作者:魏日凤; 赖建东; 彭成彬; 张承康; 连玲丽; 刘伟 期刊:《茶叶科学》 2020年第01期
应用cDNA-AFLP技术筛选炭疽菌(Colletotrichum sp.1)危害诱导茶树毛蟹品种(Camellia sinensis cv. Maoxie)的差异表达基因,为探究茶树抗炭疽菌的分子机制奠定基础。利用256对选择性扩增引物组合分析病菌接种后0 h和48 h的叶片cDNA,经筛选、测序和BLAST比对获得136条差异表达片段(TDFs)。同源基因功能分析结果表明,128条TDFs与Nr数据库已有基因同源,其功能以胁迫响应、生物调控与信号转导为主;其中51条TDFs与TPIA数据库中冷害、干旱...
作者:蒋德梅; 蔡志华; 赵婉婷 期刊:《生物学通报》 2007年第05期
简述了AFLP分子标记的原理、方法、特点和应注意的问题,QTL检测的方法和QTL定位的策略:综述了AFLP分子标记技术在经济动物中QTL定位方面的应用现状和前景。
作者:袁支红; 江昌俊; 戴银; 胥振国; 杨书运; 张莉 期刊:《生物学通报》 2008年第08期
利用cDNA-AFLP方法在转录水平上对茶树无性系龙井43种子脱水前后基因表达的变化进行分析,探讨脱水差异和生物学中的衰老与死亡的联系,并为茶树等顽拗型种子植物的种质资源保存提供理论依据。结果显示:64对引物组合产生87条差异条带,对其中的6条克隆测序,发现4条与已知功能基因相关,包括植物衰老蛋白、PPR、硫氧还蛋白,翻译控制肿瘤蛋白,其中硫氧还蛋白在茶树种子中首次被发现。
作者:杨淑红; 张瑞粉; 孙淑云 期刊:《河南林业科技》 2009年第02期
介绍了AFLP分子标记技术的基本原理及特点。对目前AFLP分子标记在杨树遗传育种中遗传多样性和亲缘关系分析,遗传图谱的构建,基因定位和克隆,种质资源和品种鉴定等领域的广泛应用进行了综述,展现出广阔的前景。
作者:滕彩珠; 刁英; 易继碧; 宗刚琼; 陈永波; 韩永华; 胡中立 期刊:《生物资源》 2006年第04期
利用AFLP技术对13份魔芋种质资源进行了DNA多态性分析。从10对引物中筛选出2对引物扩增基因组DNA,共获得112条带,其中64条为多态性标记,每个引物平均提供56个标记信息。UPMGA法聚类分析结果表明:魔芋资源的遗传多态性比较丰富,西盟魔芋和珠芽魔芋的关系比较近,白魔芋和花魔芋的关系比较近。
作者:聂佩显; 于树增; 陈浪波; 薛晓敏; 王金政 期刊:《山东农业科学》 2019年第10期
以‘国光’及其芽变材料为试材,利用AFLP技术采用4对引物对其进行初步鉴定,并对果实品质和果皮色泽进行对比分析。结果表明:‘国光’芽变材料在平均单果重、果实大小、可溶性固性物含量、果皮着色指数方面,均极显著优于母株;4对引物组合共扩增出283条条带,多态性条带65条,多态性条带比率为37.36%,差异化片段大部分集中在100~400bp,其中引物E75/M54多态性比率最高,达71.79%,具有较高的应用价值。
作者:李秀诗; 周祥; 李志芳; 黎青; 杨成龙; 周明强; 付瑜华 期刊:《南方农业学报》 2019年第09期
【目的】分析贵州及其邻省薏苡种质的遗传多样性,为薏苡种质资源的保护、遗传改良及创新利用提供理论依据。【方法】利用AFLP标记对来源于贵州及其邻省的141份薏苡种质进行遗传多样性分析及聚类分析。【结果】6对AFLP引物组合从141份薏苡种质中共扩增出830条清晰的条带,其中多态性条带为742条,多态性比例为89.40%,平均每对引物组合扩增多态性条带123.67条,有效等位基因数(Ne)为1.35~1.50,平均1.44;Nei’s遗传多样性指数(H)为0.21~0...
作者:王婧泽; 高树仁; 于洋; 孙丽芳; 王霞 期刊:《玉米科学》 2019年第05期
以耐盐玉米自交系'M-2导入系'为试验材料,采用224对引物组合利用cDNA-AFLP(complementary DNA-amplified fragment length polymorphism)技术,分析玉米在4个不同浓度的盐胁迫诱导下的基因表达差异,对其差异片段回收测序。结果表明,成功回收测序其中的71条TDFs(transcript-derived fragments)。用NCBI BlastX对测序结果进行比对分析,49条TDFs与已知蛋白功能基因有较高的同源性,涉及光合作用、细胞信号转导、胁迫响应、细胞代谢等多...
作者:梁宁; 刁亚瑞; 刘公社; 刘杰 期刊:《草业学报》 2007年第02期
羊草是我国北方草原群落重要的建群种和优势种。本研究应用AFLP(扩增片段长度多态性)的方法研究了4个羊草自然群落的遗传结构。应用8个引物组合,共得到489个AFLP带,从85到550bp,结果表明,1)4个群落的遗传多样性和平均多态条带百分率有相似的趋势,即W(锡林浩特)〉H(海拉尔)〉D(大庆)〉J(长岭)。2)用非加权配对算数平均法(UPGMA)聚类分析的结果表明,同一种群的个体亲缘关系近,而在不同种群之间经向基因流较纬向...
作者:卢秉国; 申艳红; 蒋际谋; 陈晓静; 陈伟; 吕柳新 期刊:《热带亚热带植物学报》 2009年第06期
分别提取‘红核子’龙眼(Dimdcarpus longan Lour.)谢花后35d(早期)和50d(晚期)子叶胚RNA,建立cDNA—AFLP分析体系,获得指纹图谱。对41个差异片段回收克隆和序列分析,表明其中21个与已知功能基因具有高度同源性,这些基因的功能主要涉及侧生器官的离轴极性、糖酵解、能量代谢、离子转运、细胞壁伸长、细胞周期调控、RNA转录、RNA翻译和调控、蛋白磷酸化调控和降解、信号转导等;其余片段与已知基因的同源性较低或没有。
作者:毛常丽; 吴裕; 张凤良; 何美莹 期刊:《热带亚热带植物学报》 2019年第01期
为了解云南省硬核[Scleropyrum wallichianum(Wight et Arn.)Arn.]的遗传多样性,采用AFLP标记分析了7个居群84份种质材料的遗传变异。结果表明,从64对引物组合中挑选出多态性较好的引物8对,共扩增出1 728条带,其中多态性条带1 388条,多态性百分率为80.14%。硬核在物种水平的多样性指数分别为Na=1.416,Ne=1.179,H=0.137,I=0.225,在居群水平上分别为H=0.111,I=0.175;在遗传相似性系数为0.52时,这些种质材料可分为3组,其中易武居群具...
作者:张莹; 冉洪; 冯云; 张韫; 胡陶; 郭起荣 期刊:《热带亚热带植物学报》 2016年第06期
为了解毛竹(Phyllostachys edulis)种下类型的遗传关系,对花龟竹(P.edulis‘Mira’)、斑毛竹(‘Porphyrosticta’)、安吉锦毛竹(‘Anjiensis’)、麻衣竹(‘Exaurita’)、黄皮毛竹(‘Holochrysa’)、绿槽龟甲竹(‘Lücaoguijiazhu’)、孝丰紫筋毛竹(‘Purpureosulcata’)等7个新近发表的种下类型进行了AFLP分子标记分析。结果表明,采用筛选的8对引物组合共扩增了1728条条带,多态性条带百分率达98.77%,检测到多态性位...
作者:李娜; 杨鹰; 万洁; 韦雷飞; 钟金城; 武志娟; 姜雪鸥; 张利亚 期刊:《家畜生态学报》 2013年第02期
研究采用随机片段长度多态性分析了攀西地区的5个黑山羊品种(类群)的遗传多样性。结果表明:15对引物共扩增出1003条多态条带,多态频率平均为99.01%,5个黑山羊群体的遗传多样性指数变异范围为0.0136~0.2131,其中建昌黑山羊平均遗传多样性指数最高(0.1346),攀枝花黑山羊次之(0.1329),乐至黑山羊最低(0.1101)。5个群体遗传距离范围为0.0062~0.0281,攀枝花黑山羊与建昌黑山羊之间的遗传距离最小(DR=0.006...
作者:赵静; 单雪松 期刊:《家畜生态学报》 2004年第04期
AFLP是一种新的分子遗传标记技术,它结合了RFLP和PCR技术的优点,具有RFLP的稳定性和PCR的高效性,被称为"最有威力的分子遗传标记"或"下一代分子标记".相对于国外而言,我国在这方面的研究还比较少.本文综述了扩增片段长度多态性(AFLP)这种遗传标记的原理、技术特点、技术发展及其在动物遗传多样性、种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育种等研究中的应用.
作者:籍新波; 张连成; 韩宏伟; 张军; 王进茂 期刊:《林业与生态科学》 2012年第02期
以10份刺槐种质资源为试材,通过对影响AFLP反应体系关键因素的优化,建立了刺槐AFLP分析的反应体系,即15ng/μ/L模板DNA在37℃下双酶切(MseI、EeoRI各0.15U/μL)2h,0.075U/μL T4DNA连接酶连接12h,连接产物、预扩增产物稀释10倍后扩增效果最佳。并利用该体系筛选出引物E+3/M+3,构建了刺槐种质资源的AFLP指纹图谱。
作者:秦贺兰; 贾宗锴; 张西西 期刊:《林业与生态科学》 2010年第04期
采用AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)技术对小菊花色芽变品种与原始品种的DNA进行差异性分析,旨在建立芽变品系形态学以外的分子水平鉴定技术。在引用13对引物中,每对引物平均扩增出13.5条多态性带,分子量在110~800bp之间。3对引物组合(第8对E-ACG/M-CAT、第10对E-AGG/M-CTC、第11对E-AGG/M-CTG)产生5条清晰特异性条带可以将二者区分,这些特异性片段可能包含引起花色芽变的基因序列,经计算,二者遗传相似系数为0...
作者:田晓俊; 温强; 汪信东; 杨青; 江香梅 期刊:《林业工程学报》 2009年第03期
以闽楠、红楠总基因组DNA为模板,对AFLP分析各环节的条件进行了优化和筛选,建立了适合于闽楠、红楠AFLP分析的最佳反应体系。其中:酶切反应条件为在20μL反应体系中,加入模板DNA 150ng,Buffer22μL,BSA0.2μL,EcoRI 3U,MseI 2U,37%酶切4h,65℃变性10min,4μ保存;连接反应条件为将酶切产物中加入5μL连接体系(包括T4 Buffer2.5μL,EcoRI接头5pmol,MseI接头50pmol,T4连接酶1U),16℃连接过夜。预扩增反应条件为在20μL...
作者:冯涛; 郭佳; 仪军玲; 李彦明; 彭建雄; 裴黎 期刊:《山西警察学院学报》 2009年第01期
扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism, AFLP) ,是一种常用DNA指纹技术。该技术原理简单,引物设计巧妙,既具有RFLP技术的可靠性又具有RAPD技术的高效性,被称为最有力的分子标记。本文简述了原植物——大麻的特点和常规检测方法以及AFLP分子标记的基本原理、技术流程、优彳匕措施和在其他植物领域中的应用,并对其在法医学的应用前景进行了展望。
作者:巫旗生; 曾志南; 宋传福; 宁岳; 陈朴贤 期刊:《渔业研究》 2012年第06期
应用AFLP分子标记技术对福建东山和广东阳江褐毛鳞养殖群体进行了遗传多样性分析。采用6对选择性引物组合对2个群体60个个体进行扩增,共扩增出313个位点,多态位点85个。东山和阳江褐毛鳞养殖群体的多态位点比例、Nei’s基因多样性指数、Shannon遗传多样性指数分别为24.60%和25.56%、0.0795和0.0768、0.1210和0.1176,2个群体的遗传多样性均处于较低水平。遗传分化系数Gst及AMO.VA分析表明,2个群体的遗传变异主要来源于...
作者:池小妹; 庄勇 期刊:《时珍国医国药》 2011年第05期
目的研究建立一套适合于喀西茄的AFLP技术体系。方法比较CTAB法和改良CTAB法提取DNA的效果;设置不同浓度梯度的引物、dNTPs和Mg2+,优化选择性扩增体系。结果改良CTAB法提取的DNA质量优于CTAB法,加入50 ng/μl的两种引物各1.0μl,2 mmol/L dNTPs 2.4μl和25 mmol/LMg2+1.6μl的选择性扩增体系最优。结论建立了适合于喀西茄的AFLP技术体系。