作者:刘杨; 张方博; 孙慧峰; 赵海誉; 边宝林 期刊:《中华中医药》 2019年第10期
目的:文章应用整合药理学平台对黄连解毒汤成分抗炎作用进行分析,预测黄连解毒汤的抗炎作用靶点以及通路。方法:对平台富集到的炎症相关的靶点、通路等进一步分析,旨在研究黄连解毒汤发挥抗炎作用的分子机制。结果:黄连解毒汤有效成分中的活性成分具有抗炎的作用;富集到的核心药物靶标NF-κB、STAT和PPAR与炎症反应的发生发展关系密切;主要通路包含氧化磷酸化、脂质代谢、线粒体等,可通过调控细胞内自由基、胆固醇、线粒体离子稳态...
作者:郑思成; 滑振; 王群; 刘悦; 张帆; 张哲; 贾连群; 杨关林 期刊:《世界中医药》 2019年第09期
目的:基于整合药理学探究红花治疗冠心病的潜在分子机制。方法:以“红花”,“Coronary heart disease”为限定词,借助整合药理学平台,通过挖掘红花活性成分及其相关作用靶标,与CHD潜在的靶点、分析其相关的信号通路,构建“中药-成分-靶标-通路”多位网络,从多角度、多层次探索红花治疗CHD的潜在分子机制。结果:红花对CHD的干预作用可能与多种化合物相关,主要集中于红色的和黄色的色素和多酚类成分。从关键靶标与作用通路可以看出,...
作者:赵振营; 张伟华; 赵丽中; 张春泽; 张锡朋; 刘昌孝 期刊:《南开大学学报·自然科学版》 2018年第04期
通过中医传承辅助系统挖掘痔疮治疗新方,联合整合药理学平台分析新方潜在作用分子靶点和信号通路.以《中医方剂大辞典》为基础汇编痔疮治疗中药方剂数据库,通过辅助系统软件计算获得药物使用频次并挖掘新方.以整合平台提供的功能模块进行靶标推算、网络布局等计算,建立新方的成分-靶标网络、新方-痔疮相关靶标网络,在功能分析和通路分析结果推导并揭示了新方作用的痔疮相关靶标分子机制.结果表明:完成对痔疮组方数据库提供的295个...
作者:马慧霞; 陈爱玲; 王小博; 赵启鹏 期刊:《广州化工》 2019年第12期
借助整合药理学平台(TCMIP)对大黄的化学成分、治疗脑卒中的作用靶点和信号通路进行研究,构建了大黄治疗脑卒中的“关键成分-重要靶标-主要通路”网络,揭示了大黄治疗脑卒中的活性成分有88个,与583个关键靶点及糖代谢、氧化磷酸化、能量代谢等相关生物过程有关。该研究可为进一步开展大黄治疗脑卒中作用及机制研究提供一定的科学依据。
作者:杨清鑫; 吕红君; 王小博; 姜蕾; 曾南 期刊:《中国中药》 2019年第13期
桂枝汤属于解表剂,为中医经典复方,临床上治疗脓毒症的疗效确切。但由于经方的复杂性,其抗脓毒症的机制难以明确,'桂枝-白芍'药对为调和营卫经典配伍,是桂枝汤的核心,该研究以桂枝-白芍为研究对象,借助整合药理学平台(TCMIP,www.tcmip.cn/),进行桂枝-白芍化学成分分析、疾病靶标预测、基因功能和通路富集分析,并建立'中药-化学成分-核心靶标-关键通路'的多维网络关系,对桂枝-白芍治疗脓毒症的作用机制进行探讨。'桂枝-白芍'药对预...
作者:陈澈; 乔海琦; 周晟 期刊:《中国老年学》 2019年第18期
目的采用整合药理学方法探究玉液汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法对玉液汤7味中药进行成分筛选及靶标预测,并以2型糖尿病为检索词,预测疾病靶标。通过对玉液汤调节疾病失衡网络进行核心靶标提取,得到其候选网络靶标。对关键靶标进行基因功能分析和通路富集分析,构建玉液汤治疗2型糖尿病的"中药-核心成分-关键靶点-主要通路"的多维关系网络图,以探索中药-靶点-疾病之间的相互作用关系。结果共得到玉液汤273个化学成分,发现磷脂酶Cδ...
作者:周荣荣; 李培硕; 关伟; 王丽萍; 李彦文; 李志勇 期刊:《医药导报》 2019年第06期
目的 探究天麻防治头痛的分子作用机制,预测治疗头痛的可能有效的潜在疾病靶标。方法 利用中药整合药理学平台,将天麻化学信息进行靶标预测,与头痛相关疾病靶标信息进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络构建,富集分析中药成分、疾病、关键靶标的生物基因功能和相关通路,构建出天麻化学成分、关键作用靶标和疾病相关通路的相互作用网络,绘制“中药-化学成分-关键靶标-通路”网络图。结果 预测的天麻活性成分主要包括酚类、多糖类等,如天...
作者:邵琳琳; 姜凌宇; 姜月华; 亓英姿; 杨传华 期刊:《辽宁中医》 2019年第08期
老年高血压与认知障碍的主要病机为肝肾亏虚。肾精亏虚,脉体失荣,肝失疏泄,血行不畅。肾不闭藏,志意不存,肝气不达,记忆提取受阻。杜仲-刺蒺藜药对有肝肾同调,疏补结合,降压益脑之功。借助整合药理学平台(TCMIP),挖掘杜仲-刺蒺藜可能的活性成分,进行数据整理预测与高血压认知障碍相关的靶点。结果显示其有效分分有26个化学成分,39个关键靶标,30个核心通路。涉及循环系统与神经系统功能,或与炎症、氧化应激以及与衰老的线粒体功能障...
作者:侯圣林; 战丽彬; 朱博冉; 路晓光 期刊: 2018年第08期
目的:采用整合药理学的方法探究大黄附子汤治疗重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis,SAP)的物质基础与作用机制。方法:利用中药整合药理学计算平台检索查询大黄附子汤三味中药的活性成分、药物靶标,以及SAP的疾病靶标,建立药效成分-靶标-信号通路网络图并分析网络拓扑结构,探究大黄附子汤治疗SAP的物质基础与作用机制。结果:平台筛选出大黄附子汤158种药效成分,主要为糖类和苷类,及659个靶标,包括CGK、JUN、ATP1A1和KRAS等,...
作者:许爱丽; 唐彬; 王源; 张平; 魏玮 期刊:《北京中医药》 2019年第05期
目的应用整合药理学方法探讨半夏泻心汤治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法运用整合药理学平台(TCMIP)的中药数据库,得到治疗CAG临床效果确切的经典方剂半夏泻心汤的化学成分及对应药物靶标,通过Human Phenotype Ontology数据库得到CAG的疾病靶标并将其导入TCMIP,TCMIP基于蛋白质相互作用网络(PPI)数据库构建靶点相互作用网络,进而得到半夏泻心汤治疗CAG候选靶标,最后对候选靶标进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,并结合文献...
作者:王波; 周荣荣; 唐仕欢 期刊:《中国中药》 2018年第19期
基于《中医方剂大辞典》数据库,应用中医传承辅助平台挖掘消渴病方高频药物,通过关联规则和聚类分析挖掘其核心药物及其组合;基于整合药理学平台挖掘药物-疾病关系,构建"药物-化合物-靶点"网络并富集分析关键靶点的基因功能、代谢通路,对其"核心药物-作用靶点"关联性进行挖掘分析,从而探讨其防治消渴病的分子机制。收集、整理并挖掘《中医方剂大辞典》中341首消渴病方剂,药物频次统计甘草最常用,其次是麦冬、茯苓、人参、黄连等,药...
作者:苏瑾; 周荣荣; 郭非非; 周勤文; 许海玉 期刊:《中国中药》 2019年第07期
该文对舒冠颗粒配伍应用的中医理论进行分析,并对其6种植物药何首乌、丹参、黄精、川芎、淫羊藿、红花进行网络药理学分析,借助整合药理学平台获取化学成分及药物作用靶点,通过ETCM数据库搜集适应症靶标。对舒冠颗粒的配伍、成分、作用靶标、通路进行分析,确定其可能的最优适应症。结果表明,舒冠颗粒治疗中医症候为胸痹,君药为丹参。网络药理学分析发现舒冠颗粒药物靶标富集结果与适应症冠心病、心绞痛以及动脉粥样硬化均相关,结合...
作者:邢炎华; 侯少平; 何志鹏 期刊:《药物评价研究》 2019年第01期
目的 通过整合药理学平台寻找金铃子散治疗消化性溃疡的质量标志物并探讨其作用机制。方法 以整合药理学平台为基础建立金铃子散“药材-成分”“疾病-靶标-成分”数据库,筛选关键靶标并进行通路富集分析,以Score≥0.8为相似度,采用AI技术对数据库进行分析和相互关联,进行金铃子散治疗消化性溃疡的“中药-成分-靶标-通路”多维网络分析,筛选出金铃子散抗溃疡的质量标志物,并对其分子机制进行预测。结果 通过整合药理学平台中药成分...
作者:郎霞; 张海虹; 李会芳 期刊:《药物评价研究》 2019年第01期
目的 运用中药整合药理学计算平台(TCMIP),探索巴戟天治疗抑郁症的作用机制。方法 借助TCMIP,检索巴戟天所含的化学成分信息;通过网络药理学平台,以“节点连接度”的2倍中位数为卡值,选取中药靶标-疾病基因互作网络的核心节点;在此基础上,计算“节点连接度”“节点紧密度”和“节点介度”等3个拓扑结构特征值,筛选出巴戟天治疗抑郁症的核心靶标;基于基因本体数据库(GO)和KEGG通路数据库,确定药物靶标基因所编码蛋白质的分子功能、...
作者:章轶立; 魏戌; 谢雁鸣; 唐彬; 姜俊杰; 申浩; 支英杰 期刊:《中国实验方剂学》 2018年第21期
目的:以补骨脂-三七药对为例,从整合药理学角度探索补肾活血法治疗骨质疏松症的作用机制。方法:基于整合药理学平台(TCMIP),收集补骨脂、三七的化学成分信息,以"osteoporosis"作为疾病关键词,得到骨质疏松症全部靶标。通过TCMIP的蛋白质-蛋白质相互作用信息(PPI)数据库,获得补骨脂-三七作用靶标与骨质疏松疾病靶标之间的PPI,构建药对与疾病间的关键靶标网络,基于基因本体和京都基因与基因组百科全书数据库,确定靶标基因、...
作者:吴智春; 于华芸; 张成博; 马婷; 宗鑫; 季旭明 期刊:《中国实验方剂学》 2019年第04期
目的:探讨黄连汤治疗胃炎的功效物质基础和可能的作用机制,为该复方的后续应用与研发提供参考。方法:利用中药整合药理学平台预测黄连汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,构建黄连汤成分靶标-疾病靶标网络,筛选关键节点进行通路富集分析,探索黄连汤多成分-多靶点-多通路治疗胃炎的可能作用机制。结果:黄连汤预测的175个活性成分与胃炎相关的538个关键靶标相互作用,通过趋化因子、雌激素和T细胞受体等信号通路参与幽门螺旋杆菌感染...
作者:许海玉; 侯文彬; 李珂; 申业; 唐仕欢; 郭非非; 张晶晶; 吴宏伟; 王萍; 苏瑾; 周荣荣; 李亚卓; 王岚; 王磊; 贡磊磊; 杨洪军; 刘昌孝 期刊:《中国实验方剂学》 2019年第06期
中药质量标志物是中药质量控制的新概念、新模式,将引领中药质量发展新方向。其中,如何表征中药整体质量属性及其生物学效应,是质量标志物研究的关键科学问题。针对此关键科学问题,本文提出基于整合药理学的中药质量标志物发现与确证的研究思路,即通过'化学指纹-代谢指纹-网络靶标-生物效应-中医功效'多维关联系统筛选候选中药质量标志物,在此基础上,基于'肠吸收-活性评价-数据挖掘'体系建立中药质量标志物与生物活性之间精确定量...
作者:徐男; 王亮; 孙蓉; 黄欣; 张成博; 时海燕 期刊:《中国实验方剂学》 2019年第05期
目的:探讨三棱抗血小板聚集及抗血栓形成的分子机制。方法:利用中药整合药理学平台(TCM-IP)的中药材数据库、中药成分数据库和疾病靶标数据库的数据信息和分析功能,检索三棱所含的化学成分信息,构建三棱作用的潜在靶标和疾病靶标之间的相互作用网络,然后富集计算核心靶标,进行基因功能分析和通路分析,再进一步构建'中药材-化学成分-核心靶标-关键通路'多维关系网络。结果:对三棱预测活性成分主要包括黄酮、酚酸等成分,如山柰酚、三...
作者:王泽; 康宝玲; 王钱; 韩雅娅; 武文慧; 门九章 期刊:《中医药导报》 2019年第04期
目的:通过整合药理学平台研究连翘在治疗放化疗后呕吐的可能内在机制。方法:通过整合药理学的大数据模块和计算机的智能化计算,得出连翘在治疗化疗性呕吐过程中'中药-成分-靶标-通路'之间的内在关系。结果:连翘可能是通过齐墩果酸、熊果酸、乳糖、汉黄芩苷等6种比较可能的关键化学靶标,环氧合酶(COX)、ATP酶、GCK激酶、人β干扰素和重组人Tyr-3/Trp-5单氧酶激活蛋白Epsilon等几种可能的药物靶标和循环系统、内分泌系统、神经系统等...
作者:吕冬梅; 崔如意; 周荣荣; 许海玉 期刊:《药学学报》 2018年第05期
生脉饮被广泛应用于心律失常并取得了很好的疗效,由于中药复方的复杂性,其治疗心律失常的药理学机制尚未得到阐释。本研究借助中药整合药理学平台,对生脉饮治疗心律失常分子机制进行研究。结果显示,生脉饮可能通过作用于碳代谢、嘌呤代谢、糖类代谢等能量代谢相关通路或通过调节ATP水平来达到对心律失常的治疗作用。本研究还得到生脉饮中发挥这一作用的主要药物成分可能是人参。