉴定剑麻ARF基因家族成员,同时对其进行相关生物信息学分析。结果表明:在剑麻中共鉴定得到15个ARF基因,并依次命名为AhARF1~15。其编码的蛋白质含有409~1011个氨基酸,分子量约为45.17~112.13ku,...

  • 野生蕉不同颜色果皮miRNA表达谱及靶基因分析

    作者：邓素芳; 程春振; 林玉玲; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    本文以闽侯野生蕉(阿宽蕉,Musa itinerans)果皮为研究对象,对不同颜色(绿色和紫色)果皮进行转录组测序,旨在探讨miRNA在野生蕉不同颜色果皮转录后水平中发挥的作用及其可能参与的调控通路,为芭蕉属植物果皮颜色分子调控机制的研究奠定基础。取野生蕉同一果梳上不同颜色(紫色和绿色)的果皮为材料,利用高通量测序和生物信息学分析,获得野生蕉不同...

  • 热胁迫下水仙花叶片的转录组分析

    作者：宋姣敏; 徐小萍; 陈裕坤; 陈桂信; 赖钟雄 刊期：2019年第10期

    为研究水仙响应高温胁迫过程中相关基因的表达及响应热应激的分子机制,本研究以漳州水仙花为材料,使用BGISEQ-500测序技术,对高温(30、35℃)处理及正常生长条件(15℃)的水仙叶片进行转录组学的测序分析。使用Trinity软件对15(对照)、30、35℃(高温胁迫)处理24 h的水仙叶片测序数据进行从头组装,利用BLAST软件进行基因比对注释,通过DEGseq和Possi...

  • 甘薯近缘野生种Ipomoea Littoralis全基因组Survey分析

    作者：霍恺森; 曹清河; 王珧; 陈艳丽; 朱国鹏 刊期：2019年第10期

    Ipomoea littoralis是甘薯的近缘野生种之一,对其全基因组的研究可为甘薯种质资源的创新提供参考,同时为全基因组精细图谱的绘制打下基础。本研究通过二代高通量测序技术(Illumina Hiseq 2500),测序深度约为60,经过滤后得到22.45 G数据,结合生物信息学手段估算基因组大小、杂合率、重复序列和GC含量等基因组特征。预估基因组大小经修正后为676.2...

  • 基于提高CRISPR/Cas基因编辑效率的研究进展

    作者：张玉苗; 李蓉; 鲁瑶; 林玉玲; 赖钟雄; 徐涵 刊期：2019年第10期

    CRISPR 基因编辑技术发展迅速,为功能基因的研究及遗传改良提供了技术支持。提高基因组编辑效率成为使用基因编辑技术的基本点,目前已取得了重要进展。本文结合 CRISPR/Cas 系统的作用原理、晶体结构,着重介绍目前提高编辑效率的最新研究进展,对 CRISPR/Cas 基因编辑效率的提高进行分析并提出改进策略。

  • 植物顶端有限生长相关基因与基因编辑育种研究进展

    作者：郭品品; 任钢; 李重; 曾少华; 德塔娜; 王瑛 刊期：2019年第10期

    随着劳动力成本的增加,农作物的采收将逐步从人工采收过渡到机械采收,因此培育紧凑、矮化、果实成熟集中、耐密植、适宜机械化操作的新品种已成为作物遗传改良的主要目标。本文重点综述了不同物种 FT 及其同源基因对植物成花的调控功能,植株顶端的无限生长和有限生长的控制基因及其功能研究进展,以及通过基因编辑促进顶端成花进而导致植株顶端由...

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