摘要：在前期大规模水稻(Oryza sativa)EST测序和生物信息学分析的工作中，发现一些在茎cDNA文库中高水平表达基因，包括叶绿素a／b结合蛋白(T007D10)、富脯氨酸蛋白(S037D04)、脱落酸和逆境诱导蛋白(S057803)、微管蛋白(S060D11)等基因。为验证这些基因是否为茎特异性表达基因，选择高冗余度的EST克隆制备cDNA探针，与高通量的RNA阵列进行杂交。结果表明：叶绿素a／b结合蛋白基因在叶中高丰度表达且受光诱导，是一个光合作用相关基因，而不是茎特异性基因；微管蛋白基因在茎和根中都具有较高的表达丰度，说明根的纤维化和茎的木质化是同一生化过程；脱落酸和逆境诱导蛋白基因虽然在茎中高表达，但其丰度容易受环境条件(如营养缺乏、逆境等)的影响，而不是在茎中以组成型方式稳定表达，不能被称为茎特异性表达基因。这些结果提示出在一个EST数据库中高冗余度的基因并不能完全代表该文库的特征，也不能单纯通过EST分析技术认定它们是组织特异性表达基因，需要进一步的确认。通过在不同发育阶段、不同生理状态及不同逆境状态下获得全局性的表达谱特征，才能较客观地评价一个基因是否为组织特异性表达基因。

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