作者:蒋利荣; 邓晰朝; 覃玥; 林华丽 期刊:《大众科技》 2019年第12期
目的:基于体外实验和分子对接研究枫杨抑菌活性及机制。方法:以枫杨果、树皮、叶为研究对象,分别研究其水提物和醇提物(70%乙醇)对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、伤寒沙门菌、化脓性链球菌、表皮葡萄球菌的抑菌活性,确定抑菌谱和最小抑菌浓度(MIC)。利用活性追踪方法,通过硅胶吸附色谱、薄层色谱等手段,分离单体化合物,并进行抑菌活性研究,选择PBP5、FabI、FabH、FtsZ4个抑菌关键蛋白靶点,利用Systems Dock Web Site软件进...
作者:文成当智; 张云森; 仁真旺甲; 才让南加; 贡保东知; 切尼项毛; 才让吉; 刚焕晨雷; 张艺 期刊:《中国药房》 2020年第02期
作者:郎爽; 闫艳韬; 刘畅; 杨锦; 王子健; 高增平 期刊:《中国现代中药》 2019年第11期
目的:筛选紫萁贯众中具有良好抗流感病毒神经氨酸酶(neuraminidase,NA)活性的化合物。方法:将紫萁贯众已分离得到的23个化合物与18种流感病毒神经氨酸酶进行分子对接,通过评价结合能、结合模式及发生相互作用的氨基酸等指标进行虚拟筛选,得到候选化合物,并通过神经氨酸酶抑制剂实验验证候选化合物抑制NA的活性。结果:候选化合物异银杏双黄酮对NA抑制作用较强,IC50值为(42.54±2.85)μmol·L^-1。结论:紫萁贯众中化合物异银杏双黄酮具...
作者:王书云; 孙富周; 孙义凡; 黄健; 王金辉; 杨宝峰 期刊:《药学学报》 2020年第02期
采用反复硅胶柱色谱、开放ODS柱色谱、重结晶和半制备型HPLC等方法,从维药格蓬脂的甲醇超声提取物中共分离得到8个三萜类化合物。根据波谱数据及理化性质鉴定了化合物的结构,分别为:3β,19α,21α-三羟基-12-烯-28-油酸(1)、苏门树脂脑酸(2)、3β,19α-二羟基-12-烯-28-油酸(3)、齐墩果酸(4)、3β,6β,19α-三羟基-12-烯-28-油酸(5)、19α-羟基齐墩果酮酸(6)、6α-羟基齐墩果酮酸(7)和3α,6α-二羟基-11R,12R-环氧齐墩果烷-28,13α-内酯(8),其中...
作者:庹浔; 饶博文; 徐霖霖; 刘昭清; 吕小兰 期刊:《分析试验室》 2019年第12期
通过荧光光谱法、紫外分光光度法以及分子对接技术探究邻苯二甲酸单乙基己基酯(MEHP)与人血清白蛋白(HSA)之间的相互作用及其作用机制。光谱学数据显示,MEHP诱导HSA内源荧光猝灭是因为两者间发生非辐射能量转移并形成稳定的复合物;不同温度下的热力学常数表明范德华力或氢键为MEHP与HSA结合的主要驱动力;三维荧光光谱结果证实MEHP改变了HSA的构象;同步荧光光谱和位点实验表明,MEHP在位点Ⅰ与HSA结合。根据光谱学的研究结果,采用分...
作者:付旭阳; 高丽; 吕宏; 侯秋丽; 陈金双; 孔令雷; 石瑞丽 期刊:《中国药理学通报》 2020年第01期
目的为探讨蒙药忠伦-5治疗类风湿关节炎的作用机制,进行了网络药理学研究。方法通过多种数据库获得蒙药忠伦-5单味药的成分及靶点信息,对这些靶点进行筛选,得到成分治疗类风湿关节炎作用的靶点,并对靶点进行分析在治疗类风湿关节炎中的意义。结果筛选得到蒙药忠伦-5治疗类风湿关节炎的靶点90个,网络分析结果表明蒙药忠伦-5参与126个生物过程,调节RAS、PPAR、自噬、JAK-STAT、肿瘤坏死因子等43条与类风湿关节炎密切相关的信号通路。...
作者:张天一; 徐苗; 丁欢; 田菲菲 期刊:《生命科学研究》 2019年第05期
持续感染高危型人乳头瘤病毒(human papilloma virus, HPV)会导致宫颈上皮细胞的细胞周期发生变化和免疫逃逸,最终导致宫颈癌。高危型HPV病毒的E6蛋白对抑癌蛋白p53的泛素化降解可被小分子化合物RITA (reactivation of p53 and induction of tumor cell apoptosis)和姜黄素抑制,使HPV阳性细胞被抑制的凋亡功能得以恢复,但这一现象的分子机制尚未得到阐释。本文选择HPV16和HPV18两种高危亚型,采用同源建模、分子对接和分子动力学模...
作者:周伟; 陈斯琴; 刘进兵 期刊:《合成化学》 2019年第12期
以苯乙酮与取代苯甲醛(1a~1e)为起始原料,在碱性条件下制得中间体查尔酮(2a~2e);在超声辅助下,合成了一系列硫代嘧啶酮类化合物(3a~3e),其中3a、3d和3e为新化合物,其结构经1 H NMR,13 C NMR,IR和MS(ESI)表征。研究了3a~3e对酪氨酸酶和α-葡萄糖苷酶的抑制活性及抗氧化活性。结果表明:4-(2-甲氧基苯基)-6-苯基-3,4-二氢嘧啶-2(1 H)-硫酮(3b)抑制酪氨酸酶活性最好,IC 50为0.676 mmol·L-1,与阳性对照曲酸相当。以3b为例进行了抑制酪氨...
作者:黄朝波; 徐晗; 杨明冠; 李贞景; 杨华; 王昌禄; 周庆礼 期刊:《光谱学与光谱分析》 2019年第10期
近年来,随着对红曲色素的深入研究,其越来越多的功能活性被发现,但其某些致毒作用也使红曲色素的安全性受到了质疑。因此,阐明红曲色素在人体中与大分子的相互作用对深入研究其转运代谢及毒副作用具有重要作用。光谱法是研究溶液中小分子与蛋白质相互作用的一种有效方法,其具有灵敏度高、选择性强、用样量少、方法简单等优点,在研究中得到越来越广泛的应用。为探究红曲色素在体内的转运机制和血液中与转运蛋白的相互作用,本研究首...
作者:汪华君; 乔晨; 赵蓉; 尹江宁 期刊:《南京中医药大学学报》 2019年第06期
作者:王存新; 许先进 期刊:《北京工业大学学报》 2019年第11期
基于分子对接的反向虚拟筛选方法在药物靶点确定、老药新用以及药物副作用/毒理研究领域具有重要的应用前景,吸引了药物发现领域研究人员的广泛关注.首先对分子对接方法和蛋白质数据库进行细致的介绍,然后列举目前可以用于反向虚拟筛选的网络服务器,并列举该方法在药物设计领域的一些具体应用,最后对该方法目前所存在的问题进行讨论.
作者:何田; 贾玮娟; 王弯弯; 王弘 期刊:《国际药学研究》 2019年第08期
目的研究和建立一种从天然产物中高效筛选14-3-3τ蛋白抑制剂的方法,并初步探讨所筛选活性化合物与14-3-3τ蛋白相互作用的位点。方法采用液相色谱-荧光分析方法对天然产物中具有14-3-3τ结合活性的化合物进行筛选研究,通过表面等离子共振(SPR)技术对筛选结果进行验证,再通过分子对接技术进行活性化合物的作用位点的预测,进而选择主要的结合位点,使用氨基酸定点突变体进行结合位点的验证。结果从82个备选天然产物中筛选出了17个不同类...
作者:韩晓英; 齐一璕; 齐万里; 王旭 期刊:《中药新药与临床药理》 2019年第11期
目的应用网络药理学方法研究骨碎补治疗骨质疏松的可能机制。方法收集和筛选骨质疏松相关靶蛋白、骨碎补有效活性成分及其对应靶蛋白,利用分子对接验证结合活性,构建并分析骨碎补-活性成分-靶蛋白网络、骨碎补活性成分-靶蛋白-信号通路网络及信号通路中靶蛋白交互网络。结果筛选得到7个活性成分及39个核心靶蛋白,其中5个活性成分与30个靶蛋白之间有较好的结合活性。富集分析该30个靶蛋白分别得到17条与成骨功能相关的信号通路、5条...
作者:徐焱; 刘中婷; 华炳乾; 庄文昌; 朱文友 期刊:《化工设计通讯》 2019年第10期
以16个2-氨基噻唑衍生物抑制剂为研究对象,利用AutoDock4.2软件进行了分子对接,分析抑制剂分子和细胞周期素依赖性激酶(CDK2)的结合情况。研究结果显示,活性中心残基Leu83主干上的羰基和氨基分别与抑制剂分子C9原子上的氨基和噻唑环上的N原子形成氢键,Glu81主干上的羰基和抑制剂分子C8上的氨基形成氢键,Phe80侧链上苯基和抑制剂母体分子上的苯基形成了π-π堆积作用,CDK2通过与抑制剂分子之间形成的氢键网络和π-π堆积作用将小分子固...
作者:柯志鹏; 张新庄; 曹泽彧; 曹亮; 王振中; 肖伟 期刊:《中国中药》 2019年第18期
骨质疏松症是一种以骨量减少、骨组织微结构破坏、骨骼脆性增加和易发生骨折为特征的全身性疾病。随着人口老龄化的日趋严重,骨质疏松症已成为一个全球性的问题。目前,临床上所使用的化学合成药物均存在一定的副作用,利用传统中药及其制剂治疗该病已成为新的研究热点。淫羊藿是传统中药中用于治疗骨质疏松症最常用的药材之一,其药理活性引起了全球范围的广泛关注。该研究采用网络药理学的方法,探讨淫羊藿治疗骨质疏松症的主要活性...
作者:王小凤; 申慧婷; 孙小玲; 于荣贤; 刘兵; 苏秀榕 期刊:《海洋与湖沼》 2019年第05期
作者:梁健钦; 林忆龙; 卢卓; 熊万娜; 陈丹丹; 陈基强; 黎芳 期刊:《中成药》 2019年第10期
目的基于网络药理学分析芒果苷对溃疡性结肠炎小鼠的作用机制。方法采用反向药效团匹配法预测芒果苷及其苷元的作用靶点,采用DDT和Drugbank数据库筛选溃疡性结肠炎相关靶点,通过String数据库构建蛋白互作分析,使用Cytoscape软件构建化合物-靶点、靶点-疾病靶点等网络,并通过MCODE插件进行聚类分析。利用String数据库进行GO和KEGG富集分析。最后采用Autodock Vina分子对接技术分析芒果苷对COX2的结合作用,再通过测定小鼠结肠组织COX...
作者:汪祺; 王亚丹; 杨建波; 刘越; 文海若; 马双成 期刊:《中国新药》 2019年第18期
目的:考察羟基芫花素对UGT1A1酶活性的影响,评价其肝毒性。方法:采用计算机分子对接技术考察羟基芫花素与UGT1A1酶的结合方式及亲和作用强弱;采用体外人肝微粒体抑制实验评价羟基芫花素对人源UGT1A1酶抑制作用强弱。结果:分子对接显示羟基芫花素对接进入UGT1A1酶蛋白F活性区,与底物胆红素对接活性区重合,但亲和作用较弱;体外抑制实验提示羟基芫花素对UGT1A1酶具有弱抑制作用,抑制类型为竞争型抑制,与分子对接结果一致。结论:羟基芫...
作者:张欣; 陈书曼; 吴楠; 王彤; 裴兴武; 江连洲; 韩翠萍; 于殿宇 期刊:《食品科学》 2019年第20期
将南极假丝酵母脂肪酶B(Candida antarctica lipase B,CALB)与三亚油酸甘油三酯进行分子对接,得到CALB的活性中心组成,其氨基酸残基中游离ε-NH2分布在远离活性中心的位置上,—COOH有小部分分布在活性中心.针对CALB活性基团的分布特点将MCM-41修饰成具有醛基的G-MCM-41及具有氨基的NH2-MCM-41.当G-MCM-41与CALB固定时,醛基与ε-NH2结合,酶负载量为87.4 mg/g,活性为1176 U/g,活性较高,当NH2-MCM-41与CALB固定时,氨基与—COOH结合,酶负...
作者:李英俊; 赵月; 靳焜; 高立信; 盛丽; 刘雪洁; 杨鸿境; 林乐弟; 李佳 期刊:《有机化学》 2019年第09期
合成了一系列新型含咔唑/苯并咪唑环的2,5-二取代-1,3,4-噻二唑酰胺衍生物.利用IR,1H NMR,13C NMR和元素分析对其进行了结构表征.评价了目标化合物对蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)和T细胞蛋白酪氨酸磷酸酶(TCPTP)的抑制活性,讨论了结构与活性的关系.实验结果显示,绝大多数化合物对PTP1B的抑制活性超过高度同源的TCPTP的抑制活性,其中2-(9-咔唑基亚甲基)-5-(3-氯苯甲酰氨基)-1,3,4-噻二唑(5c)对PTP1B的抑制活性最高[IC50=(2.43±0.43)μg...