作者:成海建; 姜富贵; 张清峰; 苏文政; 刘方圆; 孔淑慧; 宋恩亮 期刊:《中国牛业科学》 2018年第06期
近年来先进的基因组测序和基因分型技术促进了肉牛育种方法的革新。从过去低通量、耗时的限制性片段多态标记(RFLP)到如今高通量、高密度的单核昔酸多态性(SNP)标记,基因检测效率大幅提高。随着肉牛基因组序列图谱及SNP图谱的完成,基于高密度SNP标记的牛全基因组选择成了牛育种的新热点。本文通过综述高密度SNP芯片分型技术,基因组选择技术在不同国及不同肉牛品种中的应用情况.旨在表明新型遗传技术的发展必将促进肉牛遗传评估方法...
作者:王珏; 刘成琨; 刘德武; 王克君; 陈洁; 吴珍芳; 方美英 期刊: 2019年第12期
基因组选择(GS)是近些年发展起来的一项新型育种技术,目前已在动植物育种实践中应用。本研究通过在1068头杜洛克公猪群体中使用不同密度的SNP芯片进行全基因组选择效果比较分析。结果发现:使用基因型填充后芯片以及高密度SNP芯片所获得的估计基因组育种值(GEBV)之间可以达到99%的相关,并发现个体间亲缘关系的远近对同群体内基因型填充结果的准确率影响不大。由此可见,与目标性状紧密相关的低密度SNP芯片可用于实际育种工作,在降低...
作者:任源; 王佐惠; 吴江; 林彦萍 期刊:《种子科技》 2019年第13期
全基因组选择(Genomic Selection,GS)是估计全基因组上所有标记或单倍型的效应,从而得到基因组估计育种值(Genomic estimated breeding value,GEBV)。与传统的标记辅助选择(Marker-assisted selection,MAS)的最大区别在于,全基因组选择不仅仅是一组显著的分子标记,而且还是联合分析群体中的所有标记,再与参考群体的表型数据建立BLUP模型进行个体育种值的预测,随后进行人工选择。GS的育种技术已在植物中实现。近年来许多研究表明,GS...
作者:刘冉冉; 赵桂苹; 文杰 期刊:《中国家禽》 2018年第15期
全基因组SNP变异检测是开展基因组育种(Genomic selection)和准确度量群体遗传多样性的基础。继国外开发出60 K和600 K鸡SNP芯片后,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所等单位,针对国产化鸡育种和地方种质资源保护的现状和需求,自主研发出了"京芯一号"55 K SNP芯片等高性价比的检测芯片。芯片特点包括:(1)包含中国地方鸡种特有遗传变异信息,兼顾国外商业化鸡种基因组信息;(2)整合大量的功能基因相关SNP位点;(3)在基因组上...
作者:马岩松; 刘章雄; 文自翔; 魏淑红; 杨春明; 王会才; 杨春燕; 卢为国; 徐冉; 张万海; 吴纪安; 胡国华; 栾晓燕; 付亚书; 郭泰; 王曙明; 韩天富; 张孟臣; 张磊; 苑保军; 郭勇; Jochen; C.REIF; 江勇; 李文滨; 王德春; 邱丽娟 期刊:《作物学报》 2018年第01期
百粒重是大豆产量的重要构成因子,在一定条件下与产量呈显著正相关。百粒重是一个复杂的数量性状,用传统的育种方法其遗传增益不明显。本研究对280份大豆品种进行了多年多点田间鉴定,通过混合线性模型预测获得品种百粒重的最佳线性无偏预测值。同时利用分布在大豆全基因组的5361个SNP标记鉴定参试品种基因型,结合随机回归最佳线性无偏预测模型和交互验证方法,探讨了群体构成方式对大豆百粒重的全基因组选择预测准确度的影响。结果...
基因组选择是一种利用高密度芯片全部位点与目的基因存在的连锁不平衡估计基因组育种值的方法,目前已相继在英国、法国、澳大利亚和新西兰等国家的畜禽育种中得到应用并有效提升了育种效率。在我国,基因组选择已在奶牛、生猪和肉鸡的育种中开始应用并取得了一定的成效。我国是世界养羊大国,但在羊的养殖管理、育种水平以及生产效率等方面依旧与发达国家存在较大差距。目前,已有育种工作者尝试对绵羊开展基因组选择育种研究,但至今...
作者:尹立林; 马云龙; 项韬; 朱猛进; 余梅; 李新云; 刘小磊; 赵书红 期刊:《畜牧兽医学报》 2019年第02期
全基因组选择是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好的预测效果,真正实现了基因组技术指导育种实践。随着芯片和测序技术日趋成熟,高密度标记芯片检测成本不断降低,全基因组选择模型的不断升级和优化,预测准确性不断提高,全基因组选择已成为动物遗传改良的重要手段和研究热点。目前,全基因组选择已经...
作者:杜超; 魏鹏飞; 郭妮妮; 王晨; 杨利国; 滑国华 期刊: 2017年第05期
水牛是全球第二大产奶家畜,水牛奶虽然营养丰富,但目前产奶水平较低,缺乏专门化乳用品种。利用分子育种手段,对产奶性状进行遗传改良,培育专门化乳用品种,是水牛育种的重中之重。目前主要有2种策略应用于水牛产奶性状的改良,一种是候选基因策略,与水牛产奶性状相关的候选基因主要包括STAT1、A2M、GHRL、DGAT1、STAT5A、BTN、OXT、LEP、TG、MTNR1A和CSN1S1等,另一种是全基因组选择策略,虽然该技术在奶牛上应用广泛,但目前在水牛研究...
作者:徐哲; 高雪; 张军民; 李俊雅 期刊:《现代农业科技》 2016年第17期
以中国农业科学院北京畜牧兽医研究所引智工作为例,在分析国内外肉牛种业发展现状与趋势的基础上,结合我国当前具备的研究基础,分析了我国肉牛种业与发达国家的差距;围绕我国肉牛种业科技和生产需求,提出了迅速提高我国肉牛种业科技水平的发展思路,以期为畜牧业领域开展引智工作提供参考。
作者:熊明民; 杨亚岚; 阮进学; 王冰源; 张艳敏; 周荣; 李奎 期刊:《农业生物技术学报》 2016年第08期
随着分子生物学技术的快速发展,动物育种已经步入了以数量遗传学、分子遗传学等多学科理论指导的分子育种时代。动物生物育种展现出重大的应用价值和产业化前景,有利于推动我国畜禽养殖业良种的选育和本土化进程。本文主要综述了国内外动物全基因组选择和动物基因组编辑技术等生物育种技术的发展历程、研究进展和应用情况,并从技术创新和技术产业化角度,分析了我国动物种业发展现状和存在的问题,提出了促进生物种业发展的对策和建...
作者:宋志芳 曹洪战 芦春莲 期刊:《猪业科学》 2016年第06期
目前,随着分子生物学技术和遗传学的不断发展,动物育种方法从传统的数量评估方法,逐渐向全基因组选择法评估育种值转变。全基因组选择是动物育种的一次革命,利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能大大缩短育种间隔,提高遗传进展,已然成为动物育种研究的热点。该文主要对全基因组选择在动物育种中的应用及展望做一个简述。
作者:于洋 张晓军 李富花 相建海 期刊:《中国水产科学》 2011年第04期
全基因组选择的概念自2001年由Meuwissen等提出后便引起了动物育种工作者的广泛关注。目前,澳大利亚、新西兰、荷兰、美国的研究小组已经应用该方法进行了优质种牛的选择育种,并取得了很好的效果。此外在鸡和猪的选择育种中也有该方法的应用,但在水产动物选育中尚未见该方法使用的报道。本文对"全基因组选择育种"的概念和提出背景进行了归纳,对全基因组选择育种的优势进行了阐述,并详细介绍了其具体的策略,总结了目前全基因组育...
作者:谷继承 刘丑生 刘刚 韩旭 期刊:《中国畜牧兽医》 2010年第09期
作者对牛遗传多样性的主要研究方法(主要包括线粒体DNA、微卫星DNA多态性、单核苷酸多态性、高通量SNP检测方法及全基因组选择方法)及其在牛分子遗传多样性研究方面的应用进行了介绍。
作者:张慧 王守志 李辉 期刊:《东北农业大学学报》 2010年第03期
数量遗传学在经历了传统的数量遗传学后逐步发展产生了数量遗传学与分子遗传学、生物技术相结合的分子数量遗传学。应用分子标记定位影响重要经济性状的QTL已经取得了显著的成果。QTL一旦得到定位,确定了该位点对表型的贡献率,就可以利用位于QTL侧翼的标记直接进行标记辅助选择。然而应用于标记辅助选择的标记只捕获了构成表型的一部分变异,而无法检测到构成性状的所有变异,为了解决这个问题,其中的一个途径就是利用全基因组...
作者:齐超 黄金明 仲跻峰 期刊:《山东农业科学》 2013年第02期
试验结果表明,奶牛育种中基于GEBV的遗传评估可靠性在20%~67%之间,如以之代替常规后裔测定体系,可节省92%的育种成本。由于可以提高育种值估计准确性、利于早期选种、显著缩短世代间隔、减少育种成本,全基因组选择作为一项新的育种策略在奶牛育种中逐渐得到应用,并将拥有良好的前景。本文综述了全基因组选择的基本原理、计算方法、影响因素及其在奶牛育种中的应用现状和所面临的问题。
作者:王晨 秦珂 薛明 莫德林 陈瑶生 刘小红 期刊:《畜牧兽医学报》 2016年第01期
全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪60kSNP芯片的商业化,全基因组选择已经成为猪育种研究领域的新热点。本文综述了全基因组选择的分析方法、计算方法和影响因素,并阐述了全基因组选择在猪育种中的应用情况和发展趋势。