作者:刘进; 姚晓云; 王嘉宇; 李慧; 周慧颖; 黎毛毛 期刊:《分子植物育种》 2019年第21期
为了发掘和利用新的高产相关的穗部结构性状的QTL,本研究以粳型超级稻‘龙稻5’和典型高产籼稻‘中优早8’杂交衍生的重组自交系群体为试验材料,在早、晚季生态环境下对水稻穗部结构性状进行QTL分析。早、晚季环境下穗部结构性状存在明显的变化,晚季环境下穗部产量性状优势明显,早、晚季环境下穗部结构性状间存在显著或极显著的相关性;共检测到61个穗部结构性状相关的QTL,仅13个QTL能在早、晚季环境下稳定表达,早、晚季环境下检测...
作者:张朝红; 陈东玫; 杨凤秋; 赵同生; 李扬; 赵国栋; 赵永波 期刊:《华北农学报》 2019年第05期
为了定位苹果果锈的QTL,鉴定果锈基因的遗传位点,以解析苹果果锈基因的分子遗传基础。以宫崎短枝富士×坂田津轻分离群体及其亲本为材料,基于SLAF-seq技术开发分子标签,并构建高密度遗传图谱,结合3个年份的田间表型数据,采用mapqtl进行果锈基因的QTL分析。结果表明,获得了522 122 315 reads(110.32 Gb)的测序数据,测序平均Q30为95.07%,平均GC含量为40.11%;开发了20 440个SLAF标签,7 309 729个SNP;构建了17个连锁群,4 075个上图标记,...
作者:张东营; 辛艳; 刘桃菊; 韩立根 期刊:《科技创新导报》 2015年第33期
该研究以二棱春性大麦(Hordeum vulgare L.)Prisma和Apex为亲本所建立的94个重组自交系为材料,采用复合区间作图法对3个氮素环境中大麦重组自交系最终株高进行QTL定位分析,试验结果发现q PH3-2是在3个氮素环境中均被检测到的主效基因,该基因定位在第3染色体的E38M50-242-E38M54-158标记区间。
作者:张立平; 葛秀秀; 何中虎; 王德森; 闫俊; 夏先春; MarkWSutherland 期刊:《作物学报》 2005年第01期
多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)是引起面团(片)颜色褐变的主要原因。利用122对SSR引物、4对贮藏蛋白STS引物和10对AFLP引物组合,分析了中优9507×CA9632的71个DH系的基因型,构建了由173个位点组成的遗传连锁图,在小麦21个连锁群上覆盖2881cM。将该群体种植于3个环境,采用复合区间作图法(CIM)进行了PPO活性的QTL分析。结果表明,控制籽粒PPO活性的主效QTL有2个,分别位于染色体2AL和2DL上,贡献率分别为37.9%~50.0%和...
作者:沈圣泉; 庄杰云; 包劲松; 郑康乐; 夏英武; 舒庆尧 期刊:《农业生物技术学报》 2005年第01期
利用籼稻(Oryza sativa sp indica)协青早B/密阳46所构建的重组自交系(RIL)群体(XM-RIL)及其相应分子遗传图谱,在海南和杭州两地试验,测量分蘖最大角度,应用检测QTL加性效应、上位性效应和G×E互作效应遗传分析方法,对该性状2个环境下数据进行联合分析.共检测到2个加性效应显著的QTLs,其中,qTA8-2的LOD值为21.7,贡献率为23.2%;qTA9-2的LOD值为22.0,贡献率为19.5%;增加分蘖最大角度的基因前者来自母本、后者则来自父本;这2个QTLs均不...
作者:杨洛淼; 王敬国; 刘化龙; 孙健; 郑洪亮; 邹德堂 期刊:《作物》 2014年第06期
为定位水稻发芽期和芽期耐冷性的加性QTL和上位性QTL,本试验以粳稻品种空育131和东农422构建的F7代重组自交系(RIL)190个家系为作图群体,利用104个SSR标记构建遗传连锁图谱,利用完备区间作图法分别对低温发芽力和芽期耐冷性进行QTL定位并分析其加性效应和上位性效应。结果检测到控制芽期耐冷性的1个加性QTL位于4号染色体上,贡献率为16.84%;17个控制低温发芽力的加性QTL分别位于第1、2、3、6、7、9、12染色体上,贡献率为5.64%~35....
作者:刘进; 姚晓云; 余丽琴; 李慧; 周慧颖; 王嘉宇; 黎毛毛 期刊:《植物学报》 2019年第04期
种子耐储藏特性是粮食作物的特殊农艺性状之一,耐储藏性能对种子生产和种质资源保存有重要意义。以粳型超级稻龙稻5(LD5)和高产籼稻中优早8(ZYZ8)杂交衍生的重组自交系(RILs)群体(共180个株系)为实验材料,自然高温高湿条件下放置1年、2年和3年后,对不同储藏时段种子发芽率进行比较,并利用223个分子标记的遗传图谱进行动态QTL鉴定。结果表明,不同储藏时段龙稻5的发芽率均显著低于中优早8,株系间耐储性存在较大差异;不同储藏时段发芽...
作者:刘进; 黎毛毛; 姚晓云; 王棋; 李慧; 王嘉宇 期刊:《江西农业大学学报》 2018年第03期
为分析不同遗传世代QTL定位结果的差异,鉴定新的稳定表达的主效QTL,为水稻高产和穗型性状育种提供参考信息。以沈农0530-9和北陆129杂交衍生的F2群体和F2∶3家系为试验材料,对穗部性状和籽粒大小性状进行QTL(Quantitative trait loci)分析。共检测到47个穗粒性状相关的QTL,分布于12条染色体上,F2和F2:3群体分别均检测到30个QTL,2个群体检测到的QTL的LOD值、贡献率和效应值存在明显差异,仅有13个QTL能在2个群体中稳定表达;QTL存...
作者:肖卫国; 祁赞梅; 李莉; 王若梅; 陈洋; 陈东; 都姝岩; 范晨玲; 姜奕 期刊:《中国免疫学》 2004年第02期
目的:定位NZB、NZW及NZB/W F1小鼠外周血B1细胞增殖的易感基因.方法:建立(NZB×NZW)F1×NZB回交小鼠模型,用覆盖小鼠全部常染色体的多态性微卫星遗传标记数量性状位点(QTL)分析进行基因定位.结果:B1细胞增殖的易感基因与小鼠的第2、4、17号染色体上的微卫星遗传标记D2Mit 101、D4Mit 11及D17Mit 61肯定连锁(Lods值>3),其中D2Mit 101、D4Mit 11位点来源于NZB,D17Mit 61位点来源于NZW.在D2Mit 101位点附近存在Ltk、Rag1、2基因,在D4Mi...
作者:韩龙植; 乔永利; 曹桂兰; 张媛媛; 安永平; 芮钟斗; 高熙宗 期刊:《中国水稻科学》 2005年第02期
以籼粳交"密阳23/吉冷1号"的F2:3代200个家系为作图群体,构建分子连锁图谱,并进行了F3代家系的生长早期耐冷性鉴定和QTL分析.结果表明,幼苗期耐冷性、分蘖期耐冷性和低温下幼苗生长能力等生长早期耐冷性在F3代表现为近似正态的连续分布,是由多基因控制的数量性状.在第1、5、9染色体上分别检测到与幼苗期耐冷性相关的QTL各1个,其中qCTS1对表型变异的解释率最大,达15.5%;在第2、3、7、9、11染色体上分别检测到与分蘖期耐冷性相关的QT...
作者:王棋; 范淑秀; 郭江华; 陈兆赫; 梁银培; 刘振宇; 殷业超; 王嘉宇 期刊:《华北农学报》 2019年第01期
为定位水稻发芽期和苗期耐冷性的QTL,鉴定新的耐冷基因位点,丰富水稻耐冷性的分子遗传基础。以籼型杂交稻恢复系品种泸恢99(Luhui 99,R99)和粳型超级稻品种沈农265(Shennong 265,SN265)杂交衍生的144个F8稳定遗传的重组自交系群体(Recombinant inbred lines,RILs)为试验材料,以低温条件下水稻种子发芽率和苗期叶片赤枯度为耐冷性鉴定标准,采用QTL Ici Mapping v3. 0软件基于完备复合区间作图法,对水稻发芽期和苗期耐冷性进行QTL分...
作者:梁永书; 张启军; 叶少平; 刘明伟; 殷得所; 李平 期刊:《中国农学通报》 2005年第12期
应用147个SSR标记,对水稻测序品种日本晴(Nipponbare以下简称Nipp)×广陆矮4号(部分测序,以下简称GLA)的F2群体进行基因检测,构建了全长为1736.6cM、覆盖水稻基因组12条染色体的连锁图,采用QTLCart1.7统计软件对水稻分蘖相关性状如分蘖数、穗数、有效分蘖数、分蘖率等4个性状的基因座位进行定位分析,检测到5个主效果基因和17个微效基因,同时结合基因组研究的最新成果,对7个与标记间遗传距离为0(QTL POS=0)的QTLs进行生物信息学的分...
作者:李纯; 王超龙; 陈赛华; 郑天慧; 鲁健; 崔松; 刘宗凯; 陈亮明; 江玲; 周时荣; 万建民 期刊:《南京农业大学学报》 2018年第05期
[目的]挖掘新的控制早熟性的QTL,为早熟性的遗传机制研究和分子育种提供新的基因资源。[方法]选择熟期差异明显的2个品种(早熟品种‘RZ54’和相对迟熟品种‘南京11’)进行杂交,构建F2群体,利用分子标记构建遗传连锁图谱,进行抽穗期QTL定位。[结果]利用141个具有多态性的SSR和Indel标记对由184个株系组成的RZ54/南京11的F2群体进行基因型检测,构建了全长为1741.4cM、平均图距为12.35cM、覆盖水稻12条染色体的遗传图谱。在南京自然光...
作者:郑祖平; 何川; 李钟; 黄玉碧 期刊:《玉米科学》 2005年第04期
在玉米(Mo17/黄早四)RIL群体中,应用SSR分子标记连锁图谱,运用Win QTL cartographer v2.0对两种供氮水平下的穗长性状进行QTL定位分析.结果表明,在高氮水平下检测到1个控制穗长的QTL,位于第1染色体上;在低氮水平下检测到4个穗长QTLs,第1和第5染色体上各2个,说明穗长QTLs与供氮水平之间可能存在交互效应.基于这种互作效应及研究中观察到的两个供试亲本对低氮胁迫的耐性差异,推测仅在低氮水平下检测到的穗长QTLs可能与玉米对低氮胁迫...
作者:狄江; Cynthia; DK; Bottema; Bozena; kruk 期刊:《西北农业学报》 2005年第04期
测定了利木赞×娟姗牛杂交一代3头公牛所有回交后代的背最长肌和半腱肌的剪切力、pH值及煮制损失3个表型性状,与已构建的遗传连锁图谱和基因型值相结合,利用QTLExpress软件的"Half-Sib QTLAnalysis Servlet"进行QTL分析,共发现6个可能的QTL位点,其中背最长肌剪切力性状3个QTL(BTA2 45cM,BTA29 54 cM)、半腱肌剪切力1个QTL(BTA2 12 cM)、半腱肌pH值1个QTL(BTA24 0 cM)、背最长肌煮制损失1个QTL(BTA14 2 cM).
作者:张小村; 李斯深; 赵新华; 范玉顶; 李瑞军 期刊:《植物遗传资源学报》 2005年第03期
对RIL-8群体纹枯病抗性进行QTL检测,检测到一个加性QTL,位于1A染色体上,贡献率为21.57%;检测到4对QTL间互作位点,涉及7条染色体,互作贡献率分别为11.63%、6.54%、14.04%、20.01%,互作总贡献率为52.23%.通过对RIL-SES群体118个系检测,发现1个SSR标记Xgwm526,位于2B染色体上,与纹枯病抗病基因距离为27.9cM;一个ISSR标记IS840,与纹枯病抗病基因距离为16.9cM.
作者:周晓果; 景蕊莲; 昌小平; 张正斌 期刊:《植物遗传资源学报》 2005年第01期
以小麦DH群体(旱选10号×鲁麦14)为研究材料,采用复合区间作图法,对小麦幼苗在水分胁迫及非胁迫条件下的水分利用效率(WUE)及其相关性状的QTL进行定位,并对比分析QTL的加性效应.两种水分条件下共检测到14个具显著加性效应的QTL,分布在2A、3A、4A、5A、6A、7A、1B、3B、3D染色体上,可解释表型变异的范围在6.36%~19.73%.其中,非胁迫(对照)条件下检测到10个QTL,包括2个单株WUE的QTL,5个地上部WUE的QTL,1个根系WUE的QTL及2个总耗水量的...
作者:韩龙植; 乔永利; 张三元; 曹桂兰; 叶昌荣; 徐福荣; 戴陆园; 芮钟斗; 高熙宗 期刊:《中国农业科学》 2005年第06期
以籼粳交密阳23/吉冷1号200个F2:3家系作为作图群体,在北京(正常生长环境)、昆明(自然低温胁迫)、公主岭(冷水胁迫)、韩国春川(正常生长环境和冷水胁迫)等5种不同生长环境下进行了水稻秆长、穗长、穗粒数和穗抽出度等主要农艺性状的异地鉴定,并利用SSR标记进行了上述农艺性状的QTL分析.检测结果表明,5种不同环境下检测到与上述农艺性状相关的QTL共44个,分布于除第9染色体外的11条染色体上.qCL1a、qCL1b、qCL5a、qCL6b、qPL1a、qPL3...
作者:黎裕; 王天宇; 石云素; 宋艳春 期刊:《干旱地区农业研究》 2004年第01期
由于分子标记技术的广泛应用,使玉米抗旱性的复杂遗传机制得到逐步了解,其中的一个重要研究进展是通过对玉米抗旱性的数量性状位点(QTL)进行作图和定位,大致了解了一些对抗旱性有显著贡献的基因的染色体位置及其效应,这些结果为分子标记辅助选择和进一步的深入研究打下了基础.在总结分析国际上近十年来在玉米抗旱性QTL分析方面的研究资料的基础上,对研究中涉及到的主要性状及其相互关系、QTL分析中需要注意的主要问题和在该领域的...
水稻许多重要的性状是由多基因控制的数量性状,经典的数量遗传学只能把数量性状作为一个整体进行研究.近年来,高密度分子标记连锁图的构建和有效的生物统计学方法的发展使人们对数量性状遗传基础的研究出现了革命性的变化.通过对不同群体内的个体或品系的分子标记基因型和表型数据的共分离分析,能对QTL进行检测和定位.本文对QTL定位的原理和方法进行了介绍,从QTL的数目和效应、上位性效应、QTL基因型与环境的互作、相关性状的QTL以...