作者:李笑; 谭朝阳; 徐德宏; 孟蕾 期刊:《安徽农业科学》 2020年第02期
DNA条形码技术是一种新兴的分子鉴定方法,它能弥补传统化学方法和形态学方法鉴定中药材的不足之处。通过查阅文献,在分析DNA条形码技术的原理、发展的基础上,对目前一些热门的DNA条形码候选序列ITS、ITS2、psbA-trnh、rbcL、matK展开讨论,重点分析其在植物类和动物类中药材鉴定中的应用,为中药材的鉴定提供新的思路。
作者:罗凌龙; 张弛; 邓博; 赵保胜; 张耀圣; 邵远洋; 晋小雁; 王学勇 期刊:《中国实验方剂学》 2020年第02期
目的:调查俄罗斯高加索、阿尔泰野外地区药用植物的分布现状,明确该地区药用植物的种类、功效信息,深入挖掘一带一路沿线国家地区的药用植物新资源、新功效。方法:在野外搜寻并采集药用植物制成蜡叶标本运回国,提取腊叶标本的植物总DNA,使用内转录间隔区(ITS)序列通用引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,PCR产物送双向测序,测序结果经软件进行拼接,根据美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库BLAST所获相似度最高物种的同属ITS序列,经...
作者:郑辉; 邓楷煜; 陈安琪; 付绍兵; 周德; 王威威; 倪典墨; 任瑶瑶; 周嘉裕; 廖海 期刊:《药学学报》 2019年第12期
基于ITS2与psbA-trnH条形码序列,对川贝母及其近缘种开展分子生物学鉴定与亲缘关系研究。本文在采用《中国药典》规定的PCR-RFLP鉴定方法对川贝母及其近缘种的鉴定基础上,扩增所有样品的ITS2及psbA-trnH条形码序列,对其遗传距离进行分析,构建进化树,评价ITS2及psbA-trnH条形码的鉴定效果,探讨样品的亲缘关系。结果显示,PCR-RFLP方法仅能将样品分为非酶切组(包括平贝母、浙贝母及伊犁贝母)与酶切组(包括浓蜜贝母、中华贝母、康定贝...
作者:郭丽民; 席进孝; 师占文; 张奋春; 姜海威; 白仲慧 期刊:《疾病预防控制通报》 2019年第06期
目的评价DNA条形码技术对基层鼠疫实验室鼠种鉴定的可行性。方法2016-2018年在平川区黄鼠疫源地采集鼠类样本,采用双盲法分别对每只鼠进行形态学鉴定和DNA条形码鉴定,比较两种方法的区别。结果平川区阿拉善黄鼠疫源地共采集鼠类174只,其中松鼠科2种、仓鼠科2种、鼠科1种、跳鼠科1种、沙鼠科1种、鼢鼠科1种和兔形目鼠兔科1种;174只鼠类COI序列所构建的进化树形成9个高度支持的分支,与形态学鉴定结果一致。结论DNA条形码分子鉴定方法...
作者:胡一凡; 张雪梅; 石乃星; 杨志清 期刊:《中草药》 2019年第24期
目的筛选与评价适用于云南草果居群的DNA条形码。方法以云南省草果种质资源为样本对ITS、psbA-trnH、matK、rbcL和ycf15条DNA条形码常用序列进行筛选与评价,并对草果居群进行扩增,测序,测序序列用Genestar进行拼接,然后用Mega进行数据处理,并对草果多样性及其鉴定进行分析。结果引物ITS5和ITS4对草果的扩增片段长度大约为520 bp;rbcLa-F和rbcLa-R对草果的扩增片段长度大约为498 bp;引物ycf1-bF和ycf1-bR对草果的扩增片段长度大约为...
作者:王荣亮; 段润平; 包丹; 白俊; 周宪民; 汪雁 期刊:《生物学通报》 2016年第04期
在生命科学研究中,物种识别和生物多样性评估是重要的基础环节。从基于形态学特征分类的经典分类学,到近来被分子分类学家广泛接受的DNA条形码,以及在高通量测序技术基础上衍生出的DNAmetabarcoding研究方法,人类正以前所未有的速度与深度重新认识生命世界。DNAmetabarcoding可快速、简便、有效地从多物种混合DNA样本中还原其中的生物类群及其居群结构,实现从物种的有效识别到生物多样性的评估。概述了DNA条形码与DNAmetabarc...
作者:王成业; 赵敏; 王金迪; 蒋筠雅; 何钊; 冯颖 期刊:《生物资源》 2018年第02期
蜻蜓是一类营养丰富且具有药用保健价值的可食用昆虫。目前蜻蜓在国内被食用的种类见诸报道的有红蜻(Crocothemis servilia)、角突箭蜓(Gomphus cuneatus)、舟尾丝蟌(Lestes praemorsa)、闪蓝丽大蜻(Epophthalmia elegans)、碧伟蜓(Anax parthenope julius)、小团扇春蜓(Ictinogomphus rapax)、大团扇春蜓(Sinictinogomphus clavatus)、黄蜻(Pantala flavescens)、赤褐灰蜻(Orthetrum pruinosum)、白尾灰蜻(Ort...
作者:胡子渊; 王兰蕊; 任国栋; 潘昭 期刊:《湖南师范大学自然科学学报》 2020年第01期
对广布于古北界的丽斑芫菁Mylabris(Chalcabris)speciosa(Pallas, 1781)进行了修订,包括:1)成虫形态再描述,并提供形态特征图和整体照;2)一龄幼虫描述及特征图;3)丰富地理分布信息,首次记录在中国西藏分布;4)提供河北和西藏标本的COI基因片段序列,丰富DNA条形码数据库。
作者:李渊; 张然; 宋普庆; 李海; 陈坚; 林龙山 期刊:《极地研究》 2018年第02期
南极鱼类是南极海洋生态系统的重要组成部分,在食物网的物质循环和能量流动中起着重要的作用。利用中国第32次南极考察暨中智第2次联合南极半岛综合科学考察采集Yelcho站周边海域南极鱼类,并基于形态学和DNA条形码技术对其进行种类鉴定。序列相似性结果显示仅2尾鱼类能准确鉴定到种,剩余6尾属于模糊种;结合Gen Bank中的同源序列对其进行系统发育分析,结果显示所有样品能明显分为4个组群,且各物种的最小种间遗传距离均高于该物种的...
作者:查琳; 王影; 杨怀雷; 徐芳菲; 李蕾; 谢丽娟; 郭畅冰; 曹志强 期刊:《人参研究》 2019年第06期
生物技术是一门应用生物科学研究成果以及工程手段增加数量和提高质量从而满足人类日益增长的对生物制品需求的技术。近年来,由于假冒伪劣人参属中药充斥市场,为控制其质量、保证临床用药安全和有效,应用现代生物技术对人参属药材鉴别具有重大的意义。
作者:杨浩博; 王瑜; 仲帅; 刘鑫; 宗成文 期刊:《延边大学农学学报》 2019年第03期
以长白山东方红林场和汪清兰家林场采集的笃斯越桔叶片为样本,采用PCR方法扩增psbA-trnH基因,与GenBank中的越桔属psbA-trnH序列进行对比分析,分析psbA-trnH基因序列在越桔属植物间的序列差异。结果表明:越桔属psbA-trnH序列遗传距离的范围区间为0.000~0.013,平均遗传距离为0.005。草地越桔共有3个有效鉴别位点,分别在第36碱基位的碱基为C,在第289碱基位插入了1段TATTCATTTTG碱基序列,在第398碱基位的碱基为T,蔓越桔共有2个有效鉴...
作者:韦乐华; 王思怡; 敖智广; 豆荣昆; 向飞丹州; 茆灿泉 期刊:《华西药学》 2019年第05期
目的对紫芸解毒止痛酊(ZYD)中的关键药材红花进行DNA条形码和HPLC化学质量控制,并探究羟基红花黄色素A(HSYA)在促骨髓间充质干细胞(BMSCs)细胞增殖中的作用。方法采用ITS2 DNA条形码技术鉴定中药材红花并分析其与近缘物种的序列差异;HPLC法测定5个批次的ZYD中HSYA的含量;CCK-8法测定BMSCs的细胞相对增殖率。结果 ZYD中红花的ITS2序列与NCBI数据库结果一致,系统进化树构建后发现其与近缘物种各自聚类成分支;5个批次的HSYA含量分别为...
作者:孙思雅; 方昀; 来梦茹; 葛宇清; 张光霁; 程汝滨 期刊:《中国中药》 2019年第22期
利用性状鉴别与DNA条形码联用的方法对药用海马棘海马进行系统研究,为棘海马快速准确的鉴定奠定基础。结合文献与样品观察获得的棘海马典型鉴别特征包括棘刺发达、短吻,具有单或双颊刺,育儿袋接壤的棘刺更加尖锐。提取棘海马和其他海马样品的基因组总DNA,对COⅠ和ATP6基因序列进行PCR扩增和双向测序,通过Blast对序列的准确性进行检验,利用MEGA 7计算序列的GC量,种内种间距离以及采用邻接法构建NJ系统发育树。结果显示,COⅠ序列和AT...
作者:姜雪萍; 陈艳君; 朱富成; 王芳; 孙传伯; 赵群 期刊:《园艺与种苗》 2019年第09期
通过DNA条形码ITS序列,探讨鉴别中药百合及其混伪品的有效方法。从GenBank下载了8种百合属(Lilium)、2种假百合属(Notholirion)和1种老鸦瓣属(Amana)物种的ITS部分核DNA序列。经过比对后,ITS序列长度为610 bp,G+C平均含量为60.1%。用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)和简约法(Maximum parsimony,MP)分别构建系统发育树。结果表明,百合药材的3种正品基源植物的单倍型在BI和MP 2种系统发育树中都各自聚类为单系,并不和其他混伪品的物...
作者:白霄霞; 沈风娇; 李志斌; 赵建成; 蒋淑磊; 石硕 期刊:《天津农业科学》 2019年第10期
杜鹃花属(Rhododendron L.)植物作为重要观赏和中药植物,市场前景广阔,发展潜力巨大。本文通过归纳杜鹃花属植物的分类、鉴定相关问题,发现利用DNA条形码可有效解决杜鹃花属植物(品种)的鉴定问题。基于杜鹃花属植物的具体情况,本文对序列参考数据库建设、分子标记开发以及杜鹃花品种的野生亲本溯源三方面内容进行综述,并结合GenBank中1311条杜鹃花属DNA序列及作者测序获得的463条序列,初步建立杜鹃花属DNA条形码数据库,并通过非加...
作者:王菲菲; 刘杰; 何风艳; 张南平; 何轶; 李静; 张聿梅; 郑健; 马双成 期刊:《药学学报》 2019年第11期
对薄荷属植物薄荷、胡椒薄荷、留兰香及其栽培变种进行性状鉴定、化学成分鉴定和分子生物学鉴定,比较不同分析方法对薄荷属植物鉴别结果的差异,以了解药用薄荷的基源情况,确保药用薄荷在临床中的正确使用。采用性状鉴别、GC-MS/MS测定挥发性化学成分和聚合酶链式反应(PCR)对22批次薄荷属样品进行分析,确定它们的种间归属情况。在性状鉴别中,"轮伞花序腋生"被认为是薄荷典型特征之一;在化学成分鉴别中,香芹酮可作为鉴别留兰香的指标...
作者:马丽杰; 吴云; 谷巍; 田荣; 周晨; 王帆 期刊:《中草药》 2019年第23期
目的应用ITS2条形码鉴定东北透骨草及其混伪品,为东北透骨草药材鉴定提供新方法。方法提取35份东北透骨草及其混伪品的基因组DNA,通过PCR扩增ITS2序列并进行双向测序,测序结果提交至GenBank;从GenBank下载13种东北透骨草及其混伪品ITS2序列42条;对提交与下载的77条序列,应用MEGA7.0软件进行序列比对,计算种内和种间遗传距离,构建Neighber-jioning(NJ)系统进化树,并预测ITS2二级结构。结果东北透骨草3种基原的种内最大K2P遗传距离均...
作者:韦健红; 吴文如; 喻良文; 林小桦; 李薇 期刊:《广东药科大学学报》 2010年第04期
DNA条形码技术是通过使用DNA序列对物种进行快速、准确识别的技术。目前在动物分类中最常使用的基因序列是线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(mtCOⅠ)。该技术的出现可以为研究物种的进化规律、遗传变异、系统发育以及生物多样性等提供理论依据。为了让更多非生物分类学研究者了解并将其应用于更多的领域,本文概述了DNA条形码技术的工作流程、技术特点以及在生物分类中的应用和对未来的展望。
作者:张彦帅; 许武杰; 赵紫阁; 陈玉菲; 张晓谦 期刊:《教育与装备研究》 2017年第11期
连翘与迎春花外形相似,不易区分。如果能从DNA分子水平上鉴定二者本质上的不同,将是对传统分类手段的补充。利用DNA条形码技术,对校园采摘的连翘与迎春花进行DNA提取、PCR扩增、双向测序,用软件进行序列拼接和数据分析,计算其种间、种内遗传距离,并构建NJ系统聚类树。结果显示连翘与迎春花的ITS2序列长度分别为227bp和225bp,迎春花种内无变异位点,连翘与迎春花的种间变异位点较多,种间K2P最小遗传距离大于其种内最大距离,NJ树显示...
作者:侯娟; 李天奇; 丁春喜; 刘钦梅; 张蓉; 黄健; 王金娜; 吴瑜燕; 龚震宇 期刊:《预防医学》 2019年第05期
目的利用DNA条形码技术鉴定浙江省常见鼠形动物。方法在浙江省嘉善县、龙游县、云和县和宁海县捕获野外鼠形动物,取鼠耳标本提取DNA,采用通用引物PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因测序。将测序获得序列与GenBank中的序列进行Blast序列同源性比对,采用邻接法构建分子进化树鉴定鼠形动物,并与传统形态学方法鉴定结果进行比较。结果共扩增出22份COI标本,其中18份标本构建的进化树与传统形态学鉴定结果一致;3份标本的鉴定结...