首页 期刊 林业工程学报 杉木SSR—PCR体系优化 【正文】

杉木SSR—PCR体系优化

作者:徐阳; 陈金慧; 王颖; 赵亚琦; 王新民; 郑仁华; 施季森 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室; 南京210037; 福建省林业科学研究院
杉木   分子标记   正交试验   体系优化  

摘要:SSR—PCR反应体系优化是杉木SSR标记研究的基础。利用正交L16(4^5)设计实验对杉木SSR-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和DNA浓度5个因素的4个水平进行优化试验。并在正交直观分析和方差分析的基础上,分别对Mg2+、dNTPs进行单因素确定。获得的最佳反应体系为:在20灿反应体系中,Mg2+浓度为1.0mmol/L,引物浓度为0.25μmol/L,dNTPs浓度为0.15mmol/L,Taq酶为0.05U/μL,DNA为30ng,10×PCRBuffer2μL,不足部分用双蒸水补齐至20μL。在最佳反应体系的基础上,采用单因素实验确定了引物的最佳退火范围为63~53℃。利用此反应体系对10个F1代杉木材料及其亲本,进行4对SSR标记进行PCR扩增并电泳检测,其结果清晰、稳定。说明此体系适合进一步的杉木SSR研究工作。

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