首页 期刊 基因组学与应用生物学 黄花蒿转录因子AαWD40的克隆 【正文】

黄花蒿转录因子AαWD40的克隆

作者:王聪慧; 王秋军; 王剑文 苏州大学药学院; 苏州215123
黄花蒿   生物信息学分析   组织表达分布  

摘要:黄花蒿(Artemisia annua L.)是菊科(Asteraceae)蒿属似rtemis湖一年生草本植物。WD40转录因子基因与植物叶片表面腺毛发育、次生代谢相关。本研究利用RACE技术从黄花蒿中克隆出AαWD40基因(GenBank登录号:KY411922),并对其进行了生物信息学分析。AαWD40基因的cDNA全长1498bp,其中5’末端非翻译区为209bp,3’末端非翻译区为183bp。开放阅读框(0RF)的长度为1106bp,编码368个氨基酸残基,DNAMAN分析预测其等电点为4.64,分子量为41.29kD。对AαWD40氨基酸序列进行同源性分析,发现其与多种植物具有较高的同源性。生物信息学分析发现AαWD40氨基酸序列含有4个典型的WD40重复区域,符合WD40基因的特征,所以命名为AOWD40。利用Swiss-Model对AaWD40蛋白进行三级结构分析,AaWD40蛋白空间结构错综复杂,与多种植物WD40空间结构域非常相似。系统发育树分析AaWD40与其他WD40均源于同一祖先,并且AawD40与DpWDR、GhTTG4的亲缘关系最为接近。荧光实时定量PCR分析显示,AαWD40在根、茎、叶中都可以检测到表达,其中根的表达量最高,其次为叶,再次为茎。本研究为进一步研究AαWD40与黄花蒿次生代谢的关系提供了理论基础。

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