作者:孟岩; 杨彩柏; 姜舒畅; 黄丽丽; 康振生; 詹刚明 期刊:《植物保护学报》 2020年第01期
为开发用于小麦条锈菌Puccinia striiformis f.sp.tritici群体遗传研究的竞争性等位基因特异性PCR-单核苷酸多态性(kompetitive allele specific PCR-single nucleotide polymorphism,KASPSNP)标记,以中国小麦条锈菌流行小种CYR32的基因组为参考,与美国小麦条锈菌流行小种PST78和印度小麦条锈菌流行小种38S102的基因组进行比对,根据比对到的SNP位点设计KASP-SNP引物,用64个中国小麦条锈菌标样对其进行筛选,同时用13对多态性引物组...
利用SSR分子标记技术对西瓜‘W1806’与甜瓜‘M1805’各3个批次及其亲本间的多态性进行引物筛选和种子的纯度鉴定。结果表明,在28对西瓜的SSR引物中,有5对引物在西瓜‘W1806’的F1代与亲本之间有很好的多态性。其中BVWS00839引物特异性好,条带清晰,父母本条带间隔明显,即作为3个批次的西瓜纯度鉴定的引物,其鉴定纯度分别为99.47%、98.96%和97.92%;在18对甜瓜的SSR引物中,只有1对CMBR052引物在F1代扩出的条带为典型的双亲互补型条带...
作者:张妹; 何正权; 马江; 桑子阳; 朱仲龙; 张德春; 马履一; 陈发菊 期刊:《北京林业大学学报》 2019年第09期
【目的】为了解析红花玉兰各品种间的遗传多样性和遗传差异等问题,本研究采用SSR和SRAP分子标记方法对红花玉兰不同品种的遗传多样性水平和遗传分化程度进行评估,以建立其分子标记体系。【方法】以35个红花玉兰品种为实验材料,分别进行SSR和SRAP标记扩增,计算出SSR和SRAP分子标记的各遗传参数。利用NTSYS-pc2.1软件计算各品种间的遗传相似系数并用非加权法(UPGMA)进行聚类分析。通过R语言分析筛选出能够完全区分红花玉兰品种的引物...
作者:张鹤山; 陈志宏; 田宏; 熊军波; 刘洋 期刊:《种子》 2019年第11期
为分析从国内外搜集的白三叶种质资源遗传多样性,采用SSR分子标记技术对49份白三叶种质资源进行遗传多样性研究。利用48对多态性引物扩增出441条谱带,其中多态性谱带439条,多态率高达99.5%;POPGENE分析结果表明,白三叶种质间遗传相似系数范围为0.693~0.842,Shannon信息指数(I)为0.399,平均Nei’s基因多样性指数(He)为0.254,表现出丰富的遗传多样性;通过UPGMA聚类分析,将49份白三叶种质分为四大类,其中来自丹麦的Cllilka和来自中国...
作者:赵彦花; 区又君; 温久福; 李加儿; 周慧 期刊:《南方农业学报》 2019年第09期
【目的】筛选出可用于黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)遗传资源评价及亲缘鉴定的SSR分子标记,为开展其保护遗传学研究打下基础。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对野生黄唇鱼样本进行转录组测序,采用TGICL对转录组数据进行聚类去冗余以获得Unigene,并通过生物信息学方法进行功能注释分类、代谢通路和SSR特征分析等。【结果】黄唇鱼混合组织的转录组测序共获得13.43 Gb数据,经组装并去冗余后获得65047条Unigenes。采用BLAST对...
作者:陈琼; 王兰芬; 唐浩; 邓超; 马莹雪; 刘玉兵; 赵艳杰; 冯艳芳; 韩瑞玺; 刘明月 期刊:《植物遗传资源学报》 2019年第06期
为了保护育种家合法权益、规范种业市场、提高种子市场监管效率等,本研究拟建立一套普通菜豆品种SSR分子标记鉴定体系。首先,遴选12个产地不同、植物学形态差异较大的普通菜豆品种,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选出120对多态性高、条带清晰的SSR引物;然后,利用荧光毛细管电泳技术对筛选出的引物多态性在96个普通菜豆品种中进一步检测,最终获得在菜豆基因组上均匀分布、多态性高、峰型稳定的33对SSR核心引物。在此基础上,依据扩增片段...
作者:王立广; 张翔; 黄贯刘; 汪仁举; 康圣好; 熊延军; 张奎 期刊:《安徽农业科学》 2020年第01期
采用SSR分子标记技术鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度。从48对SSR引物中筛选到2组引物(RM7120、RM8277)。随机选取“荃两优2118”种子6组,每组样品随机取192棵种子苗种进行纯度检测,结果显示同一样品SSR标记与田间鉴定结果接近,最大、最小差异分别为2.05%和0.23%。因此,SSR标记技术适用于“荃两优2118”的种子纯度鉴定。
据2005年第5期《园艺学报》报道中国农业大学园艺植物研究所的科研人员应用SSR方法对金冠、国光、金星等25个苹果品种进行了基因组织多态性分析.从20对引物中筛选出10对多态性较高、稳定性较好、分辨率较高的引物用于正式扩增。结果,
作者:陈志辉; 单睿阳; 林郑和; 游小妹; 钟秋生; 陈常颂 期刊:《茶叶学报》 2015年第04期
利用SSR分子标记技术对福建省选育的福云半同胞系茶树品种遗传多样性进行研究。通过18对SSR引物PCR扩增13个参试品种,共获得108条谱带,其中多态性谱带占67.59%。遗传相似系数分析发现,半同胞系品种间相似系数在0.75-0.91之间,而对照种相似系数在0.68-0.97之间,说明对照种遗传多样性比半同胞系更丰富。13个参试品种聚类结果表明,早春毫等3个对照种与其它品种遗传距离最远,同时这3个品种由于相互间的遗传距离较远而没有聚合成簇;剩余...
作者:武炳超; 张欢; 童磊; 杜昭昌; 胡家菱; 陈燚; 张新全; 刘伟; 黄琳凯 期刊:《草业学报》 2018年第11期
以象草种茎为材料,利用10、20和30Gy剂量的60Co-γ射线照射种茎,筛选适宜诱变剂量并研究其表型性状变异和分子水平上的遗传变异,为象草辐射诱变育种提供理论和技术基础。结果表明,辐射处理后的植株有矮化的趋势,其中分蘖数、茎节数和叶长对辐射最敏感,容易发生变异;在所有诱变系材料中,F30-39和F30-41聚为一类,与对照材料差异最大,是显著矮小化的植株。30Gy诱变系与未辐射的材料间的遗传相似系数在0.3793~0.9655,平均为0.8276,而差...
作者:苗素平 期刊:《信阳农林学院学报》 2017年第02期
本研究以"紫甘1号"杂种一代及其亲本为材料,以CTAB法提取子叶DNA,运用SSR分子标记方法对种子纯度进行鉴定,并与田间纯度鉴定结果进行比较。实验结果表明,引物Bo-005在"紫甘1号"及其亲本间具有多态性,该标记鉴定200株杂种一代,种子纯度为98%,与田间鉴定结果完全一致,可以应用于"紫甘1号"的杂交种纯度鉴定。
种子纯度是杂交水稻种子质量的核心指标。微卫星技术(SSR分子标记技术)因其具有稳定性好、准确可靠、易于操作等优点在种子纯度鉴定中得到了越来越广泛的应用。采用48个SSR分子标记对杂交水稻组合齐两优918的双亲及F1之间的多态性进行筛选和纯度检测技术研究,为种子生产以及种子上市销售做好质量监督,杜绝质量风险。经过筛选得到如下结果:在对48对引物进行筛选后,发现有5对引物在双亲间显示稳定多态性,在杂种F1上表现为父母...
将小牛胸腺DNA通过"浸种培养法"导入小麦品种"藁优9415",其后代在株高、蜡质层、芒型、穗型、壳上有无茸毛、成熟期等几个方面发生大量变异。通过对变异后代的系统选择得到多个稳定的变异种质系;通过对"藳优9415"、D9415-37、D9415-41、D9415-66、牛胸腺DNA的SSR分子标记检测,引物xgwm614、xgwm148、xgwm120、xg-wm46、xgwm239、xgwm357检测出了较丰富的多态性DN段,其中xgwm46、xgwm357在D9415-37、D9415-41基因组DNA中检测...
作者:张赤红; 王述民 期刊:《作物学报》 2005年第05期
利用36对SSR引物对332份国内普通菜豆、16份国外普通菜豆和29份野生菜豆的遗传多样性进行了分析,等位变异数和多样性指数的计算结果显示,3种生态型普通菜豆遗传多样性由大到小的顺序为国内普通菜豆、野生菜豆和国外普通菜豆;我国贵州、云南、黑龙江等省普通菜豆的遗传多样性较为丰富。基于SSR数据,对377份普通菜豆种质资源进行聚类分析,结果聚为6组,其中29份野生菜豆聚到第1组群,与其他样品无任何交叉;国外16份材料中的11...
作者:沙君雪; 迟宝岩; 张金波; 李阳阳; 史琛琛; 倪鹤嘉; 李海涛; 高继国 期刊:《农业生物技术学报》 2018年第06期
大猿叶甲(Colaphellus bowringi)是一种常见的蔬菜害虫,由于目前其全基因组尚未公布,各种相关基因信息无法得知,导致大猿叶甲基因功能研究进展缓慢。本研究利用新一代高通量测序技术结合生物信息学分析,获得了大猿叶甲完整的转录组数据,并将获得的原始数据上传至NCBI获得ID号:SRP125298。共获得40 489条Unigenes,利用Blast X比对NCBI蛋白数据库(NCBI Non-redundant Protein Sequences,NR)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto E...
作者:杜雄明; 潘兆娥; 孙君灵; 周忠丽; 庞保印 期刊:《农业生物技术学报》 2004年第04期
利用花粉管通道技术,将海岛棉(Gossypium barbadense)DNA导入陆地棉(G.hisutum)栽培品种豫棉17号中,获得了HB1、HB2、HB3和HB44个遗传转化系,其纤维品质、衣分、铃重与供体和受体相比有显著的差异。通过145对SSR引物的筛选和鉴定,检测出4对引物的多态性。BNL786、BNL2449等SSR引物在子代变异系HB1~HB4的扩增产物的带型明显不同于其受体,表明海岛棉DNA进入了受体并得到了遗传。海岛棉DNA导入陆地棉的HB5~HB73个子代选系在T2-...
作者:徐振华; 金正勋; 张忠臣; 刘海英; 曲莹; 王俊; 郑艳双 期刊:《作物》 2014年第01期
选用分布于水稻12条染色体上多态性好的44对SSR引物,对黑龙江省近年主栽品种和其他省份粳稻及国外粳稻品种共96份材料进行遗传多样性和群体结构分析,旨在了解黑龙江省水稻品种遗传结构和亲缘关系。结果表明,44对SSR引物共检测到141个等位基因,每个位点1—5个,平均3.2个;遗传相似系数(GS)变化范围为0.46~0.97,平均0.77;试验中第1、2、4、6号染色体SSR位点多态性高,而第12条染色体SSR位点多态性低;利用SSR标记分析...
作者:张帅; 庞玉辉; 王征宏; 王黎明; 陈春燕; 曾占奎; 王春平 期刊:《作物》 2018年第02期
为了解不同小麦种质资源农艺性状变异及其遗传多样性,利用SSR分子标记分析了44份CIMMYT春小麦和45份国内主栽小麦种质资源的遗传变异。结果表明,小麦单株产量、株高和穗粒数的变异系数分别为36.7%、16.4%和15.6%,说明国内外种质材料在表型上存在较大差异。利用20对分子标记对89份小麦种质资源进行了多态性检测,结果显示,共检测到162个等位变异,每对引物检测到等位变异数目为6-9个,平均每对SSR标记能够检测到8.1个变...
作者:汤颋; 任丽娟; 蔡士宾; 吴纪中; 陆维忠; 陈建民; 马鸿翔 期刊:《麦类作物学报》 2004年第04期
纹枯病在我国已成为影响小麦高产、稳产的主要病害之一。为了确定小麦纹枯病抗性基因的位点和数量,本文以单粒传(SSD)方法构建了ARx和扬麦158杂交的F6代重组自交系(RIL)的遗传群体共137个单株,分别在2002和2003年用牙签法和沟带接菌法进行了3次纹枯病抗性鉴定。初步研究结果表明.小麦纹枯病抗性是由主效基因和微效多基因共同控制的。在2D、3A、3B、3D、7D等5条染色体上分析了42个SSR引物.共49个位点.结合回归分析找到10个SSR...
作者:张琳; 王佩佩; 韩雅祯; 许龙伟; 王瑞博; 刘艺平; 孔德政 期刊:《东北林业大学学报》 2019年第03期