作者:高俊平; 李法君 期刊:《生物学教学》 2019年第12期
分子生物学中存在多个带"子"的名词,易引起混淆。本文对其进行了梳理和解释,以期为理解和掌握这些概念提供帮助。
作者:武志娟; 钟金城 期刊:《生物学通报》 2012年第04期
密码子偏性(codonbias)是指生物体中同义密码子非均衡使用、均现象。研究密码子偏性可以使人们更好地理解分子进化、翻译调控等生命过程。在介绍密码子偏性的基础上,概述了影响其形成的各生物学基础,并指出其应用和发展前景。
2004年有多套高考试题涉及到基因突变、密码子和氨基酸之关系等问题.教材在讲密码子与氨基酸时介绍了"20种氨基酸的密码子表",这一表格也是教材内容的重要组成部分.但教学中可能因为重视不足或对其中隐含的信息挖掘不够,而使部分学生不能全面准确地把握.下面笔者结合有关实例对其做简要讨论.
公认的遗传密码包括64种密码子,编码20种氨基酸和3种终止信号.它保存在生命的三界里.遗传密码的起源,究竟是一种:"确凿的意外事件",还是编码较少种类氨基酸的原始密码的一种扩展,目前仍然是一个谜.尽管蛋白质完成了生命的复杂过程的大部分,另外的构建材料(building blocks)仍然是需要的:有些功能要靠转译后修饰或辅因子,还有许多包含罕见氨基酸的重要多肽不是在核糖体上合成的.
作者:宋兴超; 徐超; 王雷; 巴恒星; 王桂武; 杨福合 期刊:《家畜生态学报》 2014年第03期
以GenBank中已登录的梅花鹿(Cervusnippon)、马鹿(Cervuselaphus)、普通牛(Bostaurus)、水牛(BubaluSbubalis)、山羊(Caprahircus)和绵羊(Ovisaries)胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因mRNA序列为研究材料,通过DNAStar7.0等生物信息学软件对6个物种的IGF-1基因进行序列比较及分子进化分析。结果表明:鹿科与牛科动物IGF-1基因编码区均为465bp,并且碱基组成表现为G〉C〉A〉T,且G+C含量高于A+T;6个物种IGF-1基因密...
作者:张静; 陈翠英; 李静静; 张七斤 期刊:《中国动物检疫》 2019年第08期
B2L蛋白是羊口疮病毒(ORFV)的主要囊膜蛋白,为重要保护性抗原之一,可刺激机体产生强烈的抗体反应。本研究对B2L基因运用Visual Gene Developer生物信息学软件,分析其在大肠杆菌、毕赤酵母、昆虫杆状病毒表达系统中的密码子使用偏好性,从而选择一个最适表达系统,以增加B2L蛋白的表达量。分析表明,B2L基因在昆虫杆状病毒表达系统中会得到更好的表达,这为B2L基因表达系统的选择提供了参考。
作者:张怀; 袁其朋; 朱亚平; 马润宇 期刊:《中国生物工程》 2005年第03期
为了在大肠杆菌中表达生产hepcidin,根据大肠杆菌密码子偏好性,化学合成了人hepcidin的基因序列,并构建了hepcidin的融合表达载体pET-hpc.pET-hpc在大肠杆菌BL21(DE3)中表达的hepcidin融合蛋白以包涵体形式存在,其N端带有6个组氨酸.通过优化诱导表达条件,该融合蛋白表达水平显著提高,占总蛋白的25.2%.表达的包涵体经1%Triton X-100洗涤后溶于8mol/L尿素,在变性条件下采用金属螯合层析进行纯化,所得融合蛋白纯度大于95%.
作者:曹更生; 柳爱莲; 樊宝良; 许红韬; 李宁 期刊:《农业生物技术学报》 2004年第05期
6条长约80bp的寡聚核苷酸链,通过其互补末端延伸补平成3条双链DNA;3条双链DNA按3:1:3混合,PCR扩增得到大量拟蛛丝蛋白基因单体;将单体多聚化,加上设计好的信号肽和终止密码子,再将多聚体基因构建到乳腺高效表达载体pBC1上,使之成为乳腺高效表达的拟蛛丝蛋白基因载体。着重讨论了基因构建过程中DNA克隆技巧和策略。
作者:潘雪莉; 张爱华; 黄晓欣; 蒋宪瑶 期刊:《环境与职业医学》 2004年第05期
[目的]分析燃煤型砷中毒患者外周血中p53基因突变情况.[方法]采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对60例燃煤型砷中毒患者外周血中p53基因5~8外显子的突变情况进行初筛,并进一步克隆测序,以确定突变位点及类型.[结果]癌变组p53基因突变率为30%(3/10);癌前组为16.67%(2/12);一般病变组未发现突变(0/38).对筛查出来的5例突变阳性者进行克隆测序,突变均为G:C→A:T的转换,分别位于密码子143、146及151.[结论]燃煤型砷中毒...
作者:阎毅; 叶科军; 颜亮 期刊:《中国病理生理》 2005年第08期
目的:通过观察点突变前后核酸密码子与氨基酸理化特性的变化,探讨相关疾病的发病机制. 方法:自编软件收集基因数据库资料进行了突变频数的统计,分析突变前后核酸密码子的分子量、亲水性、碱基堆积力、П电子共振能以及氨基酸的分子量,pH值,疏水值,相互距离和不可取代性等的变化,用统计学方法计算其可能存在的相关性.
作者:张宝荣; 殷鑫浈; 夏昆; 丁美萍; 胡正茂; 郑敏; 刘志蓉; 夏家辉 期刊:《中华医学遗传学》 2004年第06期
目的明确一个伴随有类似关节指垫样病损和指甲病变的表皮松解性掌跖角化病的中国家系中角蛋白9(keratin 9, KRT9)基因突变情况. 方法用聚合酶链反应技术扩增家系成员及家系外50名正常人 KRT9基因的编码区及外显子与内含子交界处,DNA序列分析寻找突变位点,然后经限制性内切酶DdeⅠ分析验证. 结果患者 KRT9基因第1外显子第160位密码子发生AAT→AGT的突变(N160S),而家系正常成员及家系外50个正常人中均不存在此突变. 结论 KRT9基因的...
作者:黄梁浒; 辛娜; 杨渤生; 兰风华 期刊:《中华神经医学》 2005年第03期
目的鉴定并分析1个新的肾上腺脑白质营养不良家系的基因突变类型和位点.方法采用长链RT-PCR技术,从外周血提取总RNA并合成cDNA,以cDNA为模板,分4个片段扩增致病基因编码区,将纯化后的PCR产物直接测序,找出基因突变的位点.同时应用限制性酶切分析的方法,分析发病家系所有成员的基因组DNA,以证实所发现的突变.结果患者肾上腺脑白质营养不良基因外显子2上的第343位密码子发生了GGC→GTC改变,使原来编码的甘氨酸被缬氨酸(G343V)取代;患...
作者:高枫; 唐卫中; 李卫 期刊:《中华实验外科》 2005年第01期
目的观察中国人大肠癌K-ras基因突变情况,并结合临床病理资料加以分析.方法应用常规酚、氯仿法提取48例散发性大肠癌组织及相应正常组织的DNA,聚合酶链反应(PCR)扩增、单链构象多态性(SSCP)电泳和DNA直接测序.结果K-ras基因突变率为43.8%(21/48),6种K-ras基因突变类型被发现,包括12密码子(GGT→GTT、GGT→AGT、GGT→GAT、GGT→TGT)、13密码子(GGC→GAC)和61密码子(CAA→CAT).结论中国人大肠癌K-ras基因突变率为43.8%(21/48).12密码...
作者:俞锐敏; 周羽竝; 蔡启陆; 冯建生; 林春兰 期刊:《解放军医学院学报》 2005年第02期
目的:检测广州地区高胆固醇血症患者载脂蛋白B-100可能存在的突变体.方法:应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增APOB基因第26外显子编码10549-10895号核苷酸的DN段,用地高辛配基标记的等位基因特异寡核苷酸探针进行斑点杂交,分析受检者的载脂蛋白B-100基因是否存在密码子3531CGC→CGT突变.结果:362例原发性高胆固醇血症患者中未检出上述基因突变.结论:上述基因突变在广州人群中不存在或发生率很低.
作者:王绍靖; 陈晓瑞; 菅喜岐 期刊:《中国肿瘤临床》 2019年第04期
作者:康蕾; 梁东春; 孙蓓; 郭刚; 张镜宇 期刊:《天津医科大学学报》 2004年第03期
目的:获得适于大肠杆菌表达的人γ干扰素(hIFN-γ)基因.方法:用大肠杆菌偏嗜性密码子替换已知hIFN-γ基因编码序列中相应的密码子,将重新设计后的编码序列分为六段进行人工化学合成,通过PCR拼接技术扩增出大肠杆菌偏嗜性hIFN-γ基因编码序列,并进行克隆及序列分析.结果:经序列分析证实,重组pGEM-hIFN-γ质粒含有与预期结果一致的hIFN-γ基因编码序列.结论:成功进行了大肠杆菌偏嗜性hIFN-γ基因的克隆,为hIFN-γ基因的体外高表达奠定了基础.
作者:赵铁军; 韩瑞; 罗强; 贾天军; 张庶民 期刊:《广东医学》 2005年第05期
目的初步调查健康汉族人、蒙族人及回族人MBL 52位密码子基因突变的情况.方法采用MBL52位密码子基因突变的序列特异性引物聚合酶链式反应即PCR-SSP检测方法.结果检测169例健康汉族人52位密码子的点突变情况,野生型为161例,占95.3%;突变杂合型为8例,占4.7%.基因频率分别为CGT为0.976;TGT为0.024.检测58例蒙族人,野生型为58例,占100%.基因频率CGT为1.检测100例回族人,野生型为100例,占100%.基因频率CGT为1.组间比较采用x2检验,P<0.0...
作者:龙华; 王祖荣 期刊:《南方水产科学》 2005年第01期
运用DNAman v4.0分析软件,对克隆的鲫鱼血清转铁蛋白cDNA序列与文献中的14种鱼转铁蛋白cDNA序列的同源性、密码子使用频率和密码子使用偏性进行分析,结果表明:鲤形目鱼类Tf的cDNA序列同源性在46%以上,而鲑形目鱼类Tf的cDNA序列同源性在34%~99%之间,变化较大.密码子使用频率越高或使用偏性越小,说明该密码子编码的氨基酸对蛋白质空间结构的形成和基本生理功能的影响也越重要;在进化上分化时间越早的物种,密码子使用频率和使用偏性...
作者:刘庆慧; 黄倢; 韩文君 期刊:《渔业科学进展》 2005年第04期
运用EMBOSS(The European Molecular Biology Open Software Suite) 的CHIPS(Condon Heterozygosity in a Protein Coding Sequence)和CUSP( Create a condon usage table)程序对WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析,分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,WSSV-vp37、WSSV-vp39及WSSV-vp19的Nc(Effective number of condons)值为49.897、48.640、46.868.3种蛋白的编码密码子使用频率有较大的差异,其在...