首页 期刊 热带亚热带植物学报 弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析 【正文】

弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析

作者:韩雨昕; 南芳茹; 巩超彦; 冯佳; 吕俊平; 刘琪; 谢树莲 山西大学生命科学学院; 太原030006
弯枝藻属   rbcl基因   蛋白质结构预测   适应性进化  

摘要:为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征,选取弯枝藻属(Compsopogon)及相近外类群的rbcL基因共17条,利用PAML4.9软件,对弯枝藻属rbcL基因编码蛋白进行生物信息学分析,并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测。结果表明,弯枝藻属rbcL基因编码蛋白的二级结构主要由α螺旋和β折叠构成,结构稳定。采用最大似然法构建的系统发育树表明,内类群为单一物种,分为3个小分支,具有一定地理分布规律。在3种进化模型中均未检测到统计上显著的正选择位点,表明绝大多数位点处于负选择压力下。因此,弯枝藻属rbcL基因未发生适应性进化。

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