首页 期刊 热带亚热带植物学报 巨桉AGO基因家族的生物信息学分析 【正文】

巨桉AGO基因家族的生物信息学分析

作者:范春节; 闫慧芳; 裘珍飞; 曾炳山; 刘英; 李湘阳; 王象军; 郭光生 中国林业科学研究院热带林业研究所; 广州510520
桉树   ago蛋白   基因家族   生物信息  

摘要:为了解巨桉(Eucalyptus grandis)中Argonaute (AGO)的功能,经全基因组序列分析,巨桉中存在14 个AGO 基因家族成员,基因长度为2676-3225 bp,编码的蛋白质具有保守的Piwi、PAZ、DUF1785 结构域.巨桉EgrAGOs 基因可分为3 组,内含子和外显子结构具有明显的组织特异性.组内成员核苷酸序列和氨基酸序列保守性较高,同源性分别达到88.14% 和82.97%.EgrAGO 基因分布于第2、4、7、8、10、11 条染色体上,在进化过程中存在着串联复制和大片段基因复制机制.预测巨桉的大部分AGO 蛋白定位于细胞核和胞质中,表现出偏碱性和亲水性,具有较高的脂溶指数.基因表达分析表明,桉树EgrAGO成员在不同组织中的表达有明显差异,与木材形成相关的组织/ 器官中有较高的表达.这些为深入研究EgrAGO 基因的功能奠定了基础.

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