作者:吴茜; 宋兴勃; 钟慧钰; 温阳; 应斌武 期刊:《华西医学》 2019年第09期
目的探索结核病的发病机制,为结核病的早期诊断和治疗评估提供新思路。方法从基因表达数据库中获取GSE54992基因表达谱,使用美国国立生物技术信息中心在线实验室筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),并使用基因本体论分析、代谢通路分析(pathway分析)、基因信号网络分析、共表达分析的方法对所获得基因进行分析。结果与健康对照相比,在结核病患者中筛选出共3 492个DEG。其中,1 686个基因上调,1 806个基因下调;DEG...
作者:张梦梅; 唐妍; 王元艳; 柏杰; 杨泽; 柏玉举 期刊:《山东医药》 2018年第06期
目的基于基因芯片数据分析非小细胞肺癌H460细胞株顺铂耐药相关的靶基因及信号传导通路。方法从基因表达数据库(GEO)下载基因芯片数据,数据预处理后,使用R软件分析H460顺铂耐药细胞株与亲本细胞株中差异表达的基因。运用生物医学信息学方法(基因本体论使用DAVID在线软件进行分析,信号传导通路使用DAVID及Pathway在线软件进行分析)对差异基因的功能和富集的信号通路进行注释,进一步分析H460细胞顺铂耐药调控的关键基因及信号通...
作者:郑青亮; DOMINISSINI; D; NACHTERGAELE; S; MOSHITCH-MOSHKOVITZ; S 期刊:《中国肿瘤生物治疗》 2016年第03期
高等真核生物的RNA上能发生100多种化学修饰,以前这些修饰在非编码RNA(如tRNA,rRNA)上的功能研究较多,然而绝大部分修饰在mRNA上的修饰图谱以及所发挥的功能作用仍然未知。可逆的m^6A修饰主要发生在mRNA的CDS区,3'-UTR区,特别是终止密码子附近区域,其广泛参与了RNA代谢的各种生物学过程。据报道m^1A修饰能改变tRNA和rRNA结构从而调控其功能,但该修饰是否存在于mRNA,其在mRNA水平的修饰图谱及其功能仍然不明。