作者:张加强; 朱开元; 史小华 期刊:《分子植物育种》 2019年第21期
在植物生长发育过程中,MADS-box是一大类重要的转录调控因子,尤其是在植物花器官发育过程中起到重要的作用。本研究以已经公开的芍药(Paeonia lactiflora)MADS-box相关的基因信息为研究对象,利用生物信息学方法对芍药MADS-box基因家族进行鉴定和注释,并对其基本理化性质、保守基序以及适应性进化等方面进行分析。结果表明,在芍药中鉴定出23个MADS-box基因家族成员,编码的氨基酸序列长度在209~244 aa之间,相对分子量介于24.29~28.13...
作者: 期刊:《曲靖师范学院学报》 2019年第06期
曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心依托"云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室"与"云南省高校云南特境内生菌资源开发与利用科技创新团队"于2016年1月正式批准成立。研究中心成立以来,秉承"开放、流动、联合、竞争"的发展理念与运行机制,逐步发展成为曲靖师范学院开展高水平基础研究和应用基础研究、聚集和培养学科带头人.
作者:王捷; 徐羽; 石瑛; 王清华; 孟志龙; 谢树莲 期刊:《西北植物学报》 2019年第11期
念珠藻(Nostoc)固氮过程关键在于固氮酶的催化,而固氮酶复合物中的铁蛋白(NifH)是由高度保守的nif H基因编码的,该基因是进化史上现存最古老的功能基因之一。该研究选取念珠藻属及近缘类群的nif H基因序列共40条,采用最大似然法构建系统发育树;运行PAML4.9软件,对nif H基因编码蛋白进行生物信息学分析,并使用分支模型、位点模型和分支-位点模型检测该基因的选择位点,探讨nif H基因的适应性进化特征。结果表明:(1)最大似然树显示内...
作者:韩雨昕; 南芳茹; 巩超彦; 冯佳; 吕俊平; 刘琪; 谢树莲 期刊:《热带亚热带植物学报》 2019年第01期
为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征,选取弯枝藻属(Compsopogon)及相近外类群的rbcL基因共17条,利用PAML4.9软件,对弯枝藻属rbcL基因编码蛋白进行生物信息学分析,并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测。结果表明,弯枝藻属rbcL基因编码蛋白的二级结构主要由α螺旋和β折叠构成,结构稳定。采用最大似然法构建的系统发育树表明,内类群为单一物种,分为3个小分支,具有一定地理分布规律。在3...
作者:谢希贤; 马倩; 陈宁 期刊:《生物产业技术》 2016年第04期
氨基酸及其衍生物具有重要的代谢与调控功能。随着代谢工程技术的迅速发展,代谢工程育种逐步取代传统的育种技术,在氨基酸生产菌株的选育中占据了主导地位,特别是在优良性状的选育,如菌株的低值原料利用能力、抗逆性等方面表现出越来越重要的作用。文章主要介绍氨基酸生产菌株的代谢工程育种技术及其发展趋势,以及代谢工程育种技术在菌株优良性状选育方面的应用。
作者:郭学武; 张玉; 关翔宇; 倪晓丰; 汪庆; 陈叶福; 肖冬光 期刊:《生物技术通报》 2018年第08期
选育高木糖耐性肺炎克雷伯氏菌并对其进行转录组学分析与产2,3-丁二醇发酵条件的优化。首先通过适应性进化定向筛选出了具有高木糖耐受能力和2,3-丁二醇产量提高的肺炎克雷伯氏菌(KP2),然后对其进行转录组学分析与发酵条件优化。结果显示,筛选出的高木糖耐性的肺炎克雷伯氏茵木糖的转化率提高了174.5%,2,3-丁二醇的产量提高了227%。转录纽分析结果表明亲本菌株KPG和KP2菌株差异表达基因中有242个基因上调和263个基因下...
作者:许文龙; 胡凤仙; 刘婷; 韦柳静; 花强 期刊:《微生物学通报》 2019年第07期
【背景】安丝菌素是一类由珍贵束丝放线菌橙色亚种(Actinosynnema pretiosum ssp.auranticu)生产的美登素类衍生抗生素,属于大环内酰胺类物质,根据不同的C-3位基团可以分为一系列衍生物。目前已上市的高效抗癌药物曲妥珠单抗(T-DM1)以AP-3 (Ansamitocin P-3)为生产底物,并表现出很好的乳腺癌治疗效果。然而当前AP-3的产量较低,其过高的成本限制了进一步发展。【目的】应用适应性进化及添加适量甜菜碱策略提高安丝菌素AP-3的产量。...
作者: 期刊:《西藏大学学报·社会科学版》 2005年第04期
接国家自然科学基金委通知,西藏大学在2005年度项目申报工作中,有4项课题获国家自然科学基金委资助。受资助项目分别是理学院扎西次仁副教授申报的《西藏巨柏的居群遗传结构、化学成份变异及保护生物学研究》、屈君艳副教授申报的《藏药“苏巴”的表面活性万分与抗癌成分的分析研究》、拉琼讲师申报的《西藏沙棘的海拔高度与适应性进化的研究》,经管学院占堆讲师申报的《西藏藏药产业的可持续发展对策研究》,共获经费资助64万...
作者:侯曼曼; 陈微; 蔡奇英; 应智霞; 管毕财; 葛刚 期刊:《基因组学与应用生物学》 2018年第08期
研究植物系统发育和功能性状有助于认识植物的适应性进化机制。莎草科薹草属(Carex:Cyperaceae)植物种类繁多,生境类型多样,是研究不同生境下植物适应性进化的理想类群。本研究以鄱阳湖湖区周边区域29种薹草(湿生11种,陆生18种)为研究对象,基于分子系统发育和叶片功能性状初步探讨薹草属植物对生境的适应性进化。叶绿体DN段系统发育分析表明湿生薹草和陆生薹草各为不同的分支,表明不同生境的薹草种类具有不同的进化方向;12种...
作者:周明; 李彪; 欧阳菠; 钟赟; 杨建东 期刊:《四川农业大学学报》 2019年第02期
【目的】获得绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因(TLR5)编码区序列,并对其编码区蛋白的特征及适应性进化进行分析。【方法】以绿尾虹雉基因组DNA为模板,采用PCR扩增克隆获得TLR5基因编码区序列。使用MEGA、PAML等软件对其序列特征及选择压力进行分析。【结果】绿尾虹雉TLR5基因编码区序列全长2 583 bp,共编码860个氨基酸,以亮氨酸含量最高(133/860),色氨酸含量最低(11/860)。编码蛋白为典型的Ⅰ型跨膜结构,包括富含LRRs...
作者:陈鹏程; 苏欣; 郑璞 期刊:《食品与生物技术学报》 2018年第12期
为提高琥珀酸放线杆菌对琥珀酸盐的耐受性,在微米尺度的黏胶纤维膜载体上固定琥珀酸放线杆菌并构建纤维床反应器,通过菌体对高盐浓度环境的适应性进化,选育出一株耐盐的高产菌株。结果显示,该菌株琥珀酸产量为38.4±3.14 g/L,比初始菌株提高了23.8%;在3 L发酵罐分别对进化前后的菌株进行补料分批发酵产琥珀酸的验证,发现进化后获得的菌株发酵62 h,产琥珀酸86.3 g/L,生产强度1.39 g/(L·h),糖酸转化率78.7%,相比原始菌株,进化后获得的...
作者:严涵薇; 刘思若; 项艳 期刊:《分子植物育种》 2018年第16期
杨树(Populus L.)是世界上分布最广、适应性最强的树种之一,其天然种众多,长期被作为造林树种广泛应用。物种特有基因的全基因组分析对探明物种在长期进化过程中的适应性进化机制及筛选重要功能性状的基因具有重要意义。本试验通过序列同源性比对的方法,在杨树基因组中鉴定了物种特有基因。在此基础上,统计了杨树特有基因在染色体分布、长度、外显子个数等方面的序列结构特征,并分析了杨树特有基因的功能和扩增机制。与杨树全基...
作者:黄华; 郭水良 期刊:《植物研究》 2005年第02期
采用三种不同的方法提取外来入侵植物加拿大一枝黄花总DNA,并应用RAPD技术分析了浙沪地区4个加拿大一枝黄花居群间的遗传分化.结果表明:(1)2×CTAB法提取的DNA具有较好的完整性,能较好地去除蛋白质、酚类和多糖杂质,是比较适合加拿大一枝黄花总DNA提取的方法;(2)加拿大一枝黄花的遗传多态性非常高,13个引物在4个居群中共检测到102条扩增片段,多态带84条,多态率达到82.35%;特有带41条,占40.20%.居群之间的多态性分别是上海嘉定(73.13...
作者:吕烨锋; 杨东辉; 刘寒; 祝东梅; 王卫民 期刊:《中国农学通报》 2017年第26期
胰核糖核酸酶基因(RNase1)是RNase A基因超家族成员之一。目前RNase1在哺乳动物中研究较多,受到了研究学者的广泛关注,已成为研究动物食性适应性进化的关键基因之一。为了了解RNase1基因在脊椎动物中的功能特征,本研究简述了RNase A分子及蛋白结构特征,归纳了RNase1基因基因在哺乳类、鱼类及其他脊椎动物中的表达模式和功能研究进展。最后总结了RNase1基因的进化分析,并预测了RNase1基因未来的研究趋势。
作者:卢宇婷; 王金朋; 袁敏; 肖月; 孙金帅; 李成栋; 孔佑婷; 王莉 期刊:《分子植物育种》 2017年第04期
V-ATPase在植物适应逆境中起着非常重要的作用,本研究以重要模式植物拟南芥V-ATPase相关基因为目标序列,通过在6个禾本科植物(水稻,大麦,玉米,高粱,谷子和二穗短柄草)基因组中进行比较分析,揭示该基因家族扩增机制和适应性进化进行研究。分析发现,七个不同的植物基因组虽然经历了不同全基因组加倍,其中谷子与玉米加倍关联的基因数量最多,但V-ATPase基因数量在每个基因组非常相近,尤其是禾本科中玉米相对其它物种多一次单独的特异...
作者:任玉莲; 张璐; 路遥; 申戈; 吴淑玲; 常敏; 刘如玉; 胡蕾苹; 郝红晓; 吴云忠; 谢尧; 李明慧 期刊:《中国病毒病》 2017年第01期
目的探讨慢性乙型肝炎(chronic heptitis B,CHB)患者干扰素-α(IFN-α)治疗早期乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)的适应性进化。方法对16例进入免疫清除期的慢性乙型肝炎患者进行IFN-α抗病毒治疗,治疗12周有6例取得完全病毒学应答,3例部分病毒学应答,7例无应答。分别采集治疗前和治疗12周的患者血清,提取HBV DNA后扩增HBV全基因组,进行分子克隆后测序,对病毒基因组4个开放读码框进行适应性进化分析,并研究适应性进化与IFN-...
作者:韩宝银; 徐舒阳; 陈艳红 期刊:《基因组学与应用生物学》 2016年第12期
肝脏是生物新陈代谢的重要器官。为了探究青藏高原特有鸟类地山雀(Parus humilis)如何适应低温、低氧等恶劣环境,我们对其肝脏转录组数据进行分析,并结合斑胸草雀基因组数据进行了比较研究。结果显示,地山雀肝脏转录组中的大部分高表达基因都直接参与机体的新陈代谢活动;通过与斑胸草雀基因组数据进行比较,对筛选出的214个快速进化基因进行代谢通路的功能富集,发现多数基因富集到与能量代谢、免疫反应和消化相关的通路上。...
深圳国家基因库,中山大学和浙江大学等机构合作,公布了高质量的五步蛇基因组图谱,并通过对不同蛇类基因组的比较分析,揭示了蛇类适应性进化、功能退化和性染色体演化的遗传基础和分子机制.为五步蛇相关药物研发、进化生物学研究等方面提供了基因组学基础数据,相关成果发表于《自然-通讯》。蛇类基因组中的转座子呈现物种特异性的扩张。转座子在五步蛇的脑组织中特异性表达,并和邻近基因的表达相关联。这些基因显著富集于环...
作者:祁飞燕; 施鹏 期刊:《科学通报》 2016年第32期
动物形态的多样性造就了丰富多彩的动物世界.脊椎动物附肢形态的发生一直以来是研究物种形态进化发育的典型例子.脊椎动物的附肢在漫长的进化历程中发生了多次重大的改变,这大大提高了脊椎动物的适应性.另外,在由水生鳍向陆生足演化以及四足动物形态各异的四肢发育过程中,涉及很多与发育相关的基因和调控通路.本文结合发育生物学和遗传学的证据,综述了近年来对脊椎动物四肢发育及进化机制的相关研究,强调了基因的时空差异表达及调...
作者:陈思; 贾楠; 丁明珠; 元英进 期刊:《生物工程学报》 2016年第09期
酮古龙酸杆菌Ketogulonigenium vulgare是维生素C二步混菌发酵过程中的产酸菌。山梨酮脱氢酶(L-sorbosone dehydrogenase,缩写为SNDH)作为维生素C直接前体2-酮基-L-古龙酸(2-KGA)合成的关键酶,其作用机制并不十分清楚。借助全基因组测序抽提2个山梨酮脱氢酶基因,分别位于基因组(缩写为sndhg)和质粒(缩写为sndhp)上。通过工程化改造技术在工业产酸菌中构建山梨酮脱氢酶功能模块,比较其对2-KGA产量的影响。研究发现sndhg过表...