作者:刘爱霖; 吴志国; 江鑫; 赵明源; 杨宗政 期刊:《微生物学报》 2020年第01期
【目的】从电镀厂下水道的淤泥中分离筛选Cr(Ⅵ)高效还原菌,并对其生长和还原特性进行研究,以期为Cr(Ⅵ)污染的生物修复提供优质的菌种资源和应用参考。【方法】采用富集培养法从淤泥中分离、筛选出Cr(Ⅵ)还原菌,通过生理生化及16S rRNA基因序列分析进行初步鉴定。采用单因素实验确定菌株的最佳培养条件和抵抗胁迫环境的能力,利用外加电子供体改善菌株的Cr(Ⅵ)还原能力,筛选出最佳电子供体研究对菌株还原的影响。【结果】经分离筛...
作者:陈梦; 朱玲燕; 黄真; 葛宇清; 张光霁; 程汝滨 期刊:《中草药》 2019年第22期
目的建立三斑海马Hippocampus trimaculatus的COI、16 S rRNA和ATP6的条形码序列数据库,应用DNA条形码技术从分子水平快速准确鉴定三斑海马和其他正伪品海马,探讨海马属药材鉴定的新方法。方法提取三斑海马药材的基因组DNA,PCR扩增COI、16 S rRNA和ATP6的序列并进行双向测序,所得序列采用软件Codon Code Aligner V4.2对测序峰图进行校对拼接,应用Clustal X软件进行序列比对,MAGA 5.0软件计算三斑海马的种内种间遗传距离(Kimura 2-P...
作者:黄钟洲; 杨艳君; 黄平; 杨勇斌; 管大伟 期刊:《生物学通报》 2010年第04期
采集空气环境微生物,根据菌落和革兰氏染色特征,分离5株细菌。提取分离株DNA,采用设计的16S rRNA引物扩增DN段;纯化PCR产物,进行测序反应并再纯化,上机读序。拼接与校对DNA序列,在NCBI网站进行Blast,鉴定细菌型别。5株菌株分别是表皮葡萄球菌、头状葡萄球菌、施氏假单胞菌、溶血葡萄球菌和大肠杆菌;其中溶血葡萄球菌是致病菌,其他4株是条件致病菌。这提示,应警惕空气环境中致病菌的感染。
作者:柯吴坚; 黄澍杰 期刊:《皮肤性病诊疗学》 2017年第04期
近年来我国神经梅毒(NS)发病呈增长趋势。神经梅毒可发生于梅毒病程各阶段。早期神经梅毒症状轻微或无症状,采用脑脊液(CSF)免疫、生化指标诊断的特异性和敏感性低,易造成误诊和漏诊,影响正确治疗,使其可能发展为晚期梅毒,甚至危及患者生命。临床迫切需要一种敏感性、特异性更高的早期神经梅毒诊断的方法。本文综述并比较多种神经梅毒CSF检测方法,提示16S rRNA PCR具有直接检测梅毒螺旋体(TP)、区分TP存活状态并判断疗效、不...
作者:李俊乐; 高惠; 滕丽微; 刘振生 期刊:《野生动物学报》 2020年第01期
通过高通量测序技术,对采自贺兰山的20只阿拉善马鹿粪便进行测序及菌群多样性分析。结果表明,20个样品共获得1564112条序列,有效序列1399562条和2740个OTUs。其中样品包含24个门和283个属,在门水平上核心菌门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)76.71%、拟杆菌门(Bacteroidetes)14.16%、变形菌门(Proteobacteria)3.51%。在属水平上,核心菌属有11个,占肠道菌群的31.46%,分别为孢子杆菌属(Sporobacter)7.38%、拟杆菌属(Bacteroides)4.15%、...
作者:程丽芬; 樊兰英; 张欣; 马学文; 杨斌; 郑军; 芦冬涛 期刊:《微生物学通报》 2019年第12期
【背景】人工湿地处理煤炭矿井废水效果显著,而关于人工湿地沉积物的细菌群落结构和特征研究较少。【目的】阐明人工湿地净化采煤区废水的效应和细菌群落结构及特征。【方法】对山西省左云县采煤区人工湿地不同采样点水质进行监测,利用高通量测序技术对人工湿地沉积物中细菌16S rRNA基因V3−V4区进行测序,分析沉积物中细菌群落组成。【结果】采煤区废水流经人工湿地后水质得到有效改善,其中生化需氧量(Biochemical oxygen demand,B...
作者:刘梦婷; 王帅帅; 廖文仪; 柳亦松 期刊:《中兽医医药》 2019年第06期
通过提取目标微生物基因组DNA,使用16S rRNA高通量测序法分析,获得一例人用益生菌16S rRNA高通量测序结果及其群落组成、Alpha多样性、Beta多样性、差异物种及其它物种间的相关性的具体信息。结果显示,此菌群主要分属于3个菌门,其中变形菌门(Proteobacteria)是主要菌群,占比84.79%,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)分别占7.8%、6.35%。这些菌群的主要功能有调节肠道功能,而且与宿主的脂肪代谢有很大关联,同时变形菌...
作者:乔连江; 张萍; 程悦宁; 刘泽余; 张海威; 周玉成; 周曼丽; 徐莉; 侯庆丰; 杨艳玲 期刊:《黑龙江畜牧兽医》 2019年第23期
为了分离鉴定引起吉林省某规模化梅花鹿养殖场仔鹿腹泻而死亡的病原体,试验采用病理剖检、RT-PCR检测、基因序列分析、细菌分离培养、16S rRNA测序和药敏试验等方法对引起仔鹿腹泻的病毒和细菌进行了研究。结果表明:仔鹿肺脏气肿出血,肠胀气溃疡,肾脏皱缩,脾脏和肝脏出血。经RT-PCR扩增,在7份样品中均检出牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)Ⅰ型和Ⅱ型。7份样品中检测得到的BVDVⅠ型毒株之间和Ⅱ型毒株之间的同源...
作者:方振华; 代小梅; 丁利; 洪美玲 期刊:《中国畜牧兽医》 2019年第10期
为探明海口某龟鳖养殖场送检的发病中华草龟的病原,本试验从患病中华草龟体内分离得到一株优势生长菌(命名为J1)。经菌落培养、革兰氏染色观察、生理生化鉴定及16S rRNA序列比对分析,并进行攻毒及耐药性试验验证其致病性及药物敏感性。结果显示,该分离菌株在普通营养琼脂培养基上形成圆形、光滑、湿润黏稠、灰黄色、不透明的菌落;革兰氏染色镜检结果显示,该分离菌为革兰氏阴性短杆状;生理生化试验结果显示,分离菌具有运动性,果糖、...
作者:李佛生; 钟雁翎; 吴顺康; 冯岚清; 胡舒昶; 汪红; 樊佳 期刊:《实验室科学》 2019年第05期
通过富集培养后从鱼体表分离得到了有活性的蛭弧菌,双层平板培养后能出现明显的透明状噬菌斑;用银染法染色后观察到蛭弧菌呈逗点状,同时观察到蛭弧菌的连续运动状态;通过16S rRNA基因序列的同源性分析结果表明,分离到的鱼体表蛭弧菌与大多数典型蛭弧菌的同源性均较高,最高达99%,可以分类到Bdellovibrio属。该实验内容与生活贴近且涉及实验技术广泛,有助于激发学生的实验热情,促进创新型人才的培养,也为今后在微生物学实验教学中开...
作者:江地科; 项明源; 王印; 姚学萍; 杨泽晓; 张鹏飞; 廖倡宇; 朱光恒; 姜睿娇 期刊:《中国预防兽医学报》 2019年第10期
为探究引起四川省某规模化猪场哺乳仔猪死亡病原,本研究从病死哺乳仔猪心脏中分离到一株革兰阳性菌,将其命名为SN1711,对该菌进行形态学观察、生化鉴定、16S r RNA测序鉴定、小鼠致病性试验、药敏试验及部分耐药基因检测。结果显示,该分离株鉴定为猪源蜡样芽孢杆菌(B.cereus),16S rRNA基因序列与Gen Bank中B.cereus B158 (KF494191.1)相似度为98.13%,对小鼠致病性强。药敏试验显示分离株对氨基糖苷类、四环素类、喹诺酮类药物敏感,...
作者:张生元; 艾桃山; 喻运珍; 罗杨志; 邓平; 张立强; 周伟东; 余少梅; 张浔 期刊:《水产科技情报》 2019年第06期
为探索养殖鳜细菌性疾病的防治方法,从湖北省某养殖场患烂鳃病鳜鱼体内分离出一株柱状黄杆菌。经形态学观察、16S rRNA基因序列测定,确定其为柱状黄杆菌。为确定10种中草药对鳜源柱状黄杆菌的抑菌效果,分别采用10种中草药的水提物进行抑菌试验。试验结果表明,诃子、乌梅、连翘、五倍子有较好的抑菌效果,其中诃子抑菌效果最好;五味子、秦皮、鱼腥草、牡丹皮、青蒿、穿心莲的抑菌效果较差。本研究可为开发中草药防治鳜柱形病提供一定...
作者:杜宇佳; 高广磊; 陈丽华; 丁国栋; 张英; 曹红雨 期刊:《中国环境科学》 2019年第11期
以呼伦贝尔沙区裸沙地、草地、沙地樟子松(Pinus sylvestris var.mongolica)人工林和沙地樟子松天然林四种生境土壤为研究对象,采用野外调查、16S rRNA基因高通量测序和PICRUSt功能预测相结合的研究方法比较分析不同生境土壤细菌群落结构和潜在功能组成特征.结果显示:呼伦贝尔沙区沙地樟子松天然林土壤细菌多样性最高,人工林土壤细菌多样性最低,Shannon指数分别为(8.623±0.193)和(7.432±0.028),不同生境土壤细菌alpha和beta多样性...
作者:邓惠文; 刘峰; 李桂豪; 包卫洋; 邹松保; 郑鹏飞; 龚骏; 孙汝江 期刊:《海洋与湖沼》 2019年第06期
作者:郑媛媛; 张良; 马国英; 董春忠; 王加芬; 王月玲 期刊:《中华医院感染学》 2019年第21期
作者:赵志霞; 许翠; 安美玲; 魏小晶; 廖宁; 倪永清; 张艳 期刊:《食品科学》 2019年第22期
采用多重聚合酶链式反应指纹图谱结合16S rRNA基因测序技术对新疆喀什地区维吾尔族母乳分离的双歧杆菌进行鉴定和遗传差异分析,并检测常规生理生化和糖代谢表型特征,同时测试菌株对6种常见病原菌和3种母乳源条件致病菌的抑菌性能和对胃肠液的耐受性。结果显示,15份母乳样品中共分离15株双歧杆菌,测序结果将菌株归属于3个种以及2个亚种,包括8株假小链双歧杆菌(Bifidobacterium pseudocatenulatum)、2株短双歧杆菌(B.breve)、2株长双...
作者:宋晶; 马景微; 曹谨玲; 刘少贞 期刊:《北方农业学报》 2016年第03期
利用分子手段进一步明确了螯虾科的系统进化关系。以螯虾科18个物种的线粒体基因序列为材料,利用其12S rRNA和COⅠ基因序列,并选用普通滨蟹(Carcinus maenas)为外群,应用MEGA 6.0软件,采用邻接法和最大似然法构建分子系统进化树,基于Kimura双参数模型计算螯虾科种间遗传距离。根据树形拓扑结构分析发现,所得结果与形态学建立的螯虾科的分类体系基本一致。
作者:王兰萍; 耿荣庆; 王伟; 邓乔文; 徐永新; 陈钥 期刊:《家畜生态学报》 2013年第02期
在提取黄牛肉、牦牛肉和水牛肉总DNA的基础上,设计通用引物进行PCR扩增,电泳回收PCR产物后双向测序,再通过构建系统进化树鉴别牛肉的物种来源。PCR扩增获得的牦牛、水牛12SrDNA基因片段大小都为440bp,黄牛12SrDNA基因片段大小都为439bp。参照引用的不同牛种12SrDNA基因序列,构建的系统进化树能够清晰地鉴别测序样品的牛种来源。因此,结合运用PCR扩增和DNA测序技术是一种精确可靠的方法,能够有效地运用于牛肉的种源鉴别。
作者:陈淼; 王羽骋; 郑小坚; 薛仁宇 期刊:《江苏蚕业》 2005年第02期
通过PCR技术,对中国山东青州野桑蚕mtDNA的12S rRNA基因进行了克隆和序列分析。结果表明,青州野桑蚕12S rRNA基因为788nt,在DNA水平上,与家蚕12S rRNA基因的同源性达到99%,与中国陕西安康、日本筑波来源的野桑蚕12S rRNA基因的同源性分别为97%、98%;分子进化分析显示,家蚕可能是起源于中国野桑蚕。
作者:李重阳; 孟庆玲; 乔军; 伍晔晖; 王力霞; 郭晶; 马帅; 才学鹏 期刊:《畜牧与兽医》 2018年第04期
为了解石河子地区犬埃立克体的流行状况,本研究从石河子市宠物医院及周边地区采集犬血液和体表寄生蜱,利用间接ELISA对采集的血清样品进行血清学调查,并通过PCR扩增犬埃立克体16S rRNA基因和及系统进化分析进行其分子流行病学调查。血清学检测结果显示,犬埃立克体抗体阳性率为22.40%,表明石河子地区犬中存在埃立克体的感染。从犬体表蜱样本中扩增出埃立克体452 bp特异片段,测序和比对结果证实这些片段为犬埃立克体;遗传进化分析显...