首页 期刊 农业生物技术学报 侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp基因克隆和进化分析 【正文】

侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp基因克隆和进化分析

作者:刘文洪; 洪健; 陈集双; 叶美琴 浙江大学生命科学学院//浙江大学分析测试中心,杭州310029; 浙江大学分析测试中心,杭州310029; 浙江大学生命科学学院; 杭州310029; 浙江丽水市农业局,丽水323000
黄瓜花叶病毒   东方百合   分离物   进化分析   基因克隆  

摘要:从浙江丽水和杭州的东方百合(Lilium cv.Oriental hybrids)上得到2个黄瓜花叶病毒分离物CMV-LS和CMV-HZ,采用RT-PCR法分别扩增得到2条长约1000nt片段,经序列测定,全长分别为996nt和998nt,两分离物的外壳蛋白(cp)基因由657nt组成。将两分离物的cp基因与其它24个CMV分离物进行了同源性比较,在cp基因核苷酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.6%~99.7%和68.6%~77%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.7%~98.8%和68.6%-77%。在氨基酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.5%-99.1%和65.7%-78.5%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.1%-98.6%和66.4%-78.1%。表明两分离物均属于CMV亚组Ⅰ成员。cp基因序列系统进化树分析表明,来自百合的CMV分离物在系统进化树中单独成簇,不受地域差异的影响,出现了寄主适应性变异,形成明显的株系分化趋势。

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