作者:刘彦英; 倪珊珊; 项蕾蕾; 孙雪丽; 陈裕坤; 赖钟雄 期刊:《果树学报》 2020年第01期
【目的】研究香蕉中miR408b及其靶基因Chemocyanin在低温胁迫下的表达模式和调控机制。【方法】以三明野生蕉和‘天宝蕉’叶片为材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆获得三明野生蕉中的MiChemocyanin基因(MiCHY)和‘天宝蕉’中的MaChemocyanin基因(MaCHY),利用在线网站对MiCHY进行生物信息学分析。【结果】MiCHY基因的cDNA全长为587 bp,开放阅读框381 bp,编码126个氨基酸蛋白,具有Plantacyanin结构域,属于超铜氧化还原蛋白家族。在ORF区...
作者:胡方志; 杜强; 袁利花; 韦鹏飞; 苏莹; 王志龙; 陈秋红 期刊:《分子植物育种》 2019年第24期
ATG12蛋白参与调控植物体内自噬途径的发生,在自噬小体的形成过程中发挥重要作用。为研究水稻OsATG12基因的功能,本研究克隆到该基因的全长CDS序列,长度为282 bp,编码93个氨基酸。OsATG12为亲水性蛋白,具多个磷酸化位点,无跨膜结构和信号肽,预测定位于细胞质,具有APG12_C结构域。进化树分析表明该蛋白与短药野生稻的ATG12蛋白的亲缘关系最近。组织表达谱检测结果表明,在水稻幼苗中,OsATG12基因在根中表达量最高,在茎中基本不表达;...
作者:理挪; 林思祖; 张健; 张家君; 吕蒙; 陈宇 期刊:《分子植物育种》 2019年第24期
类固醇5α-还原酶(DET2)是BR生物合成的限速酶,是调控油菜素内酯生物合成的关键基因。为了了解油菜素内酯(BR)生物合成途径中限速酶DET2的作用,本研究以杉木低涩籽率家系L为材料,采用RTPCR法从杉木中克隆获得一个转录因子基因并命名为ClDET2。分析发现,该序列包含一个长度为840 bp的CDS基因序列(开放阅读框),编码215个氨基酸,系统进化树分析显示,ClDET2与NCBI数据库中注释的北美云杉DET2基因亲缘关系最近。通过对ClDET2基因在种子发...
作者:李丹; 陆俊杏; 鲁庚; 唐鑫; 张小梅; 张涛 期刊:《西北植物学报》 2019年第12期
紫苏是目前发现的α-亚麻酸含量最高的药食同源经济作物,其种子油脂中含60%以上的α-亚麻酸。该研究基于紫苏转录组测序结果,从紫苏种子中克隆获得植物种胚发生过程中的关键基因Leafy Cotyledon 1(Pf LEC1),并对其进行相关生物信息学分析、实时荧光定量PCR以及不同时期种子的脂肪酸含量测定,以探讨紫苏α-亚麻酸高效合成积累的分子调控机制。(1)序列分析结果表明,Pf LEC1基因编码区长度为621 bp,可编码206个氨基酸,属于NF-YB亚基家族,...
作者:黄汉唐; 徐玉; 佘文琴; 潘东明; 潘腾飞 期刊:《西北植物学报》 2019年第12期
为了探究CmCAD基因在‘三红蜜柚’果实发育过程中的作用与表达规律,该研究以‘三红蜜柚’果实为材料,利用反转录PCR技术克隆获得3个‘三红蜜柚’CmCAD基因,分别命名为CmCAD1、CmCAD3和CmCAD4。对这3个基因所编码的蛋白进行了生物信息学分析,研究了它们在不同品种蜜柚及‘三红蜜柚’果实生长发育阶段的表达模式。结果表明:克隆得到的3个CmCAD基因cDNA长度分别为1 032 bp、1 080 bp和1 071 bp,编码344、360和357个氨基酸;生物信息分...
作者:郑汉; 虞慕瑶; 濮春娟; 陈美兰; 李福全; 申业; 黄璐琦 期刊:《药学学报》 2020年第01期
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase, HMGR)是萜类甲羟戊酸途径(mevalonic acid pathway, MVA)上的第一个限速酶,是细胞质中萜类代谢途径中的重要调控位点。本研究以5种化学型的香樟(Cinnamomum camphora)作为实验材料,基于转录组数据,从香樟cDNA中克隆出2个HMGR基因,分别命名为CcHMGR1 (GenBank登录号:MN163055)和CcHMGR2 (GenBank登录号:MN163056)。基因包含开放阅读框(ORF)分别为...
作者:邵晨冰; 黄志楠; 白雪滢; 王云鹏; 段伟科 期刊:《中国农业科学》 2020年第05期
【目的】鉴定辣椒HD-Zip基因家族,并利用生物信息学方法系统分析其在基因组中的分布、基因结构、进化分化特征及在不同组织中的时空表达特异性,解析该家族的进化特征及生物学功能。【方法】根据已报道及PlantTFDB数据库中的拟南芥HD-Zip序列,利用本地BLAST工具在我国辣椒测序品种‘遵辣1号’基因组中比对,并利用Pfam、SMART工具进一步验证。采用EMBOSS Programs、MEGA、GSDS、MEME、MCScanX、OrthoMCL、Circos等软件预测辣椒HD-Zip...
作者:张树伟; 彭宏祥; 潘介春; 李鸿莉; 秦献泉; 朱建华; 李冬波; 徐宁; 侯延杰; 邱宏业; 李平; 王金英; 丁峰 期刊:《广西植物》 2020年第01期
’GLL-1’为’禾荔’中选育出的一个优质晚熟芽变新种质。为探讨’GLL-1’果实成熟期延迟的遗传基础,该研究以’禾荔’和’GLL-1’为实验材料,克隆花色素苷合成途径结构基因LcUFGT,并对其进行生物信息学预测及分析,同时通过qRT-PCR对LcUFGT基因在果实发育不同阶段的表达进行研究,分析LcUFGT的表达对突变体果实发育速度的影响。结果表明:(1)LcUFGT基因ORF长1359 bp,编码453个氨基酸,推测蛋白质分子量约为50.16 kD。(2)序列比对发现...
作者:侯朔; 高燕会; 童再康 期刊:《农业生物技术学报》 2019年第12期
作者:邹杰; 李生强; 刘显军; 陈刚 期刊:《农业生物技术学报》 2019年第12期
乙烯应答因子(ethylene responsive factors,ERFs)是一类植物特有的转录因子,在植物的生长发育和逆境胁迫响应中起重要调控作用。为了研究水稻(Oryza sativa)OsERF103基因(Gen Bank No.XM015768788)的功能,本研究利用生物信息学方法对其序列特征进行分析;构建了p BWA(V)HS-OsERF103-Glosgfp融合表达载体并转化水稻原生质体,通过激光共聚焦显微镜观察融合蛋白在水稻原生质体的亚细胞定位;利用q RT-PCR技术对该基因在水稻不同组织及...
作者:黄冠榕; 熊世勤; 赵秋辉; 王银银; 任芳丽; 叶雄俊; 常智杰 期刊:《中国生物化学与分子生物学报》 2005年第02期
将人源Sef蛋白胞内区编码序列与GST融合构建原核表达质粒进行重组蛋白的表达与纯化并制备多抗.在COS-7细胞中转染表达hSef显示,其分子量分别为80 kD,100kD,比体外翻译的分子量偏大,提示可能有糖基化存在.Northern印迹的结果表明,hSef mRNA主要分布在人肾和睾丸组织.RT-PCR检测到hSef mRNA在众多细胞系有广泛存在.免疫组化的结果显示,hSef蛋白在人肾和睾丸及相应癌组织表达水平较高.
作者:王晓旭; 曾敏浩; 吕庆博; 邱鸿宇; 常巧呈; 王春仁 期刊:《黑龙江八一农垦大学学报》 2019年第06期
组织蛋白酶L2(CathepsinL2,CatL2)存在于片形吸虫发育的各个时期,具有潜在的免疫保护性及诊断性。为了获得片形吸虫"中间型"("intermediate form"of Fasciola,Fsp)CatL2基因的重组蛋白,根据GenBank中公布的肝片形吸虫组织蛋白酶L2基因设计特异性引物,应用RT-PCR获得虫体的FspCatL2基因,经TA克隆后,进行测序及生物学分析;进一步构建原核表达重组质粒PET-28a(+)-FspCatL2,在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行诱导表达,将纯化后的蛋白进行SD...
作者:隋娟娟; 邓红祥; 杨京霞; 孙晶晶; 屈长青 期刊:《基因组学与应用生物学》 2019年第10期
肉桂醇脱氢酶(CAD)是木质素生物合成的关键酶之一,为探讨肉桂醇脱氢酶基因在香椿抵抗非生物胁迫方面发挥的作用,本研究从香椿转录组数据中筛选并克隆得到1个CAD基因,其开放阅读框为1068 bp,共编码355个氨基酸,结构域分析发现香椿CAD蛋白含有1个NADP(H)辅酶结构域,2个Zn结合位点,系统进化树分析表明香椿CAD与柑橘CAD1亲缘关系最近,将其命名为TsCAD1。实时荧光定量PCR结果显示,TsCAD1在香椿幼苗根中的表达量显著高于茎与叶中的表达量...
作者:徐智诚; 刘斐斐; 汪桂玲 期刊:《基因组学与应用生物学》 2019年第09期
SOX基因家族是一系列在性别分化、胚胎发育、细胞多功能性的维持等方面具有重要作用的转录因子,在高等脊椎动物中研究比较深入,但在淡水珍珠蚌中却很少见。本研究利用RACE法克隆获得了三角帆蚌SOX2基因的序列,其cDNA全长为1840bp,开放阅读框为672bp,编码氨基酸223个。该基因具有SOX基因家族典型的HMG-box蛋白结构域,与其他物种对比发现,保守性极高。实时荧光定量PCR组织表达结果显示,在斧足中表达量最高,在肝脏中最低,同时发现雌雄...
作者:王静宇; 陈晓慧; 申序; 徐小萍; 张梓浩; 林玉玲; 赖钟雄 期刊:《热带作物学报》 2019年第10期
为了解龙眼RNA甲基化相关基因的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析方法,进行龙眼基因组RNA甲基化相关基因成员鉴定,蛋白结构域及特性分析,分子进化树分析,体胚发生过程和组织器官基因表达水平分析以及ABA处理下的定量表达分析。结果显示:龙眼中有7个参与RNA甲基化过程中的关键基因,包括5个RNA甲基转移酶基因和2个去RNA甲基化酶基因;各成员内含子数量差别较大,为4~28个不等;进化树分析显示,龙眼RNA甲基转...
作者:许烨琦; 王龙龙; 徐宁; 喻飞; 王浩; 吕利群 期刊:《广西科学院学报》 2019年第03期
为进一步开展草鱼Ⅲ型呼肠孤病毒外衣壳蛋白VP38的生物学功能研究准备实验材料,同时探讨并构建一种草鱼Ⅲ型呼肠孤病毒的免疫学检测方法。实验构建了VP38的原核表达质粒pET28a-VP38,转化至BL21感受态细胞后利用IPTG(Isopropyl β-D-Thiogalactoside)诱导表达,8 mol/L尿素溶解重组蛋白后免疫小鼠,制备鼠抗VP38多克隆抗体;利用制备的抗体探究Grass carp reovirus 104(GCRV-104)感染后VP38在翻译水平的表达动力学;利用Western blot、间...
作者:袁秀云; 田云芳; 张燕; 马杰; 崔波 期刊:《中国油料作物学报》 2019年第06期
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)是调控植物种子中蛋白质/油脂含量比例的关键酶。利用RT-PCR和RACE技术,从油用牡丹(Paeonia ostii)叶片中克隆得到1个PEPC基因PaPEPC2(GenBank登录号为MK606450)。其cDNA全长为3201 bp,包含2898 bp开放阅读框,编码965个氨基酸。PaPEPC2编码蛋白分子量为110.3 kD,理论等电点为5.65,属于酸性亲水性蛋白;二级结构预测表明,该蛋白的主要结构为α螺旋和不规则卷曲。氨基酸序列比对和进化树分析表明,PaPEPC2...
作者:杨方慧; 夏丽飞; 孙云南; 陈林波; 田易萍; 宋维希; 梁名志 期刊:《西南农业学报》 2019年第10期
【目的】进一步了解AGL9转录因子基因的功能,以及该基因对茶树花器官形成与发育的作用。【方法】前期研究茶树正常花与不育花转录组差异时,筛选出一条与AGL9基因高度同源的基因序列,设计特征引物进行PCR扩增验证AGL9基因并对其生物信息学特征进行分析,同时运用qRT-PCR分析AGL9基因的特性表达。【结果】经验证AGL9基因含有1个726 bp的开放阅读框,编码242个氨基酸,预测分子量为27.67 kD,理论等电点为8.96,命名为CsAGL9。Blastn分析序...
作者:刘晓柱; 李银凤 期刊:《南方农业学报》 2019年第09期
【目的】分析拟南芥糖运输载体蛋白基因(AtSWEET4)启动子序列及其编码蛋白的结构,并检测病原菌胁迫下AtSWEET4基因的表达特性,为研究AtSWEET4蛋白在拟南芥生长发育和生物胁迫中的作用机制提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析AtSWEET4基因启动子序列及其编码蛋白的结构,并采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)组织染色法检测人工接种菜豆晕疫病菌(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola,Psp)NPS3121和丁香...
作者:唐秀华; 孙威江; 洪瑶新; 谢凤; 陈佳佳; 陈志丹 期刊:《福建农林大学学报·自然科学版》 2019年第06期
采用实时荧光定量PCR技术检测不同叶色茶树嫩梢中花青素合成相关基因的表达水平,并比较各基因表达水平的差异.结果表明,桂皮酸-4-羟化酶(C4H)、类黄酮-3'-羟化酶(F3'H)和花青素合成酶(ANS)等结构基因在紫化茶树品种(系)的相对表达量显著高于白化茶树和常规绿叶茶树.紫化茶树因富含花青素呈紫红色,因此可推测C4H、F3'H和ANS等基因可能正向调控茶树花青素的合成与积累.