ISSR分子标记技术是近年发展而来的一种DNA多态性分子标记,具有简单、经济、信息量大、稳定性高等特点。本文论述了ISSR的反应原理及ISSR实验过程中的技术要点.并总结了ISSR在植物品种鉴定、亲缘关系分析,群体遗传结构、遗传多样性检测,以及植物育种研究中的应用。
作者:赵文溪; 刘莹; 于超勇; 王丽娟; 宋爱环; 刘洪军; 张树东; 官曙光 期刊:《广西科学院学报》 2019年第04期
为进一步了解山东省内大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)群体遗传背景和分化情况,合理保护与开发利用渔业资源,选取线粒体控制区(CR)和细胞色素b基因(Cytb)对分布于山东省近海沿岸的3个大泷六线鱼野生群体以及北黄海1个离岸大泷六线鱼野生群体的线粒体基因序列进行对比,分析它们的序列特征、遗传多样性和种群历史动态情况。经PCR扩增得到大泷六线鱼野生群体的CR和Cytb基因序列,全长分别为485bp和651bp。基于CR基因序列共检测到40个多...
作者:鄢家俊; 白史且; 张新全; 常丹; 游明鸿; 张昌兵; 李达旭 期刊:《草业学报》 2010年第04期
基于SRAP和SSR分子标记分析了青藏高原东南缘8个老芒麦自然居群遗传变异及群体遗传结构,获得下述结果:1)16对SRAP引物在90个单株中共扩增出384条可统计条带,其中多态性条带334条,占86.98%;16个SSR位点共检测出等位变异221个,平均每个位点13.8个,其中具有多态性的位点数192个,占86.88%。2)2种分子标记检测到老芒麦居群水平的基因多样性(H)分别为0.1092和0.1296,而物种水平的基因多样性达0.2434和0.3732。3)...
作者:卢媛; 艾为大; 韩晴; 王义发; 李宏杨; 瞿玉玑; 施标; 沈雪芳 期刊:《作物学报》 2019年第02期
为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过聚类分析UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic means)方法在遗传相似系数0.64处将87份糯玉米自交系划分为4个类群,分别包含9、66、10和2份材料。此外,利用Structure群体遗传结构分...
作者:刘慧芬; 张超; 王静; 顾钱洪; 周传江; 孟晓林; 张建新; 宋东蓥; 李学军; 孔祥会; 聂国兴 期刊:《中国水产科学》 2018年第02期
为准确掌握河南野生宽鳍鱲(Zacco platypus)群体遗传结构,本研究利用线粒体COI基因检测了海河、黄河、淮河和长江水系宽鳍鱲群体的遗传多样性和种群分化情况。110个样品共检测出40个单倍型,平均单倍型多样性为0.92077,平均核苷酸多样性为0.02439。AMOVA分析显示,大多数遗传变异存在于宽鳍鱲群体间(60.59%),群体内的遗传变异为37.67%。系统发育树结果表明,长江水系宽鳍鱲群体遗传分化较大,一部分群体单独聚为一支,另外一部分群体与...
作者:曲若竹; 侯林; 吕红丽; 李海燕 期刊:《遗传》 2004年第03期
群体遗传结构上的差异是遗传多样性的一种重要体现,对群体遗传结构的研究已有较久的历史,而其中的基因流研究近些年来越来越受到重视.它对群体遗传学、进化生物学、保护生物学、生态学有着极其重要的作用.虽然传统的群体遗传学能估测基因流大小,但它的精确性还有很大局限性.随着生物技术的进步,对基因流的研究逐渐向分子水平过渡,应用蛋白质电泳技术、分子标记技术(RAPD、RFLP、VNTR、ISSR、DNA测序等)方法对群体间基因流的流动水...
作者:黄树文; 张哲; 陈赞谋; 袁晓龙; 李加琪; 张豪 期刊: 2018年第06期
本研究以广东省现有的5个地方猪品种为对象,利用SNP芯片进行SNP分型,对比欧洲野猪、亚洲野猪以及4个西方商业猪种,对广东省现有地方猪品种的遗传多样性、遗传距离以及群体结构进行分析。结果表明:两广小耳花猪、大花白猪和蓝塘猪的遗传多样性低于西方商业猪种以及粤东黑猪和梅花猪;广东省地方猪与亚洲野猪遗传距离较近,与西方猪种遗传距离较远;作为大花白猪一个类群的梅花猪与大花白猪遗传距离较远,主成分分析以及Structure分析表...
作者:易润华; 梁承邺; 朱西儒; 周而勋 期刊:《华南农业大学学报》 2004年第03期
运用RAPD分子标记技术分析了广东省水稻纹枯病菌的群体遗传结构.研究结果表明,水稻纹枯病菌存在遗传分化现象(G=0.165 8).分子方差分析表明群体遗传多样性在广东省地区间、地区内以及县市内3个水平分布,群体遗传分化在地区间的水平非常低(φST=0.038),地区内的遗传分化程度较高(φST=0.240),遗传分化主要来源县市内菌株的遗传变异(φST=0.269),占总群体遗传多样性的73.07%.Mantel分析表明地理距离和遗传距离间缺少相关性,群体分化不符...
作者:武星彤; 陈璐; 王敏求; 张原; 林雪莹; 李鑫玉; 周宏; 文亚峰 期刊:《生物多样性》 2018年第11期
丹霞梧桐(Firmiana danxiaensis)是分布于我国韶关地区北部丹霞地貌的特有物种, 其分布范围狭窄, 种群数量小。本文利用EST-SSR分子标记位点, 分析丹霞梧桐群体(丹霞山组群和南雄组群)的遗传多样性和遗传结构, 研究群体的分化历史, 探讨该物种的可能分布和科学保护策略。结果表明: 丹霞梧桐总的遗传多样性中等(Ht = 0.631), 群体内遗传多样性较高(Hs = 0.546), 遗传变异主要存在于群体内(79.66%), 但不同地理组群间存在显著的遗传...
作者:高天翔; 王志杨; 宋娜; 宋林 期刊:《海洋与湖沼》 2019年第01期
密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,86尾个体序列的变异位点数为38个,共定义了28个单倍型;3个密斑马面鲀群体的单倍型多样度和核苷酸多样度均较高,且相差不大;密斑马面鲀群体间未检测到显著的群体遗传结构,分子方差分析表明,99.67%的...
作者:曹学仁; 车海彦; 罗大全 期刊:《植物保护》 2019年第02期
白粉病是海南橡胶树上发生最严重的叶部病害,为了明确海南橡胶树白粉菌群体的遗传结构,本研究对海南7个市(县)的橡胶树白粉菌的ITS序列进行分析。结果表明,95个病菌样品可推导出5种单倍型,其中单倍型H1包含样品数为88个,且在7个市(县)均有分布;三亚种群的单倍型多样性和核苷酸多样性最高。总体和各地理群体的中性检验结果显示,群体扩张遵循中性进化,群体大小保持相对稳定。遗传分化指数(Fst)表明三亚种群与白沙、儋州、海口和琼中...
作者:李娜; 王钦德 期刊:《水产科技情报》 2005年第01期
RAPD技术是在PCR基础之上发展而来的一种DNA多态性检测方法,具有方便、快捷、经济等特点.概述了RAPD的反应原理及特点,总结了RAPD在水产动物群体遗传结构分析、亲缘关系分析和基因图谱构建等方面的作用,并肯定了RAPD技术在水产动物中的应用前景.
作者:邓继贤; 夏利; 刘贵贤; 陈家贵; 苏家联; 梁彩梅; 邓晓恬; 薛青松; 杨祝良; 蒋和生; 杨秀荣 期刊:《中国家禽》 2016年第15期
为探讨广西六画山鸡的群体遗传结构,利用微卫星标记技术分析18个微卫星位点的多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho),利用卡方检测群体在18个位点的平衡状态。结果显示,广西六画山鸡群体的平均PIC为0.4945;平均Ne为2.4787个;平均He为0.5537;平均Ho为0.5182。18个微卫星位点有4个位点处于Hardvweinberg不平衡状态(P〉0.05)。说明广西六画山鸡具有较丰富的遗传多样性,具有继...
作者:袁文娅; 孙振宇; 梁丹; 时晓伟; 陈静; 张梅茹; 马占鸿; 刘秀峰 期刊:《山东农业科学》 2017年第06期
为了解贵州省小麦条锈菌群体的遗传多样性,本研究采用扩增片段长度多态性标记(AFLP)对其进行研究。结果显示:贵州省6个县市分离到的128个小麦条锈菌单孢子堆分离物中共获得32个AFLP基因型,没有检测到频率占绝对优势的AFLP基因型,其中1个AFLP基因型(zy6)频率(0.195)较高,AFLP基因型频率介于0.050~0.100的有3个,其余28个AFLP基因型的频率均低于0.050。香农系数及Φpt方法均显示亚群体间遗传差异不明显;Mantel test显示小麦条锈...
作者:李杨; 李河; 周国英; 蒋越西; 蒋仕强; 刘君昂 期刊:《植物保护》 2017年第03期
暹罗刺盘孢菌是油茶炭疽病病原之一,在我国多个油茶产区均有分布。研究油茶暹罗刺盘孢菌群体遗传结构可为全面、有效防治油茶炭疽病害提供理论依据。本研究对分离自海南、江西、湖南、广西4省(自治区)6个地区暹罗刺盘孢菌菌株的ITS、CAL和GAPDH 3个基因的序列进行群体遗传结构分析。根据拼接的上述3个基因的序列,57个暹罗刺盘孢菌菌株可定义为13个单倍型,其中单倍型H7为主要单倍型,分布于本研究所涉及的所有地区。病菌不同地理种...
作者:崔光艳; 付立霞; 王柳富; 魏文志 期刊:《淡水渔业》 2017年第03期
为了解长江下游地区10个水体脆弱象鼻溞群体的遗传结构,研究测定了脆弱象鼻溞(Bosmina fatalis)线粒体16SrRNA基因序列,结果显示,100个样本中共有8个变异位点,定义了9个单倍型,单倍型多样性(Hd=0.284)和核苷酸多样性(Nd=0.000 76)均较低。AMOVA分子变异分析结果表明,脆弱象鼻溞遗传分化主要来自群体内,占93.33%,群体间的变异低,占6.67%。Fst值统计检验表明,各水体之间遗传分化不显著。系统发育树和中介网络图说明脆弱象鼻溞...
2016年9月26日,从中国林学会获悉,广西林科院刘海龙《基于叶绿体基因分析的大叶榉(榆科)遗传多样性,群体遗传结构及对保育工作的启示》获第六届梁希青年论文三等奖。
作者:董杰; 张金良; 杨建国; 张昊; 冯洁 期刊:《植物保护》 2016年第06期
本文分析了北京市与河北省小麦赤霉病菌群体遗传结构以及基础生物学特性。结果表明所有菌株均为禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum),属于一个大的单一群体,群体内具有较高的遗传多样性。毒素化学型测定表明,北京与河北地区小麦真菌毒素污染的主要风险为DON与15ADON毒素。表型测定显示,与F.asiaticum群体相比,F.graminearum具有较高的产孢能力,而生长速率和产毒能力较低。该群体对主要杀菌剂多菌灵、戊唑醇和氰烯菌酯均无抗药性。
作者:刘秀峰; 袁文娅; 梁丹; 时晓伟; 马占鸿 期刊:《云南农业大学学报·自然科学》 2016年第05期
为探明小麦条锈菌滇黔群体菌源关系,利用扩增片段长度多态性标记对云南、贵州具有不同 AFLP基因型的 71个小麦条锈菌分离物 (云南 39个,贵州 32个)进行了遗传结构分析。结果表明:小麦条锈菌云南和贵州群体共享 AFLP基因型达 323%;AMOVA分析显示:小麦条锈菌云南和贵州群体间的遗传变异仅占总变异的 7%;最大简约树枝长评估揭示小麦条锈菌滇黔群体自由重组的可能性较低。因此,小麦条锈菌滇黔群体...
作者:郑彬; 汤林华; 马雅军; 王学忠; 施文琦; 周水森 期刊:《热带医学》 2007年第06期
目的研究云南不同地理来源微小按蚊的群体遗传结构,探讨不同群体间的遗传结构和分化现象。方法在云南省东、西、南、北及中部各选择1~2个自然村,用紫外诱蚊灯于每晚17时至次日7时诱蚊,收集雌成蚊以氯仿麻醉,经形态学鉴别为微小按蚊的样本取单蚊蚊腿,再经复合PCR方法鉴别微小按蚊A或C。采用微卫星锚定PCR技术(SSR-PCR)扩增微小按蚊单蚊基因组DNA,用BIOSIS,RAPDFST,RAPDDIST及PHILIP等软件统计分析基因位点多态性、固定指数FST及θ...