为分析薄荷的遗传关系及对薄荷优良品种进行开发利用,对收集的11个薄荷种质进行了DNA提取、PCR扩增和测序,获得了ITS全序列,再利用软件MEGA 5.0计算了物种种内种间K2P遗传距离,并应用最近距离法、构建NJ(邻接)系统聚类树方法,对薄荷种质进行了遗传关系分析。结果表明,11个薄荷种质的遗传距离为0.001~1.365,平均值为0.456 6,系统发育树可将11个薄荷种质分成三大类,体现了较好的遗传多样性。
作者:张挺峰; 王睿; 刘长仲 期刊:《昆虫学报》 2020年第01期
【目的】从采集到的自然染菌的豌豆蚜Acyrthosiphon pisum虫尸分离纯化得到一株病原真菌,定名为TF-2。本研究旨在确定该菌株的分类地位,为豌豆蚜生物防治提供真菌资源。【方法】对自然染菌的豌豆蚜虫尸上寄生真菌TF-2进行回接试验,分离纯化出致病菌株TF-2;在显微镜下配制TF-2菌株不同浓度孢子悬浮液,采用浸渍法和离体叶片饲养法测定其对豌豆蚜成虫的毒力;利用光学显微镜观察菌株形态学特征。PCR扩增TF-2的rDNA-ITS序列并测序,构建...
作者:麦艳珍; 申茹; 徐英辉; 冯白茹; 龙政传 期刊:《生物资源》 2019年第04期
龙门马岭灵芝种植基地成功将野生血芝驯化栽培,为了鉴定该驯化种的基源,从基地采摘了一株驯化血芝,分别通过观察样品的形态、大小、颜色等性状特征进行性状鉴定,观察菌管、菌丝、孢子等显微特征进行显微鉴定,采用内部转录间隔区(internal transcriptional spacer,ITS)序列分析手段进行分子鉴定。结果表明,样品的性状特征,及其菌管、菌丝、孢子的显微特征与《中国真菌志》中假芝属假芝(Amauroderma rugosum)特征描述相符;ITS序列分...
作者:郑云飞; 葛志文; 刘慧; 周建新; 邱伟芬 期刊:《中国粮油学报》 2019年第11期
采用传统培养法对湖南与湖北两省粮库中的稻谷进行研究,对高大平房仓粮仓上中下三层的稻谷霉菌量及优势霉菌进行研究。研究结果表明:湖南省储藏一年稻谷与新入库稻谷中层霉菌数分别为6.4×10^3 CFU/g、1.3×10^3 CFU/g,相比上、下层,中层最多;湖北省储藏一年稻谷下层霉菌数为1.4×10^4 CFU/g,相比上、中层,下层最多,湖北省新入库稻谷上层霉菌数为1.4×10^4 CFU/g,相比中、下层,上层最多。通过传统的菌落培养及菌丝、孢子观察,初步判断...
作者:刘长命; 张姣; 李彩云 期刊:《分子植物育种》 2019年第16期
为探明秦岭南麓不同生境野生萱草(Hemerocallis fulva)的分布情况及遗传多样性,本研究采用PCR直接测序法,对收集的22份萱草种质材料的核糖体DNA转录间隔区(nrDNA ITS)进行扩增及测序,结合GenBank中3个同属种类的ITS序列,对它们的ITS序列长度、GC含量以及变异位点进行比较分析,并以此构建系统发育树对其遗传多样性进行研究。序列比对结果显示,不同产地萱草的ITS序列长度为598~608bp,GC含量为67%~71%,共有457个变异位点。其中采自山...
作者:彭开松; 鲁子怡; 董昭然; 樊慧敏; 唐庆权; 许晓牧; 鲍传和; 朱若林; 熊大华 期刊:《安徽农业科学》 2019年第23期
[目的]从患病鱼类体内和体表分离鉴定出新型鱼源真菌,并用于抗真菌药物的体外药效评价。[方法]通过选择性固体培养基分离纯化鱼源真菌,经形态学和真菌ITS序列分子鉴定,采用微量肉汤稀释法测定10种渔用抗真菌药物的最小抑菌浓度(MIC)。[结果]黑鱼体表分离的真菌ZJLD001株为烟管菌(Bjerkandera adusta),鲫体表分离的真菌ZJLD002株为白囊耙齿菌(Irpex lacteus),虹鳟内脏分离的真菌ZJLD003株和ZJLD004株均为毛栓菌(Trametes hirsuta)。...
作者:陆娇娇; 畅瑛; 李波; 施碧红 期刊:《福建农业科技》 2019年第10期
灰黄霉素产生菌原始菌株4541和突变株D-756在形态与生理生化上具有很大差异。为了解两菌株的遗传背景差异,明确其系统发生关系,该研究分别克隆并测定了突变株D-756与出发菌株4541的ITS和18S rDNA基因序列,进行同源性分析并分别构建系统发育树。由ITS序列构建的进化树显示,突变株D-756及野生株4541与Genebank中的另外3株灰黄青霉、1株荨麻青霉菌株聚为一簇;由18S rDNA序列构建的进化树中突变株D-756、出发菌株4541与Genebank中的3株...
作者:朱; 爽; 周; 林; 杨梅宝; 黄宏靓; 孙悦; 曾常青 期刊:《广东药科大学学报》 2012年第01期
目的以核糖体转录间隔区(rDNA ITS)序列为分子标记,对1种华钩藤植物进行遗传分析与分子鉴定。方法通过改良CTAB法提取样品总DNA,利用通用引物对rDNA ITS序列进行PCR扩增,经克隆、测序后,运用Clustal X、BioEdit和PAUP等软件进行序列分析和构建系统发育树。结果测序得到样品的rDNA ITS区序列长度为719 bp,序列分析结果显示其与Genbank中已有的华钩藤[Uncaria sinensi(Oliv.)Havil.]rDNA ITS区序列之间相似性达99.4%,并且在系统...
作者:姜红霞; 杨成德; 薛莉; 蒲崇建; 陈秀蓉; 尚勋武; 李昌盛 期刊:《草业学报》 2013年第02期
本试验研究了马铃薯坏疽病的症状及病原形态等。结果表明,该病害在块茎上形成圆形、椭圆形或不规则形的凹陷病斑,病斑呈土黄色至淡紫色,大小约1~3cm,其中央有小黑点。从甘肃省采集到的马铃薯坏疽病26份标样中分离得到8个茎点霉属真菌分离物,经形态特征比对和致病性测定鉴定为同一种真菌分离物,且在症状特征、病原形态学、生化特征及ITS序列分析基础上鉴定该病原物为Phoma foveata;30%丙环唑.苯醚甲环唑、35%多菌灵磺酸盐、5%菌毒...
作者:代色平; 刘连海; 吴伟 期刊:《林业与环境科学》 2013年第04期
采用nr ITS和叶绿体基因间隔区trnL-trnF的序列,初步研究分布于广东省的野牡丹属的6个物种,即展毛野牡丹(Melastoma normale)、野牡丹(M.candidum)、多花野牡丹(M.affine)、细叶野牡丹(M.in-termedium)、地稔(M.dodecandrum)、毛稔(M.sanguineum)和1个原产印度的印度野牡丹(M.malabathri-cum)及其白花变种(M.malabathricum var.alba)的遗传关系。结果表明,展毛野牡丹、野牡丹、多花野牡丹、细叶野牡丹和毛稔这5个...
作者:马星霞; 蒋明亮; 覃道春; 吕文华 期刊:《竹子学报》 2009年第04期
从华北、华南和华中地区的9个省市地区采集变色发霉竹材和竹制品标本150份,分离、纯化得到117株竹材变色菌和霉菌,采用核糖体RNA基因的内转录间隔区序列的分子生物学方法结合传统的生物学特性观察,鉴定这些真菌分属于2门、2纲、4亚纲、10目、15科、22属、56种。主要变色菌和霉菌为子囊菌纲真菌,其无性型分别为木霉属、曲霉属、青霉属、镰孢属、链格孢属和球二孢属真菌。
作者:张午曲; 李海燕; 李宏博; 杭秋瑜; 朴钟云 期刊:《时珍国医国药》 2015年第04期
目的通过测定并对比白头翁、兴安白头翁、朝鲜白头翁和细叶白头翁4种白头翁属植物的Internal Transcribed Spacer(ITS)序列,为白头翁属植物的分子鉴定和遗传多样性研究提供依据。方法提取4种白头翁属植物的DNA,扩增ITS序列并克隆测序。利用Clustal X、DNAMAN、MEGA 5等软件分析白头翁属植物的ITS序列特征。结果建立了4种白头翁植物ITS全序列数据库,包括14个变异位点和4个信息位点。细叶白头翁与朝鲜白头翁之间的遗传距离最小,与...
作者:蒋向辉; 佘朝文; 许栋; 张青桦 期刊:《时珍国医国药》 2010年第12期
目的为便于准确鉴定七叶一枝花品种,控制药材质量,进行基于ITS序列的条形码构建研究。方法在对怀化野生七叶一枝花、大理重楼、华重楼及花叶重楼进行表型比较的基础上,进一步对ITS序列进行克隆测序,并用MEGA4.0软件进行聚类分析。结果供试种质表型相似,仅在植株高度,叶片数目,叶片形状与颜色等方面略有不同,怀化野生七叶一枝花ITS序列长为660 bp,GC含量为56%,聚类分析表明,与其他3个材料为重楼属同一个种。结论 ITS序列的长度在属...
作者:谭戬浩; 周林; 刁秀芹; 薛霭华; 朱爽 期刊:《时珍国医国药》 2012年第01期
目的以核糖体转录间隔区(rDNA ITS)序列为分子标记,对采集自3个不同地区的一般钩藤Uncaria rhynchophylla(Miq.)Jack.进行RFLP遗传分析,研究不同地理区域一般钩藤的rDNA ITS序列是否具有生物地理差异。方法通过改良CTAB法提取一般钩藤总DNA,利用通用引物对其rDNA ITS序列进行PCR扩增,并对连接转化后扩增得到的rDNAITS序列进行限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)分析。结果获得采集自广东...
作者:刘洋; 张弘弛 期刊:《山东化工》 2017年第20期
本研究利用体外清除DPPH自由基的方法,测定了5株杜仲叶部内生真菌的抗氧化活性。通过插片培养,性状观察,显微摄影和分子鉴定对抗氧化活性高的杜仲内生真菌进行了分类研究。研究表明,这些杜仲内生真菌对DPPH清除率具有剂量依赖性,其抗氧化能力随样品浓度的增加呈增长趋势。在浓度为0.5 g/m L时,其中对DPPH自由基清除率在95%以上的菌株有1株(EL05),经鉴定属于曲霉属。
对不同栽培区的25种普通枇杷品种以及7种枇杷属野生种的ITS序列进行扩增并测序,采用邻接法和最大简约法进行系统发育树的构建并对枇杷属内不同种间的遗传关系进行了分析。结果表明:枇杷属植物ITS序列ITS1+5.8S rDNA+ITS2总长度为592 bp或594 bp,长度变化发生在ITS2。所有样本的ITS1和5.8S rDNA长度一样,都是223 bp和168 bp;而ITS2为201 bp或203 bp。5种枇杷属野生种的ITS序列长度为594 bp,包括栎叶枇杷、大渡河枇杷、南亚枇杷、...
作者:陈曦; 李新臣; 宋小玲; 强胜; 戴伟民 期刊:《植物资源与环境学报》 2019年第03期
作者:方荣锋; 李浩浩; 张培及; 曹让; 杨淑慎 期刊:《生物工程学报》 2017年第12期
为丰富产紫杉醇植物内生真菌资源库,从曼地亚红豆杉Taxus media茎中分离得到一株产紫杉醇的内生真菌TMS-26。通过对TMS-26的发酵提取物进行高效液相色谱分析,发现其具有与紫杉醇标准品(4.545 min)相近的色谱特征峰。进一步通过液质联用仪检测发现,内生真菌TMS-26的发酵提取物中具有与紫杉醇标准品((M+Na)+=876)相近的质谱特征峰,表明内生真菌TMS-26能够产生紫杉醇。同时通过传统形态学分类鉴定方法和18S r DNA序列分析、In...
作者:李志红; 翟凤艳; 张永霞; 王迪; 邢登可; 鲁海菊; 刘英杰 期刊:《河南科技》 2019年第02期
为明确河南封丘金银花炭疽病病原种类,对采自封丘的金银花炭疽病病叶,依据柯赫氏法则进行分离、纯化、回接和再分离,证明获得的分离菌株是金银花炭疽病的致病菌.对其培养性状、在寄主上的形态特征及萌发方式进行观察,并对其rDNA-ITS序列进行分析,结果表明:致病菌株在PDA培养基上菌落呈白色,后期菌落中央颜色变暗,生分生孢子盘;分生孢子盘具黑色刚毛,分生孢子长圆柱形,两端钝圆,单细胞.核糖体DNA-ITS序列与GenBank数据库胶孢炭疽菌...
作者:孙芳芳; 聂迎彬; 马松梅; 魏博; 吉万全 期刊:《林业科学》 2019年第03期
【目的】基于nr DNA和cp DNA 2种基因,探讨中国同域分布的梭梭和白梭梭的物种分化,分析2种基因的单片段及其片段组合对2种植物的物种鉴别力,并分析生态位分化的程度及其对物种进化的影响,为梭梭和白梭梭的系统发育和谱系地理等研究提供基础数据。【方法】基于2个nr DNA序列(ITS2、ITS1-ITS4)和3个cp DNA非编码区序列(trn S-trn G、rps4和trn V),对古尔班通古特沙漠南缘同域分布的梭梭和白梭梭共30个个体进行序列分析;利用距离法(基...