作者:冉楠; 马明星; 庞志强; 王泽雨; 刘月; 郑瑞鹏; 卢俊英; 张超; 陈光; 章宏; 王放 期刊:《吉林大学学报·信息科学版》 2020年第01期
作者:张磊; 陈大明; 冯福梅; 吴岭 期刊:《中国老年学》 2020年第04期
自从1953年,I.D.Watson和F.H.C.Crick发现DNA的双螺旋模型之后.DNA测序技术随着科学的进步得到了迅猛发展。1977年Sanger发明DNA双脱氧末端终止测序技术,Maxam与Gilberr发明利用化学降解法进行测序的技术,2种测序技术被誉为DNA测序技术的始祖。随后,在第1代DNA测序技术的基础上,相继出现了第2代测序技术、基因芯片技术以及第3代测序技术。总结并展望了每一代测序技术及基因芯片技术的诞生、原理及应用前景,为利用测序技...
12月2613,由科技13报社组织部分院士和多家中央新闻单位参与评选的“2006年国内十大科技新闻”揭晓。家蚕基因芯片与表达图谱入选并名列榜首。
作者:谭德友; 李新; 黄泽棋; 欧趣娴; 彭姿妍 期刊:《皮肤性病诊疗学》 2009年第03期
目的:评价核酸分子快速导流杂交基因芯片技术(HybriMax)检测尖锐湿疣(CA)组织中人乳头瘤病毒(HPV)基因型的临床应用。方法:采用HybriMax技术,对142例尖锐湿疣患者皮损组织进行HPV感染分型检测。结果:在受检的CA患者中21种HPV亚型共检出18种,未发现HPV18、35和56型。142份CA组织标本中HPV阳性137例,总检出率是96,48%,单一基因型别阳性率是58.45%(83/142),多重基因型别阳性率是38.03%(54/142);各基因型别...
作者:薛秀娟; 李国明; 郑和平 期刊:《皮肤性病诊疗学》 2008年第06期
基因芯片作为近期发展起来的一项新兴分子生物学技术,在性传播疾病研究中的应用越来越广泛。本文就近年来基因芯片技术在性传播疾病领域的应用进展作一综述。
基因芯片作为一种新兴的技术手段已经在植物学、动物学、医学和农学等多个研究领域中发挥了重要作用。本文就基因芯片数据分析的各个环节,包括芯片数据的预处理、归一化、差异基因的判断、聚类分析以及基因芯片在植物功能基因组研究中的应用进行了综述。
作者:宋咏刚; 胡文慧; 余鹏; 石玉玲; 赵雪; 胡祖权; 王赟; 曾柱 期刊:《贵州医科大学学报》 2019年第12期
目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析。结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路...
作者:孙朝晖; 郑文岭; 彭翼飞; 张宝; 吕梁; 马晓冬; 马文丽 期刊:《中国生物化学与分子生物学报》 2005年第03期
制备丙型肝炎病毒(HCV)1b亚型诊断芯片并进行初步验证评价.采用cDNA文库法制备探针,用限制性内切酶Sau3AⅠ消化HCV-1b全长cDNA,所得的酶切片段72℃补平加A,AT克隆,PCR初步鉴定,并测序.将筛选出的片段打印在氨基修饰的玻片上制备成检测芯片并进行杂交验证分析.运用cDNA文库法,得到22个大小相对一致(250~750 bp)的基因片段.序列分析表明,均属于HCV-1b基因,可以作为诊断芯片探针;样品标记采用限制性显示(restriction display,RD)技术...
作者: 期刊:《中国生物化学与分子生物学报》 2005年第03期
2005年4月26日,全球生命科学领域处于领先地位的两家公司——北京博奥生物芯片有限责任公司和美国加利福尼亚州的昂飞(Affymetrix)公司在人民大会堂宣布两家公司建立战略合作关系。
作者:林祥博; 石文静; 杨志一; 张丽萍; 周丹丹; 郑荃; 尹崇高; 李洪利 期刊:《中国生物化学与分子生物学报》 2019年第06期
间质表皮转化因子(mesenchymal to epithelial transition factor,MET)在多种癌症中异常表达,影响肿瘤的发生发展,但MET影响肺腺癌的分子机制并不明确。本研究收集3例淋巴结转移的肺腺癌组织(lung adenocarcinoma tissues,LAD)和3例无淋巴结转移的肺腺癌组织,用于微阵列基因芯片分析。结果显示,与无淋巴结转移的肺腺癌组织相比,有淋巴结转移的肺腺癌组织中有1 314条mRNAs表达上调,400条mRNAs表达下调。其中,MET在有淋巴结转移的肺...
作者:王冰玉; 蔡颖; 郑凯; 谢红卫; 徐新云 期刊:《癌变畸变突变》 2020年第01期
目的:采用基因芯片技术与生物信息学分析方法,筛选PM2.5染毒后的人支气管上皮细胞(HBE)与未染毒细胞比较的差异表达基因和通路,为进一步研究PM2.5对HBE细胞致癌致突变作用的相关机制提供科学依据。方法:用50μg/mL的PM2.5水溶液处理HBE细胞,染毒24 h,用未染毒的细胞作为空白对照组,设立3组平行样品。提取RNA,荧光标记与纯化后进行芯片杂交,用Rosetta Resolver® System (Rosetta Biosoftware)进行数据前处理与统计分析,得到差异表达...
作者:涂云贵; 杜琼; 余映辉; 吕景良; 陈天艳; 张有旺; 李洁; 陈瑞霞; 王磊; 宋宇 期刊:《昆明医科大学学报》 2019年第12期
目的对安宁地区184例耳聋基因检测结果进行分析,为临床耳聋基因检测及防治提供参考依据。方法采集2018年4月至12月安宁地区184例耳聋基因受检者血液标本,应用基因芯片技术及Sanger测序技术对4个遗传性耳聋常见基因(GJB2、GJB3、SLC26A4及12Sr RNA)中的28个位点进行检测。结果基因芯片检测出18例样本发生耳聋基因突变,突变率9.78%,其中GJB2基因235del C位点突变构成比最高(38.89%);Sanger测序法检出27例样本发生耳聋基因突变,突变率...
作者:刘莹 期刊:《食品安全质量检测学报》 2019年第19期
作者:任恩惠; 张广智; 贺学岗; 高一诚; 杨风光; 杨亮; 马占军; 解琪琪; 汪静; 康学文 期刊:《生命科学研究》 2019年第06期
用生物信息学方法筛选参与脊髓损伤(spinal cord injury, SCI)发展过程的关键分子和通路,可为脊髓损伤发展机制的研究提供指导。从GEO数据库下载基因芯片数据,并将数据集中的样本分为脊髓损伤组(SCI组)和正常组(normal组)。应用R语言处理来自不同数据集样本间的批次效应,同时对基因芯片的表达数据进行标准化处理,并通过PCA分析监测标准化处理后数据的质量。应用R语言中的limma包分析标准化后的基因表达矩阵,以得到差异基因。将差异...
作者:杨文君; 郝静文; 莫朝晖 期刊:《中国血液流变学》 2019年第02期
作者:孙桂英; 赵刚; 沈燕; 徐密琴; 高胜利; 俞净; 钮志林 期刊:《国际检验医学》 2019年第23期
目的考察基因芯片技术检测结核分枝杆菌(Mtb)对利福平(RFP)与异烟肼(INH)耐药性的效果。方法选取苏州市吴江区第一人民医院感染科发现的痰液涂片阳性的结核病患者纳入研究。采用基因芯片技术检测Mtb对RFP与INH的耐药性,并与传统药敏试验结果进行对比,同时采用DNA测序进行验证。结果基因芯片检测RFP耐药的符合率为97.47%,灵敏度为94.90%,特异度为97.81%,阳性预测值为85.32%,阴性预测值为99.31%,Kappa值为0.952;检测INH耐药的符合率...
作者:张莉; 翟蕙; 陈家盛; 徐葵花; 刘传苗 期刊:《齐齐哈尔医学院学报》 2019年第19期
目的筛选病毒性肝炎肝硬化发生发展中的关键基因,分析其相互之间的作用。方法本研究从公共基因芯片数据库(GEO)下载病毒性肝炎肝硬化相关芯片数据,利用R语言中相关软件筛选出表达差异基因,分别对差异基因进行Gene Ontology功能分析、KEGG代谢通路分析以及蛋白相互作用网络分析。结果本研究从GEO数据库中筛选出2组基因芯片进行分析,发现共同差异基因307个,其中上调基因62个、下调基因245个。富集分析表明差异基因在信号传导、免疫反...
作者:顾珺巍; 丁裕斌; 付利娟; 王永恒; 王应雄; 刘太行 期刊:《重庆医科大学学报》 2019年第08期
目的:合体滋养层细胞(syncytiotrophoblast,STB)是一类多核化上皮细胞位于人类胎盘最外层,由单核滋养细胞(cytotrophoblast,CTB)分化、融合而来,肩负妊娠维持关键激素的分泌和母胎间营养交换的重要职责,也是母胎屏障重要组成部分之一。然而,目前关于胎盘滋养细胞的合体化过程的调控机制仍不明确。本研究即利用生物信息学的方法筛选并初步验证潜在调控绒毛膜癌BeWo细胞合体化调控的关键基因。方法:从GEO数据库检索并下载BeWo细胞合...
作者:万薇; 余蓉; 江红群 期刊:《中华耳科学》 2019年第05期
目的总结72个耳聋高危家庭的耳聋相关基因的携带状况和遗传规律等信息,评估耳聋易感基因检测对生育前遗传咨询和指导的临床意义。方法对2019年1月至6月72个耳聋高危家庭通过耳聋基因芯片对4个常见耳聋基因中的9个位点(GJB2基因中的35delG、176del16、235delC、299_300delAT,GJB3基因中的538 C>T,SLC26A4基因中的2168A>G、919-2A>G及线粒体12S rRNA基因中的1494C>T、1555A>G)进行检测。为所有参与家庭提供耳聋基因报告,进一步检测到...