作者:刘兴凤(综述); 李洪(审校) 期刊:《西南医科大学学报》 2005年第06期
目前蛋白质组学的研究主要集中在不同细胞或组织表达的全部蛋白质在数据库的构建与细胞在不同状态下表达差异的研究上[1].随着比较蛋白质组学的发展,定量技术成为人们关注的热点.因此有人提出"定量蛋白质组学(quantitative proteomics)"的概念.定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定的一门学科[1].这一概念的提出标志着有关蛋白质的许多研究已从对蛋白质简单的定性向精...
作者:吴志鹏; 王三英; 章跃陵 期刊:《海洋科学》 2018年第03期
本研究以大黄鱼(Larimichthys crocea)肝脏为研究对象,采用比较蛋白质组学技术分析大黄鱼免疫保护后蛋白表达水平的变化。结果发现,对照组和免疫保护组中共有20个表达水平差异显著的蛋白点,经MALDI-TOF-MS分析,获得18个差异蛋白点肽质量指纹图谱(peptide mass fingerprint,PMF),通过数据库查询,与免疫型受体、新型抗原受体等蛋白具有高度同源性。在此基础之上,进一步选取4个蛋白差异点(1、10、14和18号)进行Westen blot验证。结果...
由郑州大学出版社出版发行的《动物组织器官再生的比较蛋白质组学研究》一书是国家新闻出版广电总局“十三五”规划重点项目,获得国家出版基金资助。全书以大鼠肝再生以及分布于我国的蝾螈(Orientalis)断肢再生、三角涡虫(Japonica)头尾再生为研究对象,检测和分析了再生相关蛋白在动物组织器官中再生的生理、生化作用,包括细胞生长、细胞发育、细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、细胞的物质运输、细胞迁移、糖类代谢、脂类代谢、氨基...
作者:朱薇; 马亚龙; 杨云 期刊:《包装学报》 2018年第01期
基于比较蛋白质组学的方法,筛选和鉴定了嗜酸热古菌A.manzaensis中与硫氧化相关的膜蛋白。首先利用温度诱导TritonX-114两相分离萃取技术分别对以单质硫(S0)和亚铁(Fe2+)为能源底物生长的A.manzaensis菌的膜蛋白进行选择性分离,再用聚丙烯酰胺凝胶电泳和双向电泳对所提取的膜蛋白作进一步分析,最后利用基质辅助激光解吸附电离飞行时间串联质谱对以S0为能源底物下的差异表达膜蛋白斑点进行鉴定,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术...
《动物组织器官再生的比较蛋白质组学研究》为国家新闻出版广电总局“十三五”规划重点项目,获国家出版基金资助,由郑州大学出版社出版发行。该套书包括上、中、下三卷,全精装四色印刷,总定价1800元,由吴祖泽院士作序,我国从事组织器官再生蛋白组学研究领域的专家和学者徐存拴、章静波、陈广文、张富春合著。该套书从动物组织器官再生的比较蛋白质组学角度,系统分析了大鼠肝再生、分布于我国的Orientalis蝾螈肢体再生、分布于我国...
作者:乐军; 刘丽蓉; 谢建平; 刘蓓; 梁莉; 王洪海 期刊:《中华微生物学和免疫学》 2004年第04期
目的研究结核分枝杆菌异烟肼耐药菌株与敏感菌株的蛋白质表达差异,鉴定结核分枝杆菌中与异烟肼耐药相关的菌体蛋白.方法应用双向电泳技术比较2株异烟肼耐药菌株与2株敏感菌株的全菌蛋白表达图谱差异,发现异烟肼耐药结核分枝杆菌表达量显著增加26个蛋白质斑点,通过基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪进行质谱分析,获得6个明确的肽质量指纹谱,通过蛋白质数据库进行检索分析.结果6个蛋白分别为海藻糖磷酸磷酸酶、铁钼蛋白A、莽草酸5...
作者:李明珠; 应天翼; 王恒樑; 张部昌; 冯尔玲; 王军军; 黄留玉 期刊:《微生物学报》 2005年第03期
将福氏志贺氏杆菌2a 2457T及其驱除侵袭大质粒pINV的菌株培养至对数生长中期,制备了全细胞蛋白质.用双向电泳分离两种细胞蛋白质混合物并进行比较,找出差异点,这些点经过胶内酶切后进行MALDI-TOF质谱鉴定.每个蛋白质点的肽指纹图谱都在福氏志贺氏杆菌2a 2457T株的蛋白质数据库用Mascot进行检索,共发现了10个差异表达的蛋白质.结果显示驱除大质粒后几个参与核酸代谢途径的酶表达量有所上升.其中胞啶/脱氧胞啶脱氨酶、嘌呤核苷磷酸化...
作者:吴双; 刘秀梵; 王晓泉; 朱善元; 王安平; 王永娟; 洪伟鸣; 左伟勇 期刊:《中国家禽》 2012年第21期
为验证新城疫病毒(NDV)入胞过程存在胞吞途径,本研究以感染了NDV的鸡胚成纤维细胞(CEF)为研究对象,采用比较蛋白质组学研究方法,双向凝胶电泳(2-DE)结合基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定技术(MALDI—TOF—MS)分析3株NDV感染CEF后24h和48h两个时间点细胞蛋白表达动态。试验结果显示早期内体标志蛋白早期内体抗原1(EEA1)表达水平变化显著,这表明NDV可通过胞吞途径进入细胞;与其它两株病毒相比,胞吞作用在TS-5—...
作者:孙宁宁; 高祥; 李玲霞; 宋丽娜; 李晓鸥; 王子健; 刘宁; 武利涛 期刊:《中国实验诊断学》 2014年第08期
肿瘤是由多重因素引起的复杂疾病,受多种基因的调控。基因的表达方式错综复杂,从mRNA表达水平并不能准确预测蛋白质的表达水平,蛋白质的动态修饰和加工并非必须受基因序列的调控。而且蛋白质是细胞功能的真正执行者,可以动态反映生物系统,肿瘤细胞的形成必然涉及蛋白质组的变化。因此,利用蛋白质组学技术研究具有临床应用价值的肿瘤生物标记物具有重要的意义。其核心研究思路是通过分析肿瘤细胞/组织等样品中的蛋白质组,寻找肿瘤患...
作者:唐雨; 刘艳霞; 刘俊康; 邓渝 期刊:《中国药业》 2017年第15期
目的应用比较蛋白质组学的方法,检测2种不同迁徙能力奇异变形杆菌变化显著的差异蛋白,为深入研究奇异变形杆菌的耐药性提供重要依据。方法采用LB培养基培养迁徙能力不同的内环与外环变形杆菌,通过菌落直径比值反映2种菌迁徙能力的差异;采用比较蛋白质组学的方法,检测2种菌总体蛋白表达差异,并着重分析差异明显的核糖蛋白各种类间的相互作用。结果内环菌菌落直径较小,外环菌菌落直径较大,其菌落直径比值为3.84±0.56;与内环菌相比,外...
作者:马亚龙; 刘红昌; 夏金兰; 杨云; 聂珍媛 期刊:《生物技术通报》 2016年第12期
以极端嗜酸热古菌(Acidianus manzaensis)为研究对象,基于比较蛋白质组学的研究方法筛选和鉴定了13个A.manzaensis胞外与硫活化相关的蛋白质基因,并从转录水平对其进行了验证。首先通过80℃缓慢摇动水浴30 min分别对A.manzaensis在单质硫(S0)和亚铁(Fe2+)为能源底物进行生长时的胞外蛋白质进行提取,并用双向电泳(2-DE)进行分离,然后选取在S0底物下差异表达的蛋白质斑点进行串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)鉴定和生物信息学分析及...
作者:程小华; 汪莹; 戚琴芹; 王娅妮; 赖童飞; 周婷 期刊:《食品科学》 2016年第17期
以金属含量、氨基酸组成、差异表达蛋白以及抗氧化酶活性为指标对江山白菇F21品系菇根的生化组成进行了分析。结果表明:与菇身相比,菇根中粗脂肪、铁、磷以及必需氨基酸中的亮氨酸和赖氨酸含量较低,而灰分、砷、钙和镁元素含量较高;通过菇根与菇身的比较蛋白质组学分析,共鉴定出9种差异表达蛋白,涉及双组分信号转导系统、乙酰辅酶A代谢、蛋白质合成、乙醛酸及二羧酸代谢、氮代谢多个生物学过程,同时菇根中的菇毒素含量显著低于菇...
作者:刘燕; 韦强; 鲍国连; 季权安 期刊:《动物医学进展》 2007年第11期
以双向电泳、生物质谱及生物信息学为主要技术支撑的蛋白质组学是蛋白研究强有力的技术手段。比较蛋白质组学在生物医学方面的研究重点在于对疾病的发病机制、早期诊断及治疗,对致病微生物的致病机理、耐药性及发现新的抗生素,揭示疫苗候选和免疫原性成分。文章对比较蛋白质组学相关研究技术方法与特点及其在生物医学研究中的应用进行综述。
作者:白晓卉(综述); 于修平(审校) 期刊:《医学综述》 2006年第17期
蛋白质组学作为后基因时代研究的一个重要内容,已广泛深入到生命科学和医药学的各个领域,尤其是比较蛋白质组学在疾病研究、治疗和制药中得到了更为广泛的应用、本又简要介绍了比较蛋白质组学的基本概念、研究技术和相关的研究现状。
作者:陈波; 郑建伟; 王剑明; 田俊; 王淳本; 邹声泉 期刊:《中华肝胆外科》 2007年第08期
目的 建立人胆汁蛋白质组双向电泳图谱,用于胆汁比较蛋白质组学研究。方法A、B两例胆汁标本分别取自于一例肝门部胆管癌及一例胆总管结石病人。标本经脱盐、脱脂、去除核酸纯化处理后,分别各取350μg以固相pH梯度等电聚焦(IEF)为第一向,SDS-PAGE垂直电泳为第二向进行双向电泳(2-DE)。应用图像分析软件对银离子染色的2-DE图谱进行图像分析。结果 经纯化处理的胆汁样本双向电泳图谱中的各个蛋白质点分离清晰,无明显的横向及纵...
作者:曾浩; 邹全明; 郭刚; 毛旭虎; 童文德 期刊:《中国现代医学》 2006年第13期
目的研究有氧胁迫下幽门螺杆菌(H.pylori)由螺旋体转变成球形体的适应性调节蛋白。方法运用双向电泳技术比较H.pylori螺旋体与球形体的全菌蛋白表达谱,差异蛋白进行胶内酶切,肽混合物使用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI—TOF—MS)进行质谱分析,将肽质量指纹谱数据输入互联网上的蛋白质数据库进行检索。结果获得6个与H.pylori球形体形成相关的适应性调节蛋白,即翻译延长因子Tu、丙酮酸-黄素蛋白氧化还原酶、...
研究不同生理和病理条件下细胞内蛋白质的含量和状态变化是比较蛋白质组学的核心内容。要揭示上述动态过程往往需要进行多个样品的同步比较分析。近年来,在体内和体外同位素标记基础上,用多维液相色谱分离多肽,进而用串联质谱进行相对定量的分析方法已成为高通量比较蛋白质组研究的主要手段之一。该文就目前唯一一种可以进行四重蛋白质样品同步比较的iTRAQ标记一串联质谱分析技术进行综述。
作者:刘新; 应万涛; 钱小红 期刊:《化学通报》 2007年第02期
比较蛋白质组学是指在蛋白质组学水平上研究正常和病理情况下细胞或组织中蛋白质表达变化,以期发现具有重要功能的生物标识物,为疾病的早期诊断提供依据。近年来它正成为蛋白质组学研究的热点和发展趋势。比较蛋白质组学的研究方法和策略有多种,本文就最近几年来稳定同位素标记技术(体内代谢标记技术和体外化学标记技术)在比较蛋白质组学研究中的进展进行综述。
作者:陈熙; 崔香菊; YING-XIN; ZHAO; 张炜 期刊:《生物化学与生物物理进展》 2006年第07期
采用蓝绿温和胶凝胶电泳(blue-nadve polyacrylamide gel-electrophoresis,BN-PAGE),以及改进的第二向SDS-PAGE分离了水稻低叶绿素b突变体ZH249-Y和野生型ZH249-W类囊体膜蛋白复合物,系统比较了突变体和野生型各复合物亚基的表达差异.结果显示,第一向BN-PAGE分离了PSI-LHCI、LHCI缺失的PSI、ATP合成酶、细胞色素b6f、CP43缺失的PSⅡ及LHCⅡ六种复合物.上述各复合物经第二相SDS-Urea-PAGE分离后,利用胶内酶解,高效液相层...
作者:申定珠; 李家邦; 叶川; 凌江红; 马国添; 叶仁群; 黄国栋; 蒋荣鑫 期刊:《世界华人消化》 2007年第04期
目的:筛选胃溃疡复发相关的蛋白质,进一步揭示胃溃疡复发的分子机制. 方法:以乙酸制备胃溃疡模型,并用IL-1β诱导复发.采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离胃溃疡复发大鼠胃溃疡处组织及正常大鼠相应处胃组织的总蛋白质,图像分析识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)得到相应的肽质量指纹图(PMF),搜索数据库鉴定蛋白质. 结果:获得分辨率较高、重复性较好的胃溃疡复发大鼠和正常大鼠...