作者:范晓东; 李春峰; 刘文明; 周泽扬 期刊:《蚕学通讯》 2005年第03期
转座子是不需要同源重组便能在基因组内和基因组间移动的遗传学顺式元件.mariner是最简单的真核转座子,在昆虫中广泛分布.mariner转座子的转座作用只与转座酶有关,是一种很有发展前景的转基因载体,可以实现异源昆虫间的基因转移,产生稳定遗传的转基因品系.
作者:李姗姗; 迟彦; 李凌飞; 马玺; 平文祥; 于冲; 周东坡 期刊:《中国生物工程》 2005年第07期
启动子是基因表达调控的重要顺式元件,也是基因工程表达载体的一个重要组成部分.启动子的克隆对于构建基因工程载体,表达目的蛋白有着重要的意义.启动子克隆的方法很多,从常用的利用启动子探针型载体筛选启动子到PCR方法的应用,此后相继问世的一些基于PCR法的克隆启动子技术,像Ⅰ-PCR、P-PCR、SSP-PCR、YADE、TAIL-PCR等,为克隆启动子提供了更可靠,更合理的方法.对这几种方法进行了简要综述,比较了不同方法的优缺点,并展望了今后的...
作者:胡朝阳; 唐培培; 邓炎春; 孙伟娟; 姚勤 期刊:《生命科学》 2019年第07期
在真核生物、原核生物及病毒的基因组中存在着调控基因表达的顺式元件,沉默子是其中的一种负调控元件,它能够同反式因子协同作用,抑制靶基因的转录活性,在基因表达调控中发挥重要作用。该文主要对沉默子的特性、结构组成及其分类进行简要总结,对沉默子可能作用机制进行简要综述,最后展望沉默子在遗传工程及人类疾病治疗等领域的应用前景。
作者:梁旭方; 李月琴; 李贵生; 白俊杰; 劳海华; Hiromi; Oku; Hiroshi; Y.OGATA 期刊:《热带海洋学报》 2004年第04期
从血液提取总DNA并构建基因组文库,克隆海水鱼真鲷(Pagrosomus major)脂蛋白脂肪酶(LPL)基因5′侧翼区序列,再通过竞争性聚合酶链式反应(PCR)方法,定量研究饲料中添加不同饱和度脂肪酸对其肝脏LPL基因mRNA表达水平的影响.结果表明,真鲷LPL基因5′侧翼区序列中存在顺式元件过氧化物酶体增殖物反应元件,其序列为TGAAGA-TGACAT,与TATA(CATAA)盒序列相隔211 bp;与喂饲料对照组比较,添加10%油酸可增加真鲷肝脏LPL基因表达水平,但差异并...
作者:马蕾; 王施慧; 刘淑梅; 郎丰庆; 纪复勤; 李利斌; 侯丽霞 期刊:《天津农业科学》 2017年第08期
为了研究番茄和马铃薯CIPK3基因的功能,利用生物学信息学的方法从番茄和马铃薯的基因组中分别鉴定出2个与拟南芥CIPK3同源的基因,并对这些基因的结构特征、系统进化和顺式元件进行了系统分析。结果表明,番茄和马铃薯的2个CIPK3基因均与拟南芥的CIPK3直系同源,且都含有14个外显子,编码区大小相似,编码蛋白预测都位于细胞膜上且含有的基序类型相同;在它们的编码区上游序列中均存在多个激素和逆境应答元件,暗示它们在激素和逆境应答中...
作者:曹齐卫; 刘明毓; 陈伟; 王永强; 杨桂兰; 孙小镭; 李利斌 期刊:《核农学报》 2016年第11期
植物CBL基因在逆境应答及发育过程中具有重要功能。为了挖掘黄瓜CBL基因并预测CBL的功能,利用生物信息学的方法,从黄瓜基因组中鉴定出6个CBL基因,并对其染色体定位、基因结构、系统进化和顺式调控元件进行了系统分析。结果表明,黄瓜的CBL基因有2个分布在2号染色体上,4个分布在3号染色体上,外显子多为8个,编码区序列为603~759 bp。黄瓜CBL编码的蛋白存在一些保守的位点和基序。在黄瓜CBL基因的上游序列中,存在一些应答多种激素和逆...
作者:孙文; 顾文杰; 吴永英; 肖维伟; 王立群 期刊:《生物信息学》 2007年第02期
为了实现基因组中特定基因功能的注释,研究者提出一种新的思路,即利用对目的基因启动子上游的顺式元件的功能的分析,进一步来推断目的基因的功能。在此主要对基因组水平的基因挖掘与功能分析方法及其研究进展进行了探讨。
作者:彭正羽; 张薇; 陈献华; 徐平 期刊:《生物化学与生物物理进展》 2007年第10期
胶质瘤是最常见的脑肿瘤,前体mRNA可变剪接可能在不同类型胶质瘤的发生、恶化以及侵入中发挥作用.参与调控胶质瘤中前体mRNA可变剪接的因素包括顺式元件如内含子剪接抑制序列(ISS)、外显子剪接抑制序列(ESS)等,反式因子包括SRp55、SC35、SF2/ASF、PTB等剪接调节因子.近期的研究进展发现,有多种与胶质瘤相关的基因受到可变剪接的调控,包括肿瘤抑制因子、肿瘤促进因子、酶、受体、离子通道等.因此,研究胶质瘤中的前体mRNA可变剪...
作者:宋国琦; 王兴军; 赵传志; 夏晗 期刊:《农业生物技术学报》 2011年第05期
旨在构建酵母单杂交文库用于筛选与胚柄特异基因G564启动子顺式元件结合的转录因子。本研究根据植物胚柄特异表达基因G564启动子关键序列(GAAAAGCGAA)合成了5次串联重复序列,并与报告质粒pHIS2.1连接构建诱饵载体pHIS2.1-G564-5A;以纯化的拟南芥(Arabidopsis thaliana)幼嫩种子mRNA为模板,合成SMARTTMⅢ和CDSⅢ锚定末端dscDNA;并将dscDNA与线性化融合表达载体pGADT7-Rec2以及诱饵载体pHIS2.1-G564-5A共转化到酵母Y187,构建酵母...
作者:郑琰; 吴量; 黄胜起 期刊:《中国热带医学》 2013年第03期
地中海贫血是一种起源于地中海及东南亚地区的,广泛传播的遗传疾病。现今普遍认为,α及β珠蛋白基因簇的上游顺式元件是调控α及β珠蛋白基因表达的关键因素。然而在过去的十年间,一些由不属于α及β珠蛋白基因簇的基因突变所引起的地中海贫血屡有发生,如ATRX和ATMDS综合症。因此,反式作用因子也逐步引起科学界的注意。现对影响α及β珠蛋白基因表达的顺式元件和反式作用因子及特定的基因突变模式作一概述。
作者:段秋红 赵小英 贺热情 郭明 刘德荣 唐冬英 刘选明 期刊:《生物信息学》 2013年第04期
赤霉素是一类重要的植物激素,它参与调节植物生长发育的各个阶段。真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对拟南芥GA2ox基因家族上游顺式元件的详细分析较少。本研究分析了AtGA2ox基因家族染色体定位、进化关系、蛋白模体以及顺式元件。分析结果表明:AtGA2ox基因家族分为2个亚类;具有相对集中的染色体分布:具有相似的内含子和外显子结构;AtGA2ox基因家族成员进化关系越相近,...
作者:杨宇 李江江 王项 邱冠周 期刊:《生命科学研究》 2011年第03期
报告基因是现代分子生物学研究领域中用于分析结构基因旁侧区域潜在的顺式元件(如启动子、增强子和沉默子等)和反式作用因子相互作用关系的一种重要工具,在解析基因时空表达调控的内在规律中发挥着重要作用,它具有便捷、可靠、灵敏度高和适用于大规模检测等优点.对目前已发展的多种报告基因(氯霉素转乙酰酶、β-半乳糖苷酶、荧光素酶以及荧光蛋白等)在动物、植物、微生物以及医学等领域的应用情况进行综述,为该技术的进一步拓展...
作者:李利斌 李化银 刘国明 刘立锋 高建伟 期刊:《山东农业科学》 2009年第10期
利用比较基因组学的方法从大白菜基因组序列中鉴定出一个新的LEAFY基因BrLFY1,并对它的序列特征、遗传进化和顺式元件进行了分析。结果表明,BrLFY1含有两个内含子,预测编码区为1260bp.编码一个分子量为46.38ku的蛋白。在进化上,BrLFY1与萝卜的RsLFY1关系最近,二者预测编码蛋白的序列一致性高达94.79%。另外,在BrLFY1的上游序列中存在多个激素和逆境应答元件。这说明大白菜LEAF-y基因BrLFYI的表达可能不仅受多种激素的调...
作者:陈伟 范华 刘贤娴 李利斌 王淑芬 期刊:《山东农业科学》 2011年第03期
利用比较基因组学的方法从甘蓝基因组中鉴定出两个CBL基因,并对其结构、遗传进化、顺式元件进行了分析,以期为进一步研究这两个基因的功能和利用它们进行甘蓝抗逆分子育种提供有益借鉴。
作者:袁媛 王月 唐东芹 连芳青 期刊:《植物研究》 2011年第04期
以小苍兰品种"上农金皇后"为研究对象,利用PCR技术和染色体步移技术首次克隆到了ACC合成酶FhACS1基因的全长序列和编码序列。结果表明:FhACS1基因全长为2 576 bp,包含长为433 bp的5′端非编码区序列(5′-UTR)以及长为373 bp的3′端非编码区序列(3-′UTR);开放读码框(ORF)长度为1 371 bp,推定编码457个氨基酸。分析表明,该基因包含3个内含子和4个外显子。序列分析结果显示,FhACS1推导蛋白具备ACS蛋白的7个保守结构域;在氨...
作者:周淑芬 颜静宛 刘华清 林智敏 陈睿 杨绍华 王锋 期刊:《分子植物育种》 2012年第06期
基因的表达与调控是一个复杂的分子网络,受许多转录因子的时空表达调节。Dof蛋白是一类植物特有的转录因子,在多种植物特有生物学过程中起着关键的调控作用。水稻全基因组中发现含30个Dof基因,但对其绝大部分基因的功能尚缺少了解。本研究对30个水稻Dof基因及启动子区进行生物信息学分析,发现OsDof基因上游1.5kb启动子区含有大量的光反应、组织器官表达、植物激素反应及逆境反应等重要的顺式作用元件。进一步通过荧光定量RT-PCR技...
作者:张永涛 刘立峰 李化银 张一卉 王焕芹 王凤德 高建伟 李利斌 期刊:《山东农业科学》 2012年第12期
利用大白菜已知CBL基因序列,在公共核酸数据库中重新搜索比对大白菜的基因组序列,鉴定出3个新的大白菜CBL基因,并对这3个基因的结构、遗传进化和顺式元件进行了分析,为进一步克隆和研究这些基因的功能提供了有益借鉴。
作者:范华 马妍 孙凡 王琳 黄晓明 期刊:《山东农业科学》 2012年第08期
利用比较基因组学的方法从马铃薯基因组中鉴定出一个与AtCBL9直系同源的基因StCBL9,并对该基因的结构、遗传进化、顺式元件进行了分析,为下一步研究该基因的功能和利用其进行马铃薯抗逆分子育种提供了有益借鉴。
作者:李化银 姜常松 张一卉 高建伟 李利斌 曹齐卫 期刊:《山东农业科学》 2014年第12期
CBL1基因在植物非生物逆境应答及发育过程中具有重要功能。本试验在解析大白菜、甘蓝和黑芥CBL1的基础上,对它们进行了系统地比较分析,为进一步研究CBL1基因在芸薹属植物中的分子进化和功能奠定基础。
作者:李利斌 刘明毓 纪复勤 孙建磊 王崇启 肖守华 董玉梅 焦自高 期刊:《山东农业科学》 2015年第09期
OST1在植物ABA信号转导、非生物逆境应答和生长发育过程中具有重要功能,但有关甜瓜OST1的研究尚未见报道。本研究利用比较基因组学的方法从甜瓜基因组中鉴定出2个与拟南芥OST1直系同源的基因,并对它们的序列特征、遗传进化和顺式调控元件进行了系统分析。结果显示,这2个基因位于不同的染色体上,均含有9个外显子,编码蛋白的序列一致性为80.38%,且与黄瓜相对应的同源基因序列高度保守。二者的上游序列都含有多个应答不同激素和逆境的...